上海ITS高通量测序产品

时间:2022年09月02日 来源:

什么是KBSeq全质粒测序?它基于第二代测序技术,一次性对大量质粒(比较多可达6000个样本)进行并行测序,利用生物信息学分析,对数据进行序列组装并获得每一个质粒的完整序列信息。所以我们也称它为,可以部分替代一代测序的高通量测序技术。测序长度:对于测序长度较长,如果我们用Sanger测序往往需要花费大量的时间,而我们KBSeq全质粒测序则只需要5-7天,就可以测通片段长度小于30kb以下的片段。样本用量:KBSeq全质粒测序对于样本的量,要求的也比较少,比如质粒我们的样本要求DNA的浓度需≥ 1 ng/μl, 体积需≥5 μl,如果比较珍贵的样本或者是样本比较难提取的,KBSeq就更为适合了。现在也有学者为了区分传统测序和单细胞测序的区别,将传统方法称为批量测序。上海ITS高通量测序产品

长链非编码RNA(lncRNA)测序(只限有参考基因组物种),项目介绍:长链非编码RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一类转录本长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各种生物体内。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是LncRNA(相应的蛋白编码RNA比例是1%)。近年来研究表明,LncRNA参与了多种重要的调控过程,如X染色体沉默、基因组印记及染色质修饰等。通过LncRNA测序,可以快速获得与其生物学过程或者疾病相关的LncRNA的表达变化,从而促进LncRNA的深入研究。上海地区多重PCR高通量测序测序DNA样品请提供电泳胶图,浓度>20 ng/μl,总量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA,可冰袋运输,不超过3天。

对于微生物样品,请客户如实声明所属物种;对于可能致病的微生物,生工将拒收。以固体培养基培养的样品,需将样品从培养基上刮取下来,用干冰寄送;以液体培养基培养的样品,需离心后弃培养液收集样品,用RNA组织保存液(例如RNA-Be-Locker A)保存,以干冰或冰袋寄送;没有RNA组织保存液的情况下,也可用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C 冰箱,埋于足量干冰寄送。***样品送样量需至少达到100 mg/样;细菌样品送样量需至少达到107(10的7次方)数量级,同时,在与样本一同寄送的送样表上,标明属于革兰氏阳性菌(G+)还是革兰氏阴性菌(G-)。

怎样通过血球计数板进行质检操作呢?将血球计数板擦拭干净,取干净的盖玻片盖在计数板上;将细胞悬液混匀(或10µl台盼蓝+10µl细胞悬液),吸出10µl悬液至计数板上盖玻片的一侧使细胞核悬液铺满盖玻片和计数板之间;在显微镜下分别对V1/V2/V3/V4四个计数区域进行计数;按细胞计数公式进行计算,计算公式:细胞总数={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*悬液体积*稀释倍数,V1/V2/V3/V4为各个计数区的细胞数目,细胞活率=活细胞数目/总细胞数目*100%。使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。

AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一种小分子染料,可以通过完整的细胞膜,嵌入所有细胞(活细胞和死细胞)的细胞核,呈现绿色荧光;碘化丙啶(PI)只能通过不完整的细胞膜,即死细胞的细胞膜,嵌入所有死细胞的细胞核,呈现红色荧光,通过标记出的绿色荧光和红色荧光就可以辨别出活细胞和死细胞,这种特异性染色的方法也可以排除无核细胞、杂质、碎片等的干扰。荧光细胞计数仪检测结果可以让我们直观的看到:细胞浓度(总细胞,活细胞,死细胞)、细胞存活率(台盼蓝和双荧光AO/PI染色)、细胞平均直径、细胞聚团率、细胞直径分布等结果的展示。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中,再将50 ml管放在封口袋中。上海地区多重PCR高通量测序技术

关键是KBSeq还可以省钱。上海ITS高通量测序产品

使用显微镜进行悬液质检操作时应注意:1.使用血球计数板时,可以提前镜检观察每小格计数室内是否洁净无杂质。若有杂质灰层,则需要多次清洗,直至计数室洁净无瑕;2.质检前将悬液轻微震荡或使用扩口***头吹打混匀;3.台盼蓝染色后需要尽快完成细胞计数,一般建议不要超过10分钟;4.如果方格中细胞数目过多,难以数清,应当对细胞悬液进行稀释以便于计数;5.对于压在方格界线上的细胞应当计数同侧相邻两边上的细胞数,一般可采取“数上线不数下线,数左线不数右线”的原则处理,另两边不计数。上海ITS高通量测序产品

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