上海地区宏基因组高通量测序NGS

时间:2022年08月19日 来源:

16s/18s/ITS微生物分类测序,项目介绍:环境微生物是自然界中分布建议广、种类建议多、数量比较大的生物类群,其群落结构及多样性和微生物的功能及代谢机理是微生物生态学的研究热点,对于我们研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源的利用以及人类医疗健康有着重要的理论和现实意义。随着高通量测序技术的发展以及大量序列数据的积累,通用引物扩增结合高通量测序技术,可以快速检索环境内微生物的群落结构。这项运用我们称之为微生物分类测序。如Illumina公司的MiSeq高通量测序平台不仅可实现对多样品的多个可变区同时测序,而且在测序速度和测序通量上都有进一步提升,目前此平台已在微生物多样性群落结构研究方面受到了广大学者的认可。如果是水体样品,建议采用滤膜过滤后,将滤膜寄送来生工。上海地区宏基因组高通量测序NGS

土壤样本请置于2 mL离心管里(多准备几管备用),为保护样本管,样本管置于保护用的50 mL离心管或其他类似容器里,并旋紧盖子;如常温采的样品,可以采用蓝冰运输;如果是高温发酵罐或者样品已经冻存-80°C,需要用足量干冰运输; DNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好,并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里,并旋紧盖子;蓝冰运输;RNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好,并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里,并旋紧盖子;用足量干冰运输。 上海地区宏基因组高通量测序NGS请提供电泳胶图,浓度>20 ng/μl,总量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA,可冰袋运输,不超过3天。

全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序,其研究主要包括3个方面:第一种为不参考任何现有序列从头组装测序,是对未知基因组序列的物种进行基因组测序,并综合利用不同测序技术和生物信息学工具对研究物种进行序列拼接和修正,进而获得该物种的基因组序列图谱;第二种为常见的全基因组重测序,是对已知基因组序列的物种进行个体或群体的测序研究,建立一个测序文库进行单个个体或不同个体混合池测序,发现遗传变异标记,进行后续的研究;第三种是在已有参考基因组序列图谱的基础上,对不同品种的具有代表性个体建立多个文库进行全基因组从头组装测序,此方法能够进一步的进行参考基因组的修补和发现短序列比对难以发现的遗传变异。生工生物拥有众多生物信息分析人才,可进行专业的项目分析,为客户提供个性化服务。

生工CHIP-Seq,项目介绍:CHIP-SEQ 技术,即染色质免疫共沉淀与高通量测序相结合的技术。它是研究体内蛋白质与DNA 相互作用的有力工具,还可以用来研究转录因子与基因表达的关系。通过高通量测序,可以一次性得到目的蛋白在整个基因组上的结合分布,得到目的蛋白精确的结合位点以及结合基序等信息。ChIP-Seq 的原理:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA 的所属片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA的片段进行高通量测序,将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA 区段信息。单细胞转录组测序指在单细胞水平上对 mRNA 进行高通量测序和分析的技术。

如果你的样品是质粒或者是菌液,那为什么不试试我们的KBSeq呢?准确、迅速,可以说是KBSeq的代名词了,关键是还可以省钱,估计这是很多小伙伴们一定会说,你这个服务单价可比Sanger贵多了,怎么可能会省钱呢?Sanger测序的价格:常规的一代测序基本上要每800 bp就测一个反应,那我们来算一下14000/800=17.5,那基本上就要测18个反应了,按照现在生工官方的价格区间,这个属于反应数在10-49个反应之间的,那每个反应的价格为26元,这样算下来18*26=468元,还要加上引物合成的费用,实验周期的话大概率是要超过15天的。KBSeq全质粒测序的价格:序列长度属于6-15 kb之间,159元,实验的周期大概在5-7天左右。PacBio Sequel/RSII 该测序平台读长超长,平均可达10 kb以上。上海地区宏基因组高通量测序NGS

RNA样品建议用足量干冰运输。上海地区宏基因组高通量测序NGS

全转录组测序(Total RNA-Seq),项目介绍:全转录组是指特定细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(non-coding RNA)。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作用的miRNA,lncRNA和circRNA。基于二代测序技术的全转录组测序研究,同时分析同一样本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA,并且通过关联分析,使研究内容更加系统化,致力于深入挖掘生命现象背后的转录调控问题。组织样品或者总 RNA, 样品名称清晰,干冰运输。上海地区宏基因组高通量测序NGS

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