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PCR引物设计的原则PCR反应中有两条引物,即5′端引物和3′引物。设计引物时以一条DNA单链为基准(常以信息链为基准),5′端引物与位于待扩增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物与位于待扩增片段3′端的一小段DNA序列互补。(1)引物设计的基本原则引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC比较好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列参照。引物内部不应出现互补序列。两个引物之间不应存在互补序列,尤其是避免3′端的互补重叠。引物与非特异扩增区的序列的同源性不要超过70%,引物3′末端连续8个碱基在待扩增区以外不能有完全互补序列,否则易导致非特异性扩增。引物3‘端的碱基,特别是较末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,比较好选择是G和C。引物的5′端可以修饰。如附加限制酶位点,引入突变位点,用生物素、荧光物质、地高辛标记,加入其它短序列,包括起始密码子、终止密码子等。英瀚斯生物pcr检测,保证真实实验检测,数据保密完整性。四川高效pcr怎么选择
PCR出现假阳性的原因分析。引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行PCR扩增时,扩增出的PCR产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性。需重新设计引物。靶序列或扩增产物的交叉污染:这种污染有两种原因:一是整个基因组或大片段的交叉污染,导致假阳性。这种假阳性可用以下方法解决:①操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样器内或溅出离心管外。②除了酶及其他不耐高温的物质外,所有试剂或器材均应高压消毒。所用离心管均应一次性使用。③必要时,在加标本前,反应管和试剂用紫外线照射,以破坏存在的核酸。二是空气中的小片段核酸污染,这些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,与引物互补后,可扩增出PCR产物,而导致假阳性的产生,可用巢式PCR方法来减轻或消除。四川高效pcr怎么选择荧光定量pcr和实时定量pcr的区别?
PCR实验技术中的锚定PCR(AnchoredPCR)介绍:锚定PCR主要用于分析具有可变末端的DNA序列,Loh等用A-PCR对人外周血淋巴细胞T细胞受体α-链的mRNA的多变性进行了分析。先合成cDNA,并用末端脱氧核苷酸转移酶在其3’-可变区末端加上一个PolyG尾巴。Loh等恒定区与可变区连接部位设一个引物,另一个引物是一个具5’-polyG尾巴的引物。带有PolyG尾巴的引物是一个固定点,它可以并与PolyG尾巴结合,无论其余部分序列如何,只识别片段末端,利用此法可从前述mRNA中检出至少20种不同序列,每一种都是独特的,表明A-PCR不对任何特殊序列有倾向性结果,可用于T细胞及其它部位抗体基因的研究。
PCR实验技术的发展历程,Khorana(1971)等**早提出核酸体外扩增的设想:“经DNA变性,与合适的引物杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复该过程便可合成tRNA基因。”1983年4月的一个星期五晚上,他开车去乡下别墅的路上,猛然闪现出“多聚酶链式反应”的想法。1983年12月,Mullis用同位素标记法看到了10个循环后的49bp长度的***个PCR片段;1985年,KaryMullis在Cetus公司工作期间,发明了PCR。Mullis要合成DNA引物来进行测序工作,却常为没有足够多的模板DNA而烦恼。1985年10月25日申请了PCR的**,1987年7月28日批准(**号4,683,202),Mullis是发明人;1985年12月20日在Science杂志上发表了篇PCR的学术论文,Mullis是共同作者;1986年5月,Mullis在冷泉港实验室做专题报告,全世界从此开始学习PCR的方法pcr检测的价格是多少?
PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:
1、模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备。
2、模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合。3、引物的延伸:DNA模板--引物结合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链。重复循环变性--退火--延伸三过程就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍 荧光定量pcr正常值多少?四川高效pcr怎么选择
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pcr是一种在体外扩增特定DNA序列的技术方法,通过与特定DNA区域两端互补的寡核苷酸为引物(primer)在试管中DNA聚合酶选择性地单独复制合成介于两引物直接的基因片段,如同DNA复制中的半保留复制一样,新合成的基因片段与模板链形成新的DNA双链,经反复的变性(denature)引物退火(anerling)和引物延伸(extention)三步循环,前一循环合成的DNA链成为下一循环引物结合的模板,每循环一次,反应体系的DNA的量就增加一倍,20-30次反复循环,即可由微量的DNA模板开始获得大量的DNA特异片段。近年来,PCR迅速发展,已深入生命科学的各个领域,技术方法不端完善,基本的PCR实验技术主要有经典PCR技术、RT-PCR技术、免疫-PCR技术、PCR-SSCP技术等。四川高效pcr怎么选择
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