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    基于以上研究，迈杰转化医学可针对患者分层及各类研究指标提供FGFR抑制剂***中生物标志物研究的整体解决方案，包含：HumanComprehensivePanelMed1CDx；定制的panFGFxpanel；QIAGENtherascreen®FGFRRGQRT-PCRKit；RNAscope检测FGFR1/2/3/4mRNA表达；FISH（FGF19扩增）；IHC（FGF19表达）等（图4）。图4FGFR抑制剂相关的生物标志物整体解决方案➤➤方案1：Med1CDxNGSpanel(601基因)迈杰转化医学的Med1CDx综合panel包含原*基因、遗传性驱动基因、细胞周期基因和免疫/炎症相关基因等601个基因，可用于对TMB、MMR、MSI、免疫检查点分子、**新生抗原和HLA分型等***的分析。对于FGFR抑制剂研究，该panel除了能够检测FGFR基因的SNV/INDEL、基因重排和扩增等异常，也可以评估已知和探索新的耐药变异（图5）。图5Med1CDx基因分布➤➤方案2：定制panelpanFGFx（40基因）值得关注的是，迈杰转化医学针对FGFR抑制剂的研究研发了“小而精”的panFGFxpanel：FGFR1-4探针覆盖基因全部外显子，包括UTR区，覆盖**全，同时检测已知与未知SNV/InDel；针对融合检测，加入了已知融合伙伴的相关探针，提高已知融合检出率；如有新融合发现需求，可提供涵盖全部内含子区版本；针对拷贝数扩增检测。 迈杰转化医学基于基因组学、蛋白质组学、细胞组学及病理学等综合性转化医学全平台。河南一体化迈杰转化医学NGS平台值得推荐

    2005年，罗氏推出了***款二代测序仪罗氏454，生命科学开始进入高通量测序时代。后续随着Illumina系列测序平台的推出，极大降低了二代测序的价格，推动了高通量测序在生命科学各个研究领域的普及。目前，高通量测序已经成为一种常规研究方法，大量科研工作中均会用到。然而，为什么二代测序能实现高通量？为什么二代测序读长如此之短？为什么reads末端测序质量会降低？应该如何选择测序读长与打断片段的长度？想要回答这些问题，都需要详细了解二代测序的基本原理。本篇文章以典型的Illumina双末端测序为例，详细解析二代测序的原理。第二代测序（Next-generationsequencing，NGS）又称为高通量测序（High-throughputsequencing），是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序，而二代测序开创性的引入了可逆终止末端，从而实现边合成边测序（SequencingbySynthesis）。二代测序在DNA复制过程中通过捕捉新添加的碱基所携带的特殊标记（一般为荧光分子标记）来确定DNA的序列，现有的技术平台主要包括Roche的454FLX、Illumina的Miseq/Hiseq等。由于在二代测序中，单个DNA分子必须扩增成由相同DNA组成的基因簇，然后进行同步复制。 河南一体化迈杰转化医学NGS平台值得推荐迈杰多平台的研究优势以及多组学数据的挖掘能力，促进产学研医结合，加速项目成果转化，创新科技产品研发。

    第二代测序技术高通量测序技术(High-throughputsequencing,HTS)是对传统Sanger测序技术**性的变革，可以一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定，因此也称其为下一代测序技术(NextGenerationSequencing,NGS)，高通量测序技术的出现使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能。技术平台经过科研人员的不断开发和改进，目前成熟的第二代测序技术共有3种，分别为Roche公司的454技术、ABI公司的SOLiD技术和Illumina公司的Solexa技术。Roche/454该技术由JonathanRothberg于2005年发明，该技术是***个被发明的二代测序技术，该技术**生命科学的研究进入高通量测序时代。该技术的基本原理是：一个片段=一个磁珠=一条读长，DN**段无需进行荧光标记，无需电泳，边合成变测序，碱基在加入到序列中时，会脱掉一个焦磷酸，通过检测焦磷酸识别碱基，因此也被称为焦磷酸测序。

