上海代谢组学基因组学

GC-MS代谢组学和 LC-MS代谢组学研究：盐度的变化会影响甲壳类动物的生长、***和疾病状态。文章作者通过非靶代谢组学对青蟹适应盐度急性下降过程中的代谢变化进行了研究，利用GC-MS和LC-MS数据联合分析了青蟹应对盐度急性下降情况的主要代谢途径。研究结果表明，在急性低盐胁迫下，青蟹通过甘油磷脂代谢物调节生物膜的结构发生变化，然后通过ABCs转运蛋白运输氨基酸和碳水化合物，实现细胞内外的渗透平衡。此项研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。王春琳课题组深耕青蟹研究，近些年来探索青蟹对环境的适应变化也在各大期刊上发表：项目文章|iTRAQ蛋白组学助力宁波大学越冬期间拟穴青蟹代谢变化研究项目文章|两篇背靠背，王春琳、王欢课题组揭示拟穴青蟹适应盐度骤降的代谢机理代谢组学——寻找代谢物与生理病理变化的相对关系研究方式。上海代谢组学基因组学

代谢组学+转录组学，中文标题：基于代谢组学分析的百菌清、多菌灵、咪鲜胺及其二元和三元混合物对斑马鱼胚胎和仔鱼的健康风险研究对象：斑马鱼胚胎和仔鱼发表期刊：JournalofHazardousMaterials影响因子：10.588运用生物技术：代谢组学环境毒理学浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展，作者：杨桂玲，王彦华，李健，王豆，鲍志伟，王强（通讯作者），靳远详（共同通讯作者），在JournalofHazardousMaterials期刊发表的文章，通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发育阶段的复杂病理生理和毒性通路。研究认为获得的数据可以为不同类型杀菌剂及其混合物对水生生物的毒性提供理论依据。上海代谢组学基因组学基于 LC-MS/GC-MS代谢组学 从样本采集到数据分析。

**靶向代谢组学研究，中文标题：代谢组学分析揭示了COVID-19新的发展特征研究对象：****患者发表期刊：EuropeanRespiratoryJournal影响因子：16.671发表时间：2021.7.21运用生物技术：LC-MS非靶代谢组学+靶向代谢组学，****已经***了1.6亿多人，并导致全世界数以百万的人死亡；至少部分原因是它的病理生理尚不清楚。所以，识别****的潜在分子机制对于战胜**是至关重要的。此外，代谢物通过在疾病进展过程中获得***的病理生理学意义来反映个体的疾病进展。因此，中国广州多家研究机构的科研人员使用了非靶向和靶向代谢组学分析对****患者所有阶段血清的代谢特征进行了***的观察。与健康对照组比较，在发现队列和验证队列中，轻度、重度和恢复期循环代谢物的变化模式不同，提示糖代谢和尿素循环的代谢重编程是****进展的潜在病理机制。

LC-MS靶向代谢组+16S微生物多样性检测研究。题目：粪便微生物可以区分酒精性肝炎引起的酒精摄入量，但不能区分疾病的严重程度期刊：HepatologyIF=17.425研究思路：*样本类型：人粪便*检测平台：LC-MS靶向代谢组、16S微生物多样性检测为了表征酒精性肝炎有关的粪便微生物生态学，考察微生物组变化和疾病严重程度的关系，推断微生物生态学变化的功能相关性，本文作者将中度或重度酒精性肝炎患者（MAH和SAH）的粪便微生物组与健康（HC）和重度饮酒对照组（HDC）进行比较，通过16SrRNA基因测序鉴定微生物群分类，使用LC/MS平台测量粪便短链脂肪酸（SCFA）含量。重度饮酒患者与健康对照组相比、重度饮酒组与酒精性肝炎相比，均可以发现明显的微生物组特征分布。但微生物分类不能区分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中，粪便中短链脂肪酸与产生SCFA的微生物菌群均减少，可以推断出，酒精性肝炎患者的粪便微生物组有明显的变化，与酒精性肝炎的严重程度无关。代谢组学方案改变科学的组学研究方案,即刻咨询!。

通过转录组学和代谢组学（GC-MS非靶向代谢组学）对BPF暴露和对照组的细胞进行分析，筛选到差异的基因和代谢物。分别通过富集分析，找到差异基因或代谢物参与的条目或通路。***通过差异转录本、代谢物和促炎细胞因子的综合分析，揭露了它们之间的关系。本文通过多组学分析和体外模型的方式，发现了BPF暴露后肠上皮细胞转录组和代谢组谱的改变，揭露了BPF可能在肠道炎症发病机制的作用。中文标题：转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象：人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影响因子：7.963发表时间：2021年11月合作单位：上海交通大学附属新华医院运用生物技术：GC-MS非靶向代谢组学（由鹿明生物提供技术支持）、转录组学、qRT-PCR代谢组学大起底—探究小分子物质研究。浙江代谢组学 费用

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尿液代谢组学研究案例，空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析，其中GC-MS检测102种代谢物，LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性，结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明，Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异，LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物，体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物，使用综合分析获得候选差异代谢物，其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短期PM暴露相关标志物，确定了33种与短期暴露于空气污染相关的差异代谢物，包括8种脂质、6种核酸、7种氨基酸及其衍生物、3种葡萄糖和9种其他代谢物。KEGG通路分析表明，***富集到5种代谢通路，与免疫、炎症、人类的环境压力、缺血和缺氧有关。上海代谢组学基因组学

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