嘉兴基因疗法载体拷贝数技术

数字PCR（DigitalPCR），数字PCR的基本原理是将含有核酸分子的反应体系分成成千上万个纳升级的微滴，其中每个微滴或不含待检核酸靶分子，或者含有一个至数个待检核酸靶分子，且每个微滴都作为一个duli的PCR反应器。经PCR扩增后，采用微滴分析仪逐个对每个微滴进行检测，有荧光信号的微滴判读为1，没有荧光信号的微滴判读为0（因此该技术被称为“数字PCR”），较终根据泊松分布原理以及阳性微滴的比例，分析软件可计算给出待检靶分子的浓度或拷贝数（无需标准曲线的绘制）。载体拷贝数就是某种质粒在单个细菌中的数量。嘉兴基因疗法载体拷贝数技术

在细菌细胞中，某种特定基因的数目。一般检测方法有若是测序结果，可选用censor软件检测相关拷贝数。Southernblot是一种常用的DNA定量的分子生物学方法。其原理是将待测的DNA样品固定在固相载体（硝酸纤维膜或尼龙膜）上，与标记的核酸探针进行杂交，在与探针有同源序列的固相DNA的位置上显示出杂交信号，通过检测信号的有无、强弱可以对样品定性、定量，从而计算出转入的拷贝数。Southern法准确性高、特异性强，但存在费时费力的缺点。另外，由于 Southern 法检测不经过靶片段的扩增（ PCR ），一般每个电泳通道需要 10-30 μ g 的 DNA ，在实际操作中就需要较大量的植物材料来提取 DNA ，而转基因植物的愈伤组织在无菌条件下经过筛选、重新分化后一般都比较细弱，不宜大量取样。如果外源基因在插入时发生基因重组，造成限制性酶切位点丢失， Southern 法也无法检测到。这些因素都制约了 Southern 法在 T 0 代转基因植物中检测外源基因拷贝数的应用。温州AAV载体拷贝数报告腺相关病毒(AAV)载体的生物分析。

质粒的接合转移与穿梭质粒质粒的接合转移：是细菌遗传物质转移的一个重要方式。在质粒转移过程中，供体菌和受体菌通过结合作用紧密接触，质粒从供体细胞向受体转移，同时进行质粒复制。按能否自主转移，可以将天然存在的质粒分为转移型质粒和非转移型质粒两大类。这里要注意的是，获得质粒的细菌可随之而获得一些生物学特性，如耐药性或产生细菌素的能力等。从环境友好出发，实验室里的废弃菌液，一定要灭过菌才能倒哦。穿梭质粒：是指一类人工构建的具有两种不同复制起点和筛选，因而可以在两种不同类群宿主中存活和复制的质粒载体。此概念不仅用于不同的微生物菌群之间，也可以推广到真核生物表达载体的构建，如用于枯草的pBE2、酵母的pPIC9K、哺乳动物表达载体pMT2和用于植物细胞的Ti质粒。这些穿梭质粒不仅可以在大肠杆菌中复制扩增，也可以在相应的枯草、酵母、动物或植物细胞中扩增和表达。这样利于对质粒的分子生物学操作和大量制备。

致瘤性的风险:考虑产品特征，所使用整合性载体(如逆与产品的储存、运输和分配有关的风险（如保存、冷冻和解冻过程）、冷链或其他类型受控温度条件被突破的风险、与产品稳定性有关的风险，这可能会影响CAR-T细胞的生物学活性进而导致治疗失败。与产品活性相关的风险与产品活性有关的风险如T细胞jihuo引起的CRS、ICANS等。与患者基础疾病（或潜在疾病）或与合并使用其他药物的相互作用相关的风险。发生有害的免疫原性反应及其后果（包括过敏反应、产生中和抗体等）。与患者自身情况相关的风险（如移植物抗宿主病、恶性liu）。对患者或供者细胞进行预期和非预期基因修饰有关的风险（如细胞凋亡、功能改变、恶性liu）。CAR-T细胞产品中的转基因拷贝信息(载体拷贝数(VCN))对于保证患者安全至关重要。

为促进及早发现此类风险并提供有效地风险控制措施，本指导原则在借鉴ICHE2E药物警戒计划、《药物警戒质量管理规范》和国内外风险管理计划相关指导原则的基础上，列举了CAR-T细胞zhiliao产品可能存在的安全性风险，以及常规和本类产品特异的额外药物警戒活动和风险较小化措施。CAR-T细胞zhiliao产品的风险识别应尽早开始，并在整个研发过程中持续进行，以在可能的情况下预防、较小化风险。随着对风险认知的变化，应及时更新风险管理计划。本指导原则包括CAR-T细胞zhiliao产品申报上市临床风险管理计划的结构和内容，重点就撰写CAR-T细胞zhiliao产品风险管理计划时的特殊考虑进行描述，CAR-T细胞zhiliao产品申报上市临床风险管理计划还应参考ICHE2E、《药物警戒质量管理规范》以及我国药品监管机构发布的有关技术指导原则。随着技术的发展和相关研究数据的积累，本指导原则也将适时进行更新。为什么构建载体时要选择高拷贝数的质粒载体?江苏病毒载体拷贝数政策

严谨型质粒每个细胞中拷贝数有限,大约 1 ～几个;松驰型质粒拷贝数较多,可达几百。嘉兴基因疗法载体拷贝数技术

人工构建的质粒载体分类：高拷贝数的质粒载体，ColE1、pMB1派生质粒具有高拷贝数的特点。适合大量增殖克隆基因，或需要大量表达的基因产物。低拷贝数的质粒载体，由pSC101派生来的载体特点是分子量小的拷贝数。它有特殊的用途：当有些被克隆的基因的表达产物过多时会严重影响寄主菌的正常代谢活动，导致寄主菌的死亡时，就需要低拷贝的载体。失控的质粒载体，这是一类温度敏感型复制控制质粒。如pBEU1、pBEU2。插入失活型克隆载体。载体的克隆位点位于其某一个选择性标记基因内部。如pDF41、pDF42。正选择的质粒载体，直接选择转化后的细胞。只有带有选择标记基因的转化菌细胞才能在选择培养基上生长。嘉兴基因疗法载体拷贝数技术