    包括67个y-str基因座和1个性别决定基因座amelogenin)。相比于illumina公司的forenseqtmdnasignatureprepkit，本发明提供的试剂盒中包含41个新的y-str基因座，能提供更多新的遗传信息。而且本发明提供的复合扩增体系中所有y-str基因座的**大扩增子长度都小于300bp，而forenseqtmdnasignatureprepkit中有约％(7/24)基因座的**大扩增子长度大于300bp，不利于降解检材的分析。本发明提供的试剂盒是本发明的发明人经过大量实验摸索获得的，试剂盒中的引物具有不可替换性；即引物被替换后，部分基因座将会被抑制且抑制效果不可预知。实验证明，采用本发明提供的试剂盒检测标准品2800m中68个基因座的str分型，分型结果准确。本发明具有重要的应用价值。附图说明图1为67个y-str基因座的pcr扩增产物的长度范围分布。具体实施方式以下的实施例便于更好地理解本发明，但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料，如无特殊说明，均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验，均设置三次重复实验，结果取平均值。标准品2800m为promega公司的产品，产品目录号为dd7251。 PMS2抗体试剂 苏苏械备20180570号.

    实施例3、实施例1制备的试剂盒的准确性验证1、取1ng标准品2800m、样本一、样本二或样本三(见实施例2中步骤二)，按照yfilerpluspcramplifcationkit(thermofisherscientific)的说明书步骤进行毛细管电泳检测，得到各个基因座的等位基因基因型。分型结果见表4。表4注：m为毛细管电泳检测技术的分型结果，e为二代测序技术的分型结果。2、按照实施例2中步骤一的方法检测标准品2800m、样本一、样本二或样本三，得到各个基因座的等位基因基因型。分型结果见表4。结果表明，实施例1制备的试剂盒与yfilerpluspcramplifcationkit重合的基因座，在标准品2800m、样本一、样本二和样本三中的分型结果完全一致。实施例4、实施例1制备的试剂盒中引物具有不可替换性实施例1制备的试剂盒是本发明的发明人经过大量实验获得的，主要包括扩增各个基因座引物的反复调试和引物浓度的摸索。由于复合的基因座数目较多，引物间相互抑制情况复杂，所以试剂盒中用于扩增各个基因座的引物不可替换。1、设计并合成表5中第2列所示的、用于扩增65个str基因座的引物，然后混合，获得引物混合物1。设计并合成表5中第4列所示的、用于扩增66个str基因座的引物，然后混合，获得引物混合物2。迈杰中心实验室设有SLAN 96P、Rotor-Gene Q、ABI 7500、ABI ViiA7、Roche z480等实时荧光定量PCR仪及数字PCR仪！河南一体化迈杰转化医学NGS平台值得推荐

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    染色体STR不属于测序技术的，它是一类分子检测技术，例如Y染色体-STR，一般通过PCR、电泳凝胶结合来分析这段串联重复序列的存在或者多态性，常用来检测性别或亲子鉴定，而不能测出具体的DNA序列信息。测序技术是一代测序（sanger测序）、二代测序（高通量测序）、三代测序（单分子测序）为基础的。二代测序的缺点主要是由其PCR边复制边读取的原理决定的，测序时间长，读长短，末端质量差。三代测序中PacBio实际上就是针对这些缺点的升级，通过巧妙的微孔设计实现单分子读取，而且可以屏蔽游离dNTP的信号，不用每读取一次就要清洗—添加一次dNTP，所以读长比较长，测序速度快。就是样本—提DNA—打成小片段，然后就开始PCR啊末端修复啊加A啊片段选择啊一系列，***得到片段大小为300-500bp的DNA，ok文库搞定。虽然这行真的干的烦死了，不过离开了真的很想念。 河南一体化迈杰转化医学NGS平台值得推荐