深圳scRNA空间转录组数据分析

时间:2022年08月20日 来源:

生命科学研究的目的之一就是为了解决细胞和组织以及该组织如何影响功能这一难题。测序技术可提供特定条件下某些 组织中基因的表达信息,不仅可以推断出相应未知基因的功能,揭示特定调节基因的作用机制,而且可以辨别细胞的类型和异质性,为疾病诊断提供理论依据。但由于研究的深入或具体研究方向和内容的不同,传统的转录组测序技术显然不能够满足科研工作者们强烈的好奇心,更加直观地反映组织中基因的表达情况,随即单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)、空间转录组(Spatial transcriptomics,ST)测序等一系列技术应运而生。全线搭建10x Genomics空间转录组测序平台。深圳scRNA空间转录组数据分析

10x Genomics空间转录组测序技术通过将组织切片的高通量mRNA分析和形态学背景整合,使基因表达谱可以被定位回它们的原始空间位置。传统的空间转录组测序技术局限于冰冻组织切片。10x Genomics推出全新的针对FFPE样本的Visium空间基因表达解决方案,该技术打破从FFPE组织样本中获取空间全部转录组基因表达信息的壁垒,能够从FFPE样本中获取高灵敏度、高特异性的相关基因的表达信息,在形态学背景下实现真正的探索发现,进一步扩展空间生物学的可能性。深圳scRNA空间转录组数据分析烈冰生物为您提供一站式全流程空间转录组测序服务。

所谓的高通量测序技术,又名大规模平行测序,是将DNA(或者cDNA)随机片段化、加接头,制备测序文库,通过对文库中数以万计的克隆(colony)进行延伸反应,检测对应的信号并获取序列信息。与传统测序法相比,高通量测序技术在处理大规模样品时具有强大的优势,又快(两天)又多(数百万克隆),成为目前组学研究的主要技术。空间转录组测序是一个系统的工程,开展项目前您可能会先评估它提供的见解是否与您的研究问题相匹配,如果匹配,实验过程如何规划,实验平台如何选择,样本如何制备,数据如何分析等等,而在这一切开始之前,我们的服务就已经开始了,从销售到实验到专业技术支持,我们开通全线对接渠道,帮助您快速定位项目诉求,提供从实验设计到文章发表的全流程,我们始终是您贴心的科学合作伙伴。

空间组学可以应用的方向:1.可以鉴定到疾病的空间位置异质性:对于阿尔茨海默症的研宄可以探索到小神经质细胞趋向于阿尔茨海默神经班。 2.建立空间转录组图谱构建个人空间转录组图谱将极大提升科研人员对生物体组织间的细胞差异。3、描述胚胎发育及空间蓝區胚胎发育的动态过程是科研人员一直为之着迷的,空间组学发展可以清晣的描绘胚胎发育的蓝图。除了皮肤、胰腺和骨头组织外,其余样本类型均可开展10xGenomics空间转录组研究。10xGenomics公司已经测试完毕的组织类型有:人:心胜、肾胜、卵巢、乳房、淋巴结、大脑、大肠、肺、脾脏小鼠:大脑、眼睛、心胜、肾胜、大肠、肝脏、肺、卵巢,四头肌、小肠、脾胜、胃、翠丸、甲状腺、舌头大鼠:大脑、肾脏、心脏烈冰科技已建立了基于空间转录组的高通量测序实验多平台。

空间转录组测序是在组织原位检测全转录组基因表达的⼀种技术,可以展⽰组织切⽚中不同区域的基因表达情况,同时能够得到⽬的基因在组织内部的空间位置信息。与传统的全基因转录组或单细胞转录组测序相⽐,空间转录组测序浆病理影像(H&E染⾊)与测序数据映射在⼀起,进⽽可以分析组织切内部空间结构的细胞异质性。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相互作用以及细胞所处的微环境,将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学等领域的研究利器。截至2021年10月,烈冰助力发表空间转录组测序文章近20篇。武汉烈冰生物空间转录组多组学测序

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如行家预判,服务型发展即将步入黄金时代,众多企业围绕医药产业、商业领域及新兴的互联网医药等领域正在进行厮杀。在我国政策的支持下,在社会资本的推动下以及技术升级的带动下,互联网巨头、科技巨头、地产巨头等企业纷纷跨界进入服务型。从世界范围来看,美、欧、日等发达地区的销售产业发展历史悠久,无论是销售产品制造业还是销售服务业,都处于全球优先地位。而泰国、印度等东南亚及南亚地区,销售产业虽然起步晚,但是发展较快,已成为经济社会发展重要组成部分。目前全球销售产业发展主要有美国波士顿—剑桥的医药产业集聚区、德国图特林根的医药产业集聚区、日本富山县的医药产业集聚区、印度班加罗尔的仿制药产业集聚区等九大发展模式。而我国仍以医药服务和医药商品为主,整体收入规模偏小。首先,完善促进单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序发展的相关政策,优化产业发展环境。第二,加大对大健康前沿领域支持,技术带领健康科技发展。第三,消灭体制机制障碍,催生更多单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序发展模式。第四,大力发展与单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序相适应的高等教育事业。深圳scRNA空间转录组数据分析

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