陕西酵母文库是什么
通过传统的酵母双杂交系统,以PtDAL1为诱饵,筛选样本来源于不同年龄段的油松cDNA文库。将获得的阳性克隆,10个一组,挑选到1个96孔板的PCR板孔中,获得10*96个阳性克隆的96孔板。以其中阳性克隆mix为模板,进行PCR扩增,并将所有的PCR产物进行纯化。使用纯化后的PCR产物,进行打断后构建二代测序文库,通过NGS测序,获得6G的阳性克隆数据。通过分析二代测序数据,获得阳性克隆基因信息(去冗余后获得135个互作子,包含21个TFs,2个TRs及酶类、热激蛋白、RNA结合等蛋白,部分见表1)。挑选重要的候选基因进行一对一验证(图2)。与拟南芥中同源基因AGL6的蛋白互作网络进行比对分析。对DAL1互作蛋白(DIPs)的基因表达谱、启动子中的顺势作用元件功能进行分析,并对DIPs进行GO注释(图3)。综合生信分析结果,构建针叶树老化途径的调控模型(图4)。关于酵母杂交文库构建及筛选你需要知道这些。陕西酵母文库是什么
酵母文库筛选:为了系统地揭示调控丛枝菌根共生的转录因子,研究者以51个水稻基因的启动子为诱饵,利用包含1570个水稻全长转录因子的文库进行了酵母单杂交筛选。这51个基因主要是已报道的参与或调节菌根共生的基因。文库筛选发现了一个由266个转录因子和47个启动子高度连接的网络,称之为"丛枝菌根共生酵母单杂交网络(YAM)"。平均每个启动子可以和4个转录因子互作。266个转录因子分属至少11个转录因子家族。72%(192个)的YAM转录因子在根中存在表达(FPKM>1)。与非定殖根相比,19个YAM转录因子在丛枝菌根***定殖的根中表达上调。陕西酵母文库是什么酵母文库筛库欧易生物。
酵母单杂交筛选技术:关于HIV想必大家都不陌生,***HIV病毒后潜伏周期长,且目前没有完全的***方法。为了彻底***HIV,不让其发病就要从2方面入手:要么消除潜伏***的细胞,要么防止潜伏原病毒的细胞被***。也就是需要抑制HIV病毒的转录。但是关于HIV在人细胞中的复制、转录和潜伏期调控的分子网络仍不完全确定,所以目前HIV仍不能被**。为了帮助解决这个问题,波士顿大学的研究者,使用酵母单杂交筛选技术,以HIV-1,HIV-2的LTR(启动子和增强子)为诱饵,筛选了人的转录因子文库(包含1086个人的转录因子),**终绘制了调节HIV-1和HIV-2的转录网络图谱,结果发表在2021年的PNAS杂志上。
酵母文库:首先我们需要了解什么是"酵母双杂交技术"?酵母双杂交是一种研究真核细胞体内蛋白质之间相互作用的有效分子生物学技术,在功能基因组学和蛋白质组学研究中发挥重要作用。酵母文库产品线由7个**实验室组成,分别有RNA抽提室,RNA质检室、酵母建库室、大肠杆菌转化室,酵母菌转化室、筛库室等。使用原装试剂盒、培养基,保证实验质量。实验流程细致谨慎,实验团队经验丰富。实验中使用RIN值7以上的RNA,一次建库服务,多次质检实验,确保实验数据高效准确。酵母双杂实验过程中如何选择核体系或者膜体系? 。
文章中酵母双杂交文库由欧易生物协助完成。近日,上海交通大学/复旦-交大-诺丁汉植物生物技术研发中心主任唐克轩课题组在New Phytologist(IF:8.512)发表了题为“AaWRKY9 contributes to light- and jasmonate-mediated to regulate the biosynthesis of artemisinin in Artemisia annua”的研究论文,揭示了青蒿转录因子AaWRKY9有助于光和茉莉酸信号所介导的青蒿素生物合成调控的新型分子机制,本研究通过蓝/红光诱导青蒿中青蒿素生物合成基因的表达,使用转录组分析确定了一个WRKY转录因子AaWRKY9,可明显***青蒿素生物合成相关基因的表达。欧易生物酵母平台,从公司成立伊始,伴随着公司和客户一路成长,栉风沐雨十多年。浙江品质酵母文库
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酵母双杂交、GSTpull-down实验显示,SWC6可以直接与HY5、HYH相互作用(图A-C)。pull-down实验显示ARP6同样可以与HY5、HYH相互作用(图D)。split-LUC、Co-IP实验证实HY5可以与SWC6、ARP6结合(图E-J)。下胚轴表型分析显示,蓝光下arp6hy5hyh三突变体下胚轴长度明显大于arp6突变体、hy5hyh双突变体,表明ARP6和HY5有可能通过不同途径调控下胚轴的发育。Semi-in vivo pull-down、Co-IP 实验显示,蓝光下,在 CRY1 存在下,SWC6 与 ARP6 的结合***增强。表明蓝光***的 CRY1 可能通过蓝光依赖的 CRY1-SWC6/ARP6 相互作用增强 SWC6 与 ARP6 的结合。陕西酵母文库是什么
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