安徽10x空间转录组

本文利用空间转录组学研究了在AD小鼠模型中，淀粉样斑块周围直径为100mm的组织域中发生的转录变化。发现了富含髓鞘和少突胶质细胞基因（OLIGs）的基因共表达网络的早期改变，而斑块诱导的基因（PIGs）的多细胞基因共表达网络涉及补体系统、氧化应激、溶酶体和炎症，在疾病的后期非常突出。此外作者通过对小鼠和人脑切片进行原位测序（ISS），证实了大多数观察到的细胞水平的变化。空间转录组学分析为探究AD和其他脑部疾病致病特征附近失调的细胞网络提供了可能。分享欧易生物在空间转录组样本处理、实验和数据挖掘上的成功经验，助力各位科研工作者取得新的突破。安徽10x空间转录组

空间转录组的应用有哪些？一、构建空间转录组图谱：借助于空间分辨的单细胞转录组学，建立图谱可能是在分子水平上研究生物体结构的重要步骤。目前的多项研究通过单细胞转录组技术结合空间转录技术，得到多个***的时空转录组图谱（相关研究后续会在如下专辑更新）。二、描绘胚胎发育和空间蓝图：胚胎发育是一个复杂的过程，其中动态变化在生物分子水平上迅速发生。对这种微观变化的时间和空间方面的分析都具有挑战性。预期使用空间转录组学技术可以表征胚胎发育的空间表达蓝图。安徽10x空间转录组Cell上发表了一篇利用空间转录组解析人鳞状细胞*的文章。

近日，欧易生物合作客户中国科学院上海营养与健康研究所冯英研究组合作在先进科学（IF 16.806）发表通过单细胞转录组测序揭示Myf5衍生细胞的异质性以及其缺失SRSF2后肌源性命运改变的相关结果，郭若晨博士为文章***作者，上海营养与健康研究所冯英研究员，济宁医学院出生缺陷研究与转化协同创新中心陈瑞蛟研究员为该论文的共同通讯作者。欧易生物提供了该项目的单细胞转录组测序和分析，文章特别致谢了欧易生物巴永兵和李炼在单细胞分析中提供的帮助。

人类细胞图谱项目的主要目标之一是描述所有细胞类型的空间关系。同时基于表达特征对多种细胞类型进行空间映射，有助于研究不同细胞类型之间的相互作用。已经发展了一些策略来检测单细胞分辨率的空间基因表达谱，如Slide-seq、seqFISH或MERFISH。为了更有效地为研究群体探索空间基因表达数据，我们构建了SpatialDB数据库用于空间解析的转录组。

人类细胞图谱项目极大地推动了单细胞水平的生命科学研究。空间转录组学技术的发展和空间基因表达数据的快速积累是未来的发展趋势。我们将继续收集新的技术和数据集来更新SpatialDB。此外，我们将整合更多的工具和数据源来分析数据. 空间转录组是一项前沿技术，涉及到很多细节方面的准备工作。

美国脑计划启动的 BICCN 项目，该项目将整合不同类型细胞的分子、解剖学和生理学特性，创建小鼠脑细胞 3D 参考图谱，同时也将基于人类和非人类灵长类脑组织样本，绘制脑细胞参考图谱 ，其涉及空间转录组学技术主要包括 MERFISH 和 seqFISH。一些实现空间转录组学的重要技术，可以追溯到二十世纪七十年代，长期以来，各种形式的原位杂交技术（ISH）已用于可视化空间中的基因表达。从技术原理中不难看出，空间转录组技术重要为特殊的载玻片。通过空间转录组技术可获取组织中具体的位置转录信息，为研究和诊断提供有效数据支撑。安徽10x空间转录组

10X Genomics 继单细胞测序后也推出了空间转录组测序技术。安徽10x空间转录组

在上一篇中我们介绍了利用10×Genomics空间转录组平台研究植物样本时，从样本包埋到玻片染色的基本实验流程。本文中，小欧针对实验流程中**为关键的步骤——切片和贴片实验中的一些操作小技巧进行了整理，希望能帮助大家更好地开展植物空间转录组学的项目研究。切片完成后并不意味着整个切片过程就结束了，如何把样本切片又快又好的贴到玻片上，尤其是正式玻片的特定有效捕获区域内，也是确保后续实验顺利进行的关键问题。对于动物样本，虽然有些疏松结缔组织或脂肪组织样本在切片时也会出现易破碎的现象，但对于大部分比较致密的结构组织样本，切片和贴片相对比较容易，对组织修片（调整组织大小）也相对简单些。但对于植物组织样本而言，则需要关注到更多操作细节。安徽10x空间转录组

上海欧易生物医学科技有限公司位于联航路1188号25幢。公司业务涵盖科研服务，科研检测，学术研究，技术咨询等，价格合理，品质有保证。公司从事医药健康多年，有着创新的设计、强大的技术，还有一批专业化的队伍，确保为客户提供良好的产品及服务。欧易生物立足于全国市场，依托强大的研发实力，融合前沿的技术理念，飞快响应客户的变化需求。