成都10X Chromium X单细胞测序百万通量平台

时间:2022年08月11日 来源:

关于10XGenomics单细胞平台的样本类型和样本制备:10X平台在上机前需要注意细胞消化后的细胞团块,获得分离良好的细胞悬液、无细胞随便、极少的细胞团块,且细胞活力高(>70%);此外,了解您所研究细胞的大小范围也很重要。细胞大小通常与细胞表达的转录本数量有关。各种尺寸不同的细胞(一般直径不大于50μm)均可与我们基因表达解决方案中使用的10XGenomics平台兼容。一般来说,细胞制备方案将根据组织来源和细胞类型而变化。每种组织类型都是独特的,因此,必须在开始任何单细胞实验之前优化样本制备,烈冰多年样本解离消化经验,累积10+物种、50+组织的消化protocol,若您的样本为组织,且尚未成功将组织样本消化成单细胞悬液,烈冰将尽可能提供技术及实验上的帮助。截至2021年10月,烈冰助力发表单细胞测序文章近20篇。成都10X Chromium X单细胞测序百万通量平台

SingleCellSequencing技术,即利用优化后的高通量测序技术(NGS,NextGenerationSequencing)分析每一个单个细胞的序列信息,从而更高分辨率地揭示细胞间的细胞差异以及其在微环境中的功能情况。那么问题来了,如何获得单个细胞?如果无法获得单个细胞这一切都是不成立的;如何获得大批量的单个细胞?单个组织细胞群体通常在百万级别以上,如果被检测的测序细胞数量过小精确度不足;如何低成本地获得大批量单个细胞?单细胞测序成本非常高,尤其是需要测2000~3000个以上的细胞的时候,如果单个细胞的分选成本也很高,技术根本无法普及。所以,正因为这些问题的存在使得高通量测序在单个细胞测序应用中的普及度一直不足,直到几个突破性技术的诞生。福州单细胞测序服务机构单细胞测序技术遍地开花,烈冰服务让您的医学研究如虎添翼。

烈冰科技专注为科研学者提供专注的测序数据分析服务,先后经历基因芯片时代、基因测序、转录组测序时代...在科技日新月异的洪流中始终独占鳌头。2018年以来,单细胞测序进入发展的快车道,烈冰作为国内首批引进单细胞实验双平台的公司,依托自主研发的NovelBrain®生物大数据分析平台,为用户提供一站式全流程的单细胞测序服务和解决方案。4年的单细胞技术的积累,烈冰已具备大鼠、小鼠、斑马鱼、猴、裸鼹鼠、水稻、拟南芥等10+物种,皮肤、脑、脂肪、心脏、花序等50+组织类型,100+细胞类型,1000+靶标基因,10000+样本处理经验。

10XGenomics是一种基于drop的微流控技术,液体在配套芯片中的微管道中流动,因此细胞直径会受到芯片中微管道直径的限制,微流体通道的直径约为50~60um,因此捕获细胞的直径不能超过40um。当细胞直径过大时,容易出现管道堵塞,造成GEM生成失败,对于神经科学研究和心血管疾病研究的老师而言,准备采用单细胞技术用于课题研究的时候,往往会遇到一个尴尬的问题,就是目标细胞,例如神经元细胞、成熟心肌细胞由于体积过大,不适用于10X单细胞技术。其中神经元细胞的直径很大,直接超过了芯片中管道的直径,虽然心肌细胞直径低于50um,但是成熟心肌细胞的长度很长,有可能堵塞通道造成实验失败,这也是为什么现在很多已发表的心脏单细胞文章,主要研究方向是心脏发育的原因了,主要还是因为未发育成熟的心肌细胞比较小,不会出现堵塞管道的风险。因此可以考虑组织解离后过40um滤网,过滤掉大细胞,避免出现管道堵塞、实验失败的风险。此种方案的缺点是大细胞被过滤掉,丢失相关细胞数据;另外组织解离获得高质量细胞悬液以后,继续做细胞裂解抽细胞核,开展细胞核测序。具体可访问烈冰官网给我们留言,烈小冰将安排专业技术为您详细解答。基因测序相关产品和技术已由实验室研究逐渐演变到临床应用,是下一个改变世界的技术。

10XGenomics和Drop-Seq具有类似的技术原理。从横向孔道中逐一输入凝胶微珠,一列纵向孔道输入细胞,凝胶微珠与细胞碰撞后会吸附在凝胶微珠上,并通过微流控技术,将之输入到第二纵向孔道,即油相孔道中。这时候,就形成了一个个油滴并输出并收集在EP管中。每一个油滴中会落入一个细胞以及一个凝胶微珠,那么在每一个凝胶微珠中上长满了不同的CellBarcode和UMIBarcode连接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,构成我们的捕获凝胶微珠。而这个凝胶微珠抓手就会使用oligodT抓住mRNA构建文库。单细胞测序因其强大的探究疾病--细胞--基因的关系,一度成为高通量测序技术的“天花板”。上海10X Genomics单细胞测序百万通量平台

十二年测序经验,烈冰生物单细胞多组学领域的佼佼者。成都10X Chromium X单细胞测序百万通量平台

作为单细胞测序的一个重要里程碑,10xgenomic公司于2016年2月推出10xChromiumSingleCellGeneExpressionSolution,此平台整合了仪器、试剂盒和信息学软件,能精确对接illumina测序仪,因此可实现大量大细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平的基因表达谱和差异情况,并通过对复杂细胞群体进行深入细致分析,绘制大规模单细胞表达图谱。以量化细胞内的群体异质性,并逐个鉴定细胞类型、细胞状态和动态细胞跃迁。除了有望鉴定新的细胞亚型和稀有细胞群体,单细胞技术还能更好地了解转录动态和基因调控关系。成都10X Chromium X单细胞测序百万通量平台

上海烈冰生物医药科技有限公司主要经营范围是医药健康,拥有一支专业技术团队和良好的市场口碑。公司业务分为单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序等,目前不断进行创新和服务改进,为客户提供良好的产品和服务。公司将不断增强企业重点竞争力,努力学习行业知识,遵守行业规范,植根于医药健康行业的发展。在社会各界的鼎力支持下,持续创新,不断铸造高质量服务体验,为客户成功提供坚实有力的支持。

信息来源于互联网 本站不为信息真实性负责