江苏靶向蛋白组学专题
3篇经典的蛋白组学和代谢组学在水产动物中的研究。水产动物的研究不仅是保障我国海水养殖业的健康可持续发展,同时可为良种创制、海洋环境研究、生态研究等提供重要理论基础和技术支撑~因此在水产生物研究方面蛋白组学、代谢组学在其中起到什么作用呢?期望这3篇经典文章能给您思路~中文标题:CO2诱导的海洋酸化损害了太平洋牡蛎对金氏弧菌的免疫功能:细胞和蛋白质组学的综合研究研究对象:牡蛎发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:6.551合作单位:中国科学院海岸带研究所运用欧易/鹿明生物技术:iTRAQ标记定量蛋白质组学(由鹿明生物提供技术支持)走近蛋白组学之蛋白组学常见问题答疑解惑。江苏靶向蛋白组学专题
蛋白质组学研究方法研究案例:2021年10月,中国科学院上海营养与健康研究所武爱波研究员课题组在Ecotoxicology and Environmental Safety发表了题为“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通过转录组学和蛋白质组学研究方法,探究了脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)对成肌细胞分化的影响,发现了DON处理使得细胞骨架蛋白和细胞外基质蛋白表达下调,并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路的机理,为食品和饲料污染的防治提供了理论依据。安徽定量蛋白组学价格蛋白质组学质谱分析蛋白质组学三大基本技术。
采用RNA-Seq转录组学分析和DIA蛋白质组学分析,研究了AC和AL对db/db小鼠的影响。转录组分析共鉴定出16812种不同的蛋白质编码转录本。其中,2837个(约16.9%)在正常组和对照组之间有***差异,表明db/db小鼠在转录水平上与野生型小鼠***不同。与对照组相比,共有3749个基因因摄入AC而发生***改变(2201个下调,1548个上调),560个基因(430个下调,130个上调)因摄入AL而发生***改变(图3B)。DIA蛋白质组学分析鉴定出2729种蛋白质。正常组和对照组之间共发现1059个(约占总鉴定蛋白质的38.8%)DEPs,AC处理有230个蛋白质发生***变化(109个上调,121个下调),AL处理有211个蛋白质发生***变化(116个上调,95个下调)。
本研究采用串联质量标签(TMT)标记的蛋白质组学和平行反应监测(PRM)技术,对莲子脱水过程中的生理调控网络进行了深入研究表明,碳水化合物代谢(包括糖酵解/糖异成、半乳糖代谢、淀粉和蔗糖代谢、磷酸戊糖途径和细胞壁组织)、ER中的蛋白质加工、DNA修复和抗氧化事件对莲种胎脱水有积极的反应。在莲种胚脱水过程中,非酶促抗氧化剂和戊糖磷酸和维生素E作为主要的抗氧化剂,在脱水过程中维持荷花胚胎的REDOX平衡。这些结果为揭示荷花胚胎脱水保护机制的生理学调控网络提供了酶途径在抗氧化保护中起着主要作用。应激生理学检测表明,H2O2是诱发氧化应激损伤的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的见解。蛋白质组学的特点蛋白质组和蛋白质组学的概念。
蛋白组学技术可以提供细胞状态和调控的功能信息,本研究建立了单细胞蛋白组学方法,实现了高灵敏度的蛋白组学检测。该技术有助于揭示疾病的发病机制,探讨预后和风险相关的不同肾脏疾病亚型中的蛋白组学异质性和独特的蛋白标志物,为药物靶点***提供希望。大规模单细胞分析对于捕获复杂细胞系统中的生物异质性至关重要,但*基于RNA技术的单细胞转录组学数据并不能很好地**蛋白质水平上的变化。而单细胞蛋白组学技术能够从蛋白质水平上破译细胞机制并且获得更多的信息。修饰蛋白质组试-蛋白质组学 解决方案。安徽水稻蛋白组学研究
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为了确定TMT AD蛋白网络模块是否也存在于其他的队列和大脑区域,使用 TMT标记定量蛋白质组学多个队列的所有组织,为每个队列生成蛋白质共表达网络,并评估了 AD 网络模块是否保留在每个队列和大脑区域中。发现几乎所有的 TMT AD 网络模块都保留在队列和大脑区域(图2b)。阿尔茨海默病(AD)是一种神经系统退行性疾病,其病因至今尚不清楚。本文从蛋白组学方向出发,建立蛋白共表达网络,综合转录组学结果,解析疾病相关的蛋白组学模块或能为AD提供可靠的生物标志物,并为治疗带来希望。江苏靶向蛋白组学专题
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