福建空间代谢组学图片
空间代谢组学主要从事质谱成像新技术、空间分辨代谢组学新方法及其在生物医药应用研究和临床前新药代谢研究。近年来在质谱成像空间分辨代谢组学领域取得重要突破,并**国际前沿发展。目前,承担着国家自然科学基金、医科院创新工程等多项课题,科研经费充足;拥有先进的液质联用仪器和质谱成像仪器数台,建立了新药研发质量管理规范体系,实验条件完备。具有分析化学、或药物分析、或生物学等相关专业的博士学位。2、具有以下研究经验或能力之一:质谱分析;代谢组学研究;与新药或疾病相关的分子生物学研究;生物信息学等。空间分辨代谢组学代谢组相关材料。福建空间代谢组学图片
质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。广西空间代谢组学翻译空间代谢组突破传统代谢组研究损失空间信息的瓶颈。
进行了相关的空间代谢组学研究来自同一患者的正常白质组织,旨在获得与患者再髓鞘病变相关的特定脂质谱(图6D−1)。通过串联质谱法确认鉴定的脂质,并在表2中报告。正如在小鼠组织分析中所观察到的,再髓鞘化区域主要在PC和PE脂质群的组成上不同。结果表明,HSL成像可以有效地用于多发性硬化患者死后病变的脂质谱分析,并表明多发性硬化患者再髓鞘化过程中产生的髓鞘与附近正常出现的白质相比具有改变的脂质谱。(a)正常白质(NAWM)和有髓鞘病变的平均拉曼光谱±1标准差(SD)。(b)平均差谱±1SD(NAWM−再髓鞘损伤)在结构水平显示再髓鞘过程。(c)基于有髓损伤的拉曼光谱的P***A后验概率图像突出NAWM(绿色)和有髓组织(红色)。
空间代谢组学:前列腺*组织样本中的不同组织区域具有不同的代谢特征。使用空间代谢组学确定了关键分子过程中的代谢差异,例如NCE、基质和**之间的脂质代谢和前列腺分泌功能。在不同组织结构中观察到的代谢物水平差异,表明了空间信息及其测量方法的重要性。本实验仍然存在一定的局限性,质谱成像过程中存在分子离域,可能导致结果假阴性。欧易生物、鹿明生物五、软著及**1、实验检测**1项2、空间代谢组定性及分析软著5项3、空间代谢组与空间转录组联合分析软著3项空间代谢组学一个样本多少钱。
空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BCL)进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析,发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表达,在MYC诱导的肝细胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和肾细胞*(RCC)的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录,如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用,作者首先,对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析,证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合(图1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达,但不降低MYC基因的表达。其次,ChIP的MYC与启动子结合,不仅调节FA合成基因的表达,还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此,MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因:首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺,然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序(RNA-seq)发现,增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。空间代谢组学二维乃至三维的水平,极大拓展了对组学样品信息的认知。河南空间代谢组学 肝炎
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作者进行了空间代谢组学(∼50μm的空间分辨率),并根据m/z848.63和m/z844.52对主要的髓鞘标志物进行了成像,推测它们分别属于Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(图2G)。白质和灰质的代表性质谱如图2H所示。结果表明,使用拉曼光谱结构信息和空间代谢组学对髓鞘中的脂质进行特定的成分分析是可能的。对单个有髓组织成分光谱的分析证实,构成有髓组织光谱的主要分子是脂质,包括脑苷脂、胆固醇、鞘磷脂、磷脂酰胆碱,以及程度较小的蛋白质(图2F)。福建空间代谢组学图片
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