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二代测序辅助建库
目前靶向测序建库方法包括扩增子方法,在均相溶液中,当扩增引物增加时,由于扩增引物之间的相互作用,从而影响扩增的效率;如果将其分散到大量微液滴中扩增,将可降低引物间相互作用,提高扩增效率。同时还可以实现对于少量模板的有效扩增,得到更多的有效测序数据。
CRISPR-Cas9基因编辑结果验证
CRISPR-Cas9技术的发明,是基因编辑技术的一大突破,但如何验证实验是否成功,仍需要高灵敏度的检测方法,数字PCR技术可以满足这一需求。Broad研究所张锋团队发明了以CRISPR为基础的SHERLOCK技术可以对核酸进行高灵敏度的定性检测,但精确定量评估时仍采取了数字PCR进行确认。 正压生成油包水的液滴。无锡广州永诺数字PCR代理商
同时,从公式也可以看出,随着反应阳性体系数(X)的增加,体系中目标分子的拷贝数相对于X会有较大的差距,随着X的持续增加,数字PCR结果的不确定度也随着提高,总体来说,数字PCR阳性体系的数量不得超过总体系数量的80%。另一个方面,N的增加会使整个数字PCR体系具有较大的线性范围,并可以提高反应的灵敏度、稳定性以及可重复性。因此,目前dPCR都需要在成本可控的情况下,增加分配的腔室数和液滴数。
商业化dPCR平台及其特点
发展到现在,市面上常见的dPCR主要有两种:微滴式dPCR(droplet dPCR,ddPCR)和芯片式dPCR(chip dPCR,cdPCR)技术。由于芯片式dPCR制造芯片的成本较高,目前微滴式dPCR正越来越受到企业的认可。 无锡广州永诺数字PCR代理商单细胞研究:测序、PCR。
**个体化诊疗
通过检测T790M位点突变情况,可以更好地评估一代TKI***的疗效及耐药情况并指导第三代TKI靶向药Osimertinib的使用。然而,由于qPCR平台ARMS检测技术的灵敏度有限,没有办法在含大量EGFR基因野生型背景核酸中高效准确的检测到T790M突变。这个时候dPCR技术展现出了****的检测精度,此外,dPCR***定量的优势也能充分发挥出来了,可以监控突变含量变化,做到及早发现耐药。
2.)基因表达分析
伊马替尼(Imatinib)可以有效帮助很多慢性髓细胞白血病(CML)患者延长生存期,但是临床上发现,伊马替尼的疗效与BCR-ABL1融合基因的转录产物表达量有很大的关系。研究人员采用dPCR对CML患者的BCR-ABL1融合基因转录产物进行测定,结果检测下限可以达到0.001%,显示出dPCR在痕量核酸检测方面比qPCR具有无可比拟的优势
数字PCR通过将一个样本分成几十到几万份,分配到不同的反应单元(微滴),包含一个或多个拷贝的核酸分子(也就是说我们所说的 DNA 模板) ,这是与PCR或qPCR反应比较大的区别,PCR或qPCR只在一个反应体系中进行,而数字PCR在每个反应单元(微滴)中都会对目标分子进行扩增,扩增结束后统计荧光信号并分析。是不是听起来特别高(yi)大(lian)上(meng)?举个栗子,PCR或qPCR检测突变像是在大海里捞一个会发光的针,周围都是海水,很难看到针的光在哪,而dPCR就像把海水盛到好多个碗里面,瞧一眼很容易就知道哪个碗在发光了,而且,系统还会数出来到底有多少个碗里是发光的,多少个碗里是没发光的,这样一比,不就很容易的知道有多少数量的突变,就能做到***定量了。线性范围达到6个数量级,灵敏度低至万分之一。
相对于二代测序、基因芯片和定量PCR而言,数字PCR具备以下优势:
● 灵敏度可达到单个核酸分子:检测限低至0.001%,主要系为数字PCR可以实现靶标DNA/RNA的生物浓缩;
● 无需标准曲线活参照基因进行对比来测定核算量,可对靶分子起始量进行***定量,直接独处DNA分子的个数;
● 适合环境复杂样品的检测:终点PCR检测,不依赖Ct值,不依赖扩增效率,能克服PCR***剂的影响,避免样品间的交叉***问题,适合各类复杂环境中的样本进行***定量,如动血样、粪便、尿液、痰液、水样、土壤、植物等; 液体活检:早筛、用药、监测、复发。无锡广州永诺数字PCR代理商
可使用第三方PCR反应液,配备PCR A300(温度范围4°C-98°C,扩增模块温控精度±0.2°C)。无锡广州永诺数字PCR代理商
数字PCR为juedui定量,qPCR为相对定量,数字PCR较qPCR更精细、更灵敏。所以说,未来数字PCR将成为qPCR的重要补充,在部分领域逐步替代荧光定量PCR。
未来这些领域将广泛应用到数字PCR:
科研:高校(生命科学学院、环境学院、医学院、药学院)等。
医院:病理科、血液科、妇产科、心血管科、检验科、转化医学中心
:研究院单位、疾控中心、海关(出入境检验检疫)、质监局、环境/环保局等。
企业:第三方检测机构、IVD(分子体外诊断试剂)、生物制药等。 无锡广州永诺数字PCR代理商
浚和(上海)仪器有限公司是一家供应国内外先进仪器和设备的专业供应商和服务商,致力于为客户提供专业的定制化解决方案。多年来,持续为医药、化工、高校、科研单位、检测院等多个行业提供先进的产品和专业的服务。
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公司主要经营产品包括:等离子清洗机、真空泵、喷雾干燥器、数字PCR、高压灭菌锅、培养箱、切片机、水分测定仪、激光粒度仪、光谱仪、温湿度记录仪等,目前主要合作品牌有:日本雅马拓YAMATO、日本KASHIYAMA、日本HORIBA、广州永诺 、日本KEM等。同时,公司还提供专业的技术服务,如设备的维护、验证等。
浚和仪器将始终以行业特点为立足点,以客户需求为导向,不断地提高自身专业技术能力,不停地完善客户服务质量,在发展中保持创新的精神,力求与客户共同进步,为行业的发展作出不懈的努力。
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