辽宁蛋白组学日

时间:2022年05月25日 来源:

2021年10月,中国科学院上海营养与健康研究所武爱波研究员课题组在《Ecotoxicology and Environmental Safety》(IF:6.291)发表了题为“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通过转录组学和蛋白质组学研究方法,探究了脱氧雪腐镰刀菌烯醇(简称:DON,俗称呕吐***)对成肌细胞分化的影响,发现了DON处理使得细胞骨架蛋白和细胞外基质蛋白表达下调,并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路的机理,为食品和饲料污染的防治提供了理论依据。其中转录组学和蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持。蛋白质组学ppt 蛋白组学测序一个多少钱。辽宁蛋白组学日

蛋白质组学技术研究案例:作为一种常见的******,脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)在田间或加工和储存过程中会污染谷物和饲料。DON在动物中会引起厌食和生长迟缓在内的一系列不良反应。本文作者使用转录组学和蛋白质组学技术对鼠C2C12细胞进行了研究,分析DON对成肌细胞分化的影响。研究结果表明,DON通过下调细胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路来影响成肌细胞的分化。本文研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。中文标题:霉菌***脱氧雪腐镰刀菌烯醇通过下调细胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路影响成肌细胞分化研究对象:脱氧雪腐镰刀菌烯醇、C2C12细胞发表期刊:EcotoxicologyandEnvironmentalSafety影响因子:6.291发表时间:2021年10月发表单位:中国科学院上海营养与健康研究所运用生物技术:转录组学和蛋白质组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)、免疫荧光、免疫印迹、PCR江西蛋白组学测序 费用一站式服务,研究不同生物体在不同时刻/状态下蛋白质表达的变化。

转录组学和蛋白质组学分析作者通过转录组学和蛋白质组学分析暴露于DON的C2C12细胞的差异基因(DEG)。转录组学鉴定了2387个DEG,其中72%被下调。蛋白质组学鉴定出402个DEG,其中74%被下调。GO和KEGG通路富集分析表明,转录组学DEGs参与了“男性主要性征的发育”、“骨骼肌肌球蛋白粗丝组装”和“骨骼肌收缩的调节”等生物学过程。**富集的通路是“ECM-受体相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白质消化吸收”。蛋白质组学分析中,富集到了“肌肉收缩”、“中间丝解聚”和“脂质转运”等生物学过程。细胞