上海单细胞多组学多组学测序
单细胞测序是指针对单个细胞进行全转录组测序分析,可精确地描述每一个细胞的状态,在异质性发育过程中具有不可忽视的应用价值。然而,单细胞测序无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息,对于揭示发育过程、病理微环境都存在很大的局限性。空间转录组测序以点阵形式记录病理切片细胞的空间信息并进行测序,可以精确指示点阵内的全部基因表达情况。空间转录组测序的加入,无疑让单细胞测序如虎添翼,更精确地勾勒了组织水平的异质性。烈冰测序服务已助力300余篇国际主流期刊研究文章发表。上海单细胞多组学多组学测序
随着单细胞转录组测序技术(scRNA-Seq)的蓬勃发展,其在在胚胎发育,肿瘤细胞异质性,免疫细胞转化等多方面屡建奇功,但是由于细胞形态的不同和单细胞制备中细胞敏感性的差异等因素影响,scRNA-Seq在数据分析时可能会出现细胞类型占比失真,个别细胞类型丢失等情况。为了克服单细胞测序技术的局限性,单细胞核转录组测序技术(snRNA-Seq)应运而生,snRNA-Seq可利用冻存组织直接制备单细胞核进行转录组测序,不仅克服了细胞形态差异致使的细胞捕获差异,还克服了单细胞测序必须使用新鲜样本的多个局限性。温州scRNA单细胞多组学商业化服务功能研究型单细胞多组学测序技术结合了CRISPR基因编辑技术, 深度挖掘基因表达调控与细胞功能。
单细胞技术让我们在基因组学、表观基因组学、转录组学和蛋白质组学等层面上解析了许多错综复杂的生命密码。随着科技的进步,我们发现整合多个组学的信息可以更仔细地观察细胞之间的可变性,更清楚地识别特定细胞及其功能。单细胞多组学在临床诊断、疾病分型以及细胞发展机制这些重大生命科学领域方面的应用也将越来越广。单细胞技术从 2009 年发展到现在,研究范围不再局限于转录组,而是扩展到了基因组、免疫组、表观组、蛋白组等多组学水平。
冰冻切片的空间转录组测序在RNA捕获、文库构建方面,需要将组织切片贴合在带有mRNA结合捕获探针的载玻片上,通过甲醛固定、H&E染色得到组织切片的形态结构。再进行透化处理,使细胞中的mRNA释放,并结合到芯片相邻的捕获探针上。将捕获的mRNA反转录合成cDNA并构建测序文库进行上机测序,从而获取基因表达信息。总体来说,空间转录组的实验流程包括:组织冻存-OCT包埋-冷冻切片-固定染色-组织透化-cDNA合成及建库-上机测序,而需要客户进行样本准备的步骤相对简单:组织冻存与OCT包埋。目前已应用的单细胞多组学联合分析包括转录组和基因组,转录组和DNA甲基化、转录组和蛋白组。
多样本数据合并:FractionofReadsKept:合并样本时,各样本根据MappedBarcodedReadsperCell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大,需要进行Downsample处理,以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平,从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据,深入解读数据分析结果,深入挖掘其背后的生物学意义;从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究,加速科研进程!利用单细胞多组学技术能够更有效地研究细 胞在特定时空状态下各组学间的复杂联系。武汉BD单细胞多组学测序价格
深度的单细胞测序数据解读助力生物健康医疗时代。上海单细胞多组学多组学测序
单细胞多组学技术优势:1. 构建蛋白质数据库,大幅度提高蛋白质鉴定数量;2. 不同层面表达水平分析,构建表达“全景图”;3. 多组学交叉验证:深层次挖掘其中调控机制;4. 对基因突变信息在蛋白水平上进行验证;5.精细医疗:实现genomics到protegenomics的转变。生物领域各个研究方面,1. 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;2. 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;3. 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型等;4. 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;5. 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;6. 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;7. 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;8.食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。上海单细胞多组学多组学测序
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