辽宁组蛋白组学

转录组学和蛋白质组学分析作者通过转录组学和蛋白质组学分析暴露于DON的C2C12细胞的差异基因（DEG）。转录组学鉴定了2387个DEG，其中72%被下调。蛋白质组学鉴定出402个DEG，其中74%被下调。GO和KEGG通路富集分析表明，转录组学DEGs参与了“男性主要性征的发育”、“骨骼肌肌球蛋白粗丝组装”和“骨骼肌收缩的调节”等生物学过程。**富集的通路是“ECM-受体相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白质消化吸收”。蛋白质组学分析中，富集到了“肌肉收缩”、“中间丝解聚”和“脂质转运”等生物学过程。细胞成分中富集到“细胞骨架”、“细胞外基质”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和庆大霉素生物合成”、“系统性红斑狼疮”、“ECM-受体相互作用”和“蛋白质消化和吸收”。前两条通路与上调的DEG相关，而后两条通路与下调的DEG相关，这与转录组学结果一致。蛋白组学技术对肾错构瘤尿液差异蛋白的研究。辽宁组蛋白组学

蛋白质组学技术研究案例：作为一种常见的******，脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)在田间或加工和储存过程中会污染谷物和饲料。DON在动物中会引起厌食和生长迟缓在内的一系列不良反应。本文作者使用转录组学和蛋白质组学技术对鼠C2C12细胞进行了研究，分析DON对成肌细胞分化的影响。研究结果表明，DON通过下调细胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路来影响成肌细胞的分化。本文研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。中文标题：霉菌***脱氧雪腐镰刀菌烯醇通过下调细胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路影响成肌细胞分化研究对象：脱氧雪腐镰刀菌烯醇、C2C12细胞发表期刊：EcotoxicologyandEnvironmentalSafety影响因子：6.291发表时间：2021年10月发表单位：中国科学院上海营养与健康研究所运用生物技术：转录组学和蛋白质组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)、免疫荧光、免疫印迹、PCR辽宁生态蛋白组学蛋白质组与代谢组联合分析。

TMTpro-16plex等标记试剂已经发布一年，广受科研工作者喜爱。但是，对于6组3重复、3组6重复的实验设计，16plex却难以满足。TMTpro™ 18-plex标记蛋白组会是更好的选择方式。其中基于质谱仪平台的蛋白组学近年来备受青睐，稳定同位素标记策略也被广泛应用于多重定量蛋白质组学中。鹿明生物推出Thermo Scientific™ TMTpro™ 18-plex标记蛋白组，18个样本以内，可实现一次标记和分级，避免了多批次标记引入的批次效应，能***提升样本的数据质量。同时对更多蛋白质鉴定和定量，提供了样本的多通路处理水平。这个技术可谓是2021年的又一创新技术。

本研究通过生理和蛋白质组学分析在冬油菜中鉴定了大量的冷胁迫响应蛋白。探讨了冬油菜耐冻性增强的机理和低温胁迫对冬油菜形态和生理生化变化的影响。文章以耐冻型Longyou 7和冷敏感型Lenox为材料，通过iTRAQ标记蛋白组学和转录组学分析，揭示了谷胱甘肽转移酶活性、碳水化合物结合和谷胱甘肽结合、代谢过程及IAA反应与冷应激反应密切相关，鉴定出了Longyou 7和Lenox之间的DAPs，这些DAPs参与氨基酸、碳水化合物、脂质和能量代谢，对提高冬油菜的耐冻性发挥了重要作用。蛋白质组学测序 蛋白组学技术缺点。

TMT标记定量蛋白组学研究案例：2021年11月，南京中医药大学附属医院江苏省中医院单位（一作刘史佳研究员）及其课题组在MolecularMetabolism期刊发表的题为“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果，通过TMT标记定量蛋白组学和GC-MS非靶代谢组学研究方法，发现了糖尿病肾病（DKD）特征，筛选了蛋白和代谢容组合生物标志物。为优化糖尿病肾病（DKD）管理提供了丰富且开放访问的数据资源。中文标题：血清综合组学揭示人类糖尿病肾病情况研究对象：人血清发表期刊：MolecularMetabolism影响因子：7.422发表时间：2021年11月1日合作单位：江苏省中医院运用生物技术：TMT标记定量蛋白质组学、GC-MS非靶向代谢组学(其中部分工作由欧易/鹿明生物提供技术支持)、ELISA蛋白质组学,蛋白质组分析,专业的多组学联合分析。内蒙古乳蛋白组学

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蛋白质组定量到了10,529种蛋白质，磷酸化蛋白质组定量到了来自9,832个磷酸化蛋白的62,879个磷酸化位点。基因组确定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在内的16个***改变的**驱动基因（图1A）。与西方iCCA人群队列相比，本文队列显示出更高的KRAS突变频率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突变频率（图1B）。在FU-iCCA队列中观察到黄曲霉***和马兜铃酸特征（图1C）。通过比较具有或不具有黄曲霉***特征的所有**的多组学数据，发现具有黄曲霉***特征的**显示出DNA修复和细胞周期通路的上调以及细胞凋亡、***炎症和免疫通路的下调（图1E）。进一步分析显示，TP53突变与黄曲霉***特征***相关（图1F和1G）。辽宁组蛋白组学

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