武汉10X单细胞测序多组学测序

时间:2022年08月06日 来源:

烈冰科技作为国内率先同时拥有10XGenomics和BDRhapsody双分选平台的测序服务商及云计算服务供应商,经过多年实战,拥有丰富的单细胞悬液制备和分选经验,实测BDRhapsody对能够高效捕获粒细胞。针对不同的分选平台、建库方法,实战总结搭建出不同的数据预处理工作流程;烈冰科技NovelBrain®生物大数据平台能有效支撑生命科学研究、医疗健康等领域对大数据分析的需求。高通量测序实验平台,包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC数字切片扫描仪等,配合一支来自海内外名校、多学科交叉型的高素质综合团队,为您的科学研究保驾护航。强势发文!烈冰单细胞测序助力揭示愈伤组织能再生的机制。武汉10X单细胞测序多组学测序

烈冰科技专注为科研学者提供专注的测序数据分析服务,先后经历基因芯片时代、基因测序、转录组测序时代...在科技日新月异的洪流中始终独占鳌头。2018年以来,单细胞测序进入发展的快车道,烈冰作为国内首批引进单细胞实验双平台的公司,依托自主研发的NovelBrain®生物大数据分析平台,为用户提供一站式全流程的单细胞测序服务和解决方案。4年的单细胞技术的积累,烈冰已具备大鼠、小鼠、斑马鱼、猴、裸鼹鼠、水稻、拟南芥等10+物种,皮肤、脑、脂肪、心脏、花序等50+组织类型,100+细胞类型,1000+靶标基因,10000+样本处理经验。重庆10X单细胞测序商业化服务单细胞测序数据分析,认准烈冰NovelBrain生物信息数据分析平台。

高通量测序技术(High-throughputsequencing)又称“下一代”测序技术(“Next-generation”sequencing),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量测序技术是对传统测序一次颠覆性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(nextgenerationsequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(deepsequencing)。而烈冰科技具有专业生物背景和十二年科研服务经验,已助力Nature,immunity等在内的300+篇CNS文章发表。

SingleCellSequencing技术,即利用优化后的高通量测序技术(NGS,NextGenerationSequencing)分析每一个单个细胞的序列信息,从而更高分辨率地揭示细胞间的细胞差异以及其在微环境中的功能情况。那么问题来了,如何获得单个细胞?如果无法获得单个细胞这一切都是不成立的;如何获得大批量的单个细胞?单个组织细胞群体通常在百万级别以上,如果被检测的测序细胞数量过小精确度不足;如何低成本地获得大批量单个细胞?单细胞测序成本非常高,尤其是需要测2000~3000个以上的细胞的时候,如果单个细胞的分选成本也很高,技术根本无法普及。所以,正因为这些问题的存在使得高通量测序在单个细胞测序应用中的普及度一直不足,直到几个突破性技术的诞生。助力探索生命时空多维度的动态变化的生物学信息;助力医疗健康时代!

10XGenomics是一种基于drop的微流控技术,液体在配套芯片中的微管道中流动,因此细胞直径会受到芯片中微管道直径的限制,微流体通道的直径约为50~60um,因此捕获细胞的直径不能超过40um。当细胞直径过大时,容易出现管道堵塞,造成GEM生成失败,对于神经科学研究和心血管疾病研究的老师而言,准备采用单细胞技术用于课题研究的时候,往往会遇到一个尴尬的问题,就是目标细胞,例如神经元细胞、成熟心肌细胞由于体积过大,不适用于10X单细胞技术。其中神经元细胞的直径很大,直接超过了芯片中管道的直径,虽然心肌细胞直径低于50um,但是成熟心肌细胞的长度很长,有可能堵塞通道造成实验失败,这也是为什么现在很多已发表的心脏单细胞文章,主要研究方向是心脏发育的原因了,主要还是因为未发育成熟的心肌细胞比较小,不会出现堵塞管道的风险。因此可以考虑组织解离后过40um滤网,过滤掉大细胞,避免出现管道堵塞、实验失败的风险。此种方案的缺点是大细胞被过滤掉,丢失相关细胞数据;另外组织解离获得高质量细胞悬液以后,继续做细胞裂解抽细胞核,开展细胞核测序。具体可访问烈冰官网给我们留言,烈小冰将安排专业技术为您详细解答。烈冰测序数据分析平台,不依赖已有物种信息,可研究非模式物种,针对不同平台的数据,制定多套流程;宁波高通量测序单细胞测序

全线搭建10X Genomics Chromium Controller单细胞测序平台。武汉10X单细胞测序多组学测序

单细胞多组学提升见解基于测序的数据能够将彰显其强大之处,因为它能够了解同一单细胞的多种生物分析指标。如果说单细胞基因表达提供了一种颜色的详细信息,那么单细胞多组学提供了同一细节的全彩色图谱,为您带来样本的真实视图。烈冰2021年强势引进的10xGenomicsChromium单细胞平台能够从同一单细胞中读取细胞复杂性的多组学特征。与传统方法不同,单细胞多组学简化了您需要开展的实验,也节省了您需要分析的样本,而能获得相同的结果。这不但节省了宝贵的样本,还保证了更高的生物学准确性,因为您不需要匹配拆分样本的数据集并通过计算来推断各个组学之间的关系。武汉10X单细胞测序多组学测序

上海烈冰生物医药科技有限公司是一家生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】的公司,致力于发展为创新务实、诚实可信的企业。公司自创立以来,投身于单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序,是医药健康的主力军。烈冰生物始终以本分踏实的精神和必胜的信念,影响并带动团队取得成功。烈冰生物始终关注医药健康行业。满足市场需求,提高产品价值,是我们前行的力量。

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