广州上海烈冰生物空间转录组测序服务公司

时间:2022年08月19日 来源:

转录组分析指对细胞内所有转录产物的分析。转录组测序一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高通量测序。相对于传统的芯片杂交平台,转录组测序无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测,提供更精确的数字化信号,是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。FFPE空间转录组技术原理 为同时获得空间表达和组织学背景信息,该方案首先将FFPE组织切片置于Visium基因芯片上进行组织学染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探针进行表达定量。自主研发PanoCell单细胞实验测序平台。广州上海烈冰生物空间转录组测序服务公司

10XGenomics和Drop-Seq的技术原理。是利用十字交叉的通道,从横向孔道中逐一输入凝胶微珠,纵向孔道输入细胞,凝胶微珠与细胞碰撞后会吸附在凝胶微珠上,并通过微流控技术,将之输入到油相孔道中。这时候,就形成了一个个油滴后输出并收集在EP管中。每一个油滴中会落入一个细胞以及一个凝胶微珠,那么在每一个凝胶微珠中上长满了不同的CellBarcode和UMIBarcode连接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,构成我们的捕获凝胶微珠。而这个凝胶微珠抓手就会使用oligodT抓住mRNA构建文库,进而完成细胞中RNA的捕获过程。武汉BD Rhapsody空间转录组数据分析可视化空间转录组测序数据分析,认准烈冰NovelBrain生物信息数据分析平台。

已发表的关于空间转录组技术有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。这些方法或是在细胞数量上限制较大,或是存在有效测序深度不足等问题。10xGenomics公司提供的Visium空间基因表达解决方案是目前一个高通量空间转录组的商业化解决方案。该解决方案可以轻松地将空间转录组学技术应用到组织切片和染色的标准方法中,从而研究空间分辨率下整个转录组mRNA的表达情况,同时在同一组织切片中获得组织学相关信息。

烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据,深入解读数据分析结果,深入挖掘其背后的生物学意义;从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究,加速科研进程!此外,烈冰生信团队根据丰富的实战经验为用户量身打造了一款单细胞测序结果解读的神兵利器——单细胞浏览器(SingleCellBrowser),不仅可以将海量复杂的结果文件可视化,还可以实现分析结果的三维立体化的展示呈现。专业的生信代码交给专业的烈冰,专业的生物学意义交给专业的您!十二年测序经验,累计服务与5000余项重要科研项目。

生命科学研究的目的之一就是为了解决细胞和组织以及该组织如何影响功能这一难题。测序技术可提供特定条件下某些 组织中基因的表达信息,不仅可以推断出相应未知基因的功能,揭示特定调节基因的作用机制,而且可以辨别细胞的类型和异质性,为疾病诊断提供理论依据。但由于研究的深入或具体研究方向和内容的不同,传统的转录组测序技术显然不能够满足科研工作者们强烈的好奇心,更加直观地反映组织中基因的表达情况,随即单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)、空间转录组(Spatial transcriptomics,ST)测序等一系列技术应运而生。十二年测序经验,烈冰生物空间转录组领域的佼佼者。济南烈冰生物空间转录组平台

烈冰实验室包含从样本处理到测序下机的全套实验平台。广州上海烈冰生物空间转录组测序服务公司

作为2019年的明星技术之一,10x Genomics单细胞测序凭借其高通量、低成本、易操作、稳定性高等优势一直保持着高热度,目前利用该平台发表的文章已达500多篇。空间转录组技术优势:实现基因表达数据与空间定位信息的结合,解析多种类型组织切片样本中基因表达谱;无需组织解离,保留组织结构及细胞微环境,鉴定异质性组织中细胞类型,避免相关偏好性;可用于挖掘新的组织生物标记物;可与现行实验室组织分析方法轻松对接,短时间内即可完成切片及文库制备流程。广州上海烈冰生物空间转录组测序服务公司

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