鼻腔灌洗液外泌体circRNA测序

时间:2022年01月05日 来源:

近年来众多文献报道,肺病细胞分泌的外泌体中富含多种蛋白质并促进肺病的发发展,是早期诊断肺病的有效途径。有研究发现,NSCLC患者肺组织外泌体表面EGFR免疫染色呈阳性的占80%,而慢性肺炎组织的外泌体EGFR呈阳性的只占2%,因而认为外泌体的EGFR蛋白可以用作NSCLC与慢性肺炎鉴别诊断的生物标志物。Park等通过Sys-BodyFlu-id数据库分析发现153种特异性胸腔积液外泌体蛋白质,进一步的Western blotting分析显示多种特异性胸腔积液外泌体蛋白参与EGFR信号传导途径以促进种瘤的发发展,因此外泌体蛋白可能作为肺病诊断筛查的生物学标记物。外泌体是细胞分泌囊泡的一种亚型,存在于生物体液中,并参与多种生理和病理过程。鼻腔灌洗液外泌体circRNA测序

l 慢病毒介导CD63-GFP表达:将外泌体的特定蛋白CD63和绿色荧光蛋白GFP的表达元件构建成质粒再包装到慢病毒中,随后用此慢病毒传播细胞,使细胞分泌的外泌体带有绿色荧光。外泌体功能研究:将标记的外泌体加入受体细胞培养基中,与受体细胞进行共培养,观察细胞的功能变化,如细胞增殖、迁移与侵袭、细胞凋亡等;或者将外泌体注射入动物模型中,观察动物表型变化和检测动物相关指标。外泌体(exosomes)是一种能被机体内大多数细胞分泌的微小膜泡,具有脂质双层膜,直径大约为 30-150 nm。外泌体普遍存在并分布于各种体液中,携带和传递重要的信号分子,形成了一种全新的细胞-细胞间信息传递系统,影响细胞的生理状态并与多种疾病的发生与进程密切相关。鼻腔灌洗液外泌体circRNA测序外泌体由细胞分泌释放出来,在血液等体液内传播,然后又可被其他细胞吞噬,是细胞间通讯的重要介质。

除了RAB蛋白,外泌体中富含具有外泌体膜交换以及融合作用的膜联蛋白(包括膜联蛋白1、2、4、5、6、7、11等)。外泌体膜上富含参与外泌体运输的四跨膜蛋白家族(CD63, CD81 和CD9))、热休克蛋白家族((HSP60, HSP70, HSPA5, CCT2 和HSP90以及一些细胞特异性的蛋白包括A33(结肠上皮细胞来源)、MHC-Ⅱ(抗原提呈细胞来源)、CD86(抗原提呈细胞来源)以及乳凝集素(不成熟的树突状细胞)。其它一些外泌体中的蛋白包括多种的代谢类的酶(DH, 烯醇化酶 1, 醛缩酶 1, PKM2, PGK1, PDIA3, GSTP1,DPP4, AHCY, TPL1, 抗氧化蛋白, P4HB, LDH, 亲环素 A,FASN, MDH1 和CNP)、核糖体蛋白(RPS3)、信号转导因子(黑色素瘤分化相关因子, ARF1, CDC42, 人类红细胞膜整合蛋白, SLC9A3R1)、粘附因子(MFGE8、整合素)、细胞骨架蛋白以及泛素等。

全自动外泌体荧光检测分析系统能够在单个外泌体样本上检测多达4种标记物,并同时提供外泌体的其它表征数据诸如计数、颗粒尺寸统计等。建议在表征外泌体和外囊泡时,应当同时测量表面和载体蛋白。使用ExoView芯片可穿透外泌体,探测膜内蛋白和载体。并且单次可定量3种表面、管腔蛋白。全自动外泌体荧光检测分析系统只测量含有靶标抗原的特定细胞外泌体群体。只需35 μL的稀释样品,即可直接获得外泌体的表型、粒径和计数信息。并且无需担心污染物对测试的影响。外泌体给后续实验产生了许多障碍。

目前,提取外泌体的方法主要有超速离心法、PEG沉淀法,但这些方法混有非常多的杂质,必须慎重分析得到的是否是外泌体。超速离心法存在操作繁杂、回收量不稳定,不能用于定量分析、必须使用昂贵的超速离心机、无法进行多样品分析等问题。因此外泌体研究相对困难,需要尽快开发操作简单、可提取高纯度外泌体的技术。因此,日本和光着眼于巨噬细胞的外泌体受体Tim4蛋白,制备Tim4细胞外域与磁珠结合的“Tim4磁珠”。Tim4通过磷酯酰丝氨酸(PS)法特异性结合Tim4蛋白和磁珠,再经过含有EDTA的洗脱缓冲液进行分离,提取高纯度的完整外泌体。外泌体在化疗药物的促转移过程中具有重要的作用。鼻腔灌洗液外泌体circRNA测序

外泌体复杂的内容物被认为是疾病诊断的无创或微创生物标志物。鼻腔灌洗液外泌体circRNA测序

一类外泌体中常见的细胞质蛋白是Rabs蛋白,是鸟苷酸三磷酸酶(GTPases,)家族的一种。它可以调节外泌体膜与受体细胞的融合,有文献报道称RAB4,RAB5和RAB11主要出现于早期以及回收的核内体中,RAB7和RAB9主要出现于晚期的核内体。现有大量的研究发现外泌体中含有40种RAB蛋白。除了RAB蛋白,外泌体中富含具有外泌体膜交换以及融合作用的膜联蛋白(包括膜联蛋白1、2、4、5、6、7、11等)。外泌体膜上富含参与外泌体运输的四跨膜蛋白家族、热休克蛋白家族。其它一些外泌体中的蛋白包括多种的代谢类的酶、核糖体蛋白(RPS3)、信号转导因子(黑色素瘤分化相关因子,ARF1,CDC42,人类红细胞膜整合蛋白,SLC9A3R1)、粘附因子、细胞骨架蛋白以及泛素等。鼻腔灌洗液外泌体circRNA测序

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