合肥上海烈冰生物空间转录组测序
空间转录组数据可以用单细胞转录组数据的分析策略进行分析,例如,利用GO和Pathway分析筛选不同发育时期特定空间区域内的信号通路及其关键基因的较大情况,揭示在特定发育时期特定区域内发生的生物学过程。针对任何一个基因,空间转录组可以显示表达该基因的点阵及其空间排布;单细胞转录组可以给出该基因表达的细胞类群;原位测序可以给出该基因在细胞内的表达状况。通过不同发育时间点的信息比较,可以分析细胞类群在某个部位在不同时间点的差异,给出其在细胞内的真实的演变状况。基因测序相关产品和技术已由实验室研究逐渐演变到临床应用,是下一个改变世界的技术。合肥上海烈冰生物空间转录组测序
生命科学研究的目的之一就是为了解决细胞和组织以及该组织如何影响功能这一难题。测序技术可提供特定条件下某些 组织中基因的表达信息,不仅可以推断出相应未知基因的功能,揭示特定调节基因的作用机制,而且可以辨别细胞的类型和异质性,为疾病诊断提供理论依据。但由于研究的深入或具体研究方向和内容的不同,传统的转录组测序技术显然不能够满足科研工作者们强烈的好奇心,更加直观地反映组织中基因的表达情况,随即单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)、空间转录组(Spatial transcriptomics,ST)测序等一系列技术应运而生。宁波上海烈冰生物空间转录组多组学测序自主研发PanoCell单细胞实验测序平台。
10XGenomics和Drop-Seq的技术原理。是利用十字交叉的通道,从横向孔道中逐一输入凝胶微珠,纵向孔道输入细胞,凝胶微珠与细胞碰撞后会吸附在凝胶微珠上,并通过微流控技术,将之输入到油相孔道中。这时候,就形成了一个个油滴后输出并收集在EP管中。每一个油滴中会落入一个细胞以及一个凝胶微珠,那么在每一个凝胶微珠中上长满了不同的CellBarcode和UMIBarcode连接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,构成我们的捕获凝胶微珠。而这个凝胶微珠抓手就会使用oligodT抓住mRNA构建文库,进而完成细胞中RNA的捕获过程。
空间转录组技术流程:1、组织优化由于不同物种、组织来源的样本所需的比较好透化时间不尽相同,在正式开展空间转录组测序实验前,需要利用组织优化kit进行条件的摸索。组织优化芯片上包含8个捕获区域,每个区域均覆盖了荧光标记探针,可捕获mRNA形成带有荧光标签的cDNA,随即可通过荧光成像结果判定比较好透化时间及组织优化条件。2、空间转录组测序确定组织优化条件后,即可进行切片、H&E染色及成像、空间转录组文库构建及测序分析流程。烈冰空间转录组,多平台任意选择,随心组合,优化您的科学研究,助力探索新的科学视角。
解决空间转录组测序数据分析中由于超大数据量、超高的质控要求以及繁多分析需求而引起的分析困难,做到快速可定制化完成空间转录组分析;拥有行业先进的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的数字切片扫描仪,可以同时实现明场与荧光场下冷冻切片的快速扫描成像;Z-Stack多层聚焦扫描及Extended Focus 景深扩展多层融合扫描模式,进一步提升分辨率和清晰度,保证切片高分辨的数字图像信息精细采集;能够满足针对分析结果中感兴趣基因的RNA-FISH验证以及组织切片的免疫组化的高清成像,获取表达与定位信息。烈冰智造空间转录组细胞捕获,媲美国际主流的单细胞平台。深圳BD空间转录组测序服务
强势发文!烈冰空间转录组测序助力揭示愈伤组织能再生的机制。合肥上海烈冰生物空间转录组测序
烈冰生物真正实现空间转录组测序的全程把控,做到从实验设计、空间信息标记、建库测序、定制化分析的全流程一站式服务,助力高分文章发表;专业实验团队保证样本的高度一致性;专业的生物学团队提供个性化的产品应用场景解读、保持对生物学意义的关注;强大的生信分析团队一对一地进行详实科学的实验方案设计并提供多次售后分析;可接受样品类别为冰冻组织:新鲜样本经液氮预冷的异戊烷速冻,-80℃保存OCT包埋组织:新鲜组织异戊烷速冻后进行OCT包埋,或新鲜组织直接OCT包埋后-80℃速冻,注意标明样本方向,样本于-80℃保存样本处理和运输过程需要在低温环境合肥上海烈冰生物空间转录组测序
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