合肥10X Chromium X单细胞测序

作为单细胞测序的一个重要里程碑，10xgenomic公司于2016年2月推出10xChromiumSingleCellGeneExpressionSolution，此平台整合了仪器、试剂盒和信息学软件，能精确对接illumina测序仪，因此可实现大量大细胞的快速高效标记、测序和分析，获得单细胞水平的基因表达谱和差异情况，并通过对复杂细胞群体进行深入细致分析，绘制大规模单细胞表达图谱。以量化细胞内的群体异质性，并逐个鉴定细胞类型、细胞状态和动态细胞跃迁。除了有望鉴定新的细胞亚型和稀有细胞群体，单细胞技术还能更好地了解转录动态和基因调控关系。烈冰专研单细胞多组学测序领域。合肥10X Chromium X单细胞测序

从单细胞测序描述性分析转向复杂样本中不同细胞类型的功能解析，越来越需要一种多组学的细胞生物学视角。通过单细胞多组学——即对不同组学的数据集进行分析和整合——科学家能够从同一个单细胞来源中检测多种细胞特征。这些特征包括全转录组基因表达、细胞表面蛋白表达、免疫组库序列（包括T细胞和B细胞受体）以及用于了解表观基因组调控的开放染色质区域。随着单个实验可提供更多信息丰富的数据，研究人员的获益更多，包括保留珍贵样本、提高生产力、减少因批次效应引起的错误，并节省更多的高科技资源（从资助基金到人员时间）。吉林单细胞测序服务全线搭建10X Genomics Chromium Controller单细胞测序平台。

10X Genomics单细胞转录组测序是利用单细胞水平上的高通量测序分析基因表达谱的技术，也是目前国内和国际上公认的单细胞测序大规模实验平台技术，该平台基于动态微流控原理，突破传统高通量测序的局限性，组织解离后，单个样本一次上机能捕获500-20000个细胞， 基于每个细胞分别建库测序，获得单个细胞的基因结构和基因表达状态，并鉴定细胞的类型，可以在不同样本间从细胞类型的组成和丰度角度进行比较，反映细胞间的异质性，提供足够灵活的定制测定法以满足多种实验需要，并有效缩短实验是时间和降低测序成本。

现有的单细胞测序技术阵营在几个主要领域存在差别。一个是分隔单个细胞以在其中进行微反应的物理平台。在这个空间，单个细胞的内容物释放，转录本或其他生物分析物被标记或添加索引，以便下游识别。现有技术的另一个主要区别是如何添加索引，就像生成测序文库所涉及的流程步骤一样。10XGenomics单细胞测序平台采用动态微流控技（Drop-Seq具有类似的技术原理）。从横向孔道中逐一输入凝胶微珠，其中一列纵向孔道输入细胞，凝胶微珠与细胞碰撞后会吸附在凝胶微珠上，并通过微流控技术，将之输入到第二纵向孔道，即油相孔道中。这时候，就形成了一个个油滴并输出并收集在EP管中。每一个油滴中会落入一个细胞以及一个凝胶微珠，那么在每一个凝胶微珠中上长满了不同的CellBarcode和UMIBarcode连接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，构成我们的捕获凝胶微珠。而这个凝胶微珠抓手就会使用oligodT抓住mRNA构建文库。烈冰专精单细胞多组学测序领域。

相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题，10X平台普遍提供的细胞数量都在1000-20000不等的测序细胞量，这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的SingleCell群体类型。因此，这两种技术对于基于基因表达进行准确细胞分型上，无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说，都会更实用。同时依托RandomCellLabel技术，使得其对于NovaSeq、HiSeqXTen、Hiseq4000等设备存在的Indexhooping现象，相对于Smart-Seq数据来说，影响几乎可以忽略不计（10XGenomics官方网站曾给出hooping测试结果，显示无影响。烈冰生物为您提供多平台一站式全流程单细胞测序服务。武汉二代测序单细胞测序商业化服务

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单细胞测序实验再样本细胞上机分选签，需要对细胞数量、细胞活性进准判断，这对SingleCell分选标记、建库、下机数据的质量都具有着决定性的作用。如若细胞计数偏高，将会影响建库的成功率；计数偏低，则会提高双细胞的比例；而细胞活率过低，就会使测序数据的利用率大打折扣，因此把好单细胞悬液质量这一关尤为重要。而在铺板过程中，由于不同操作人员手法具有不可避免的差异，不同的液体流速将直接影响单细胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody单细胞分选平台配套了专门定制的电动移液器，其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多种操作模式，来对应各种不同的操作。通过已经设定的程序来控制液体的流速，大幅度降低人为操作习惯带来的差异，保证实验操作的一致性。合肥10X Chromium X单细胞测序

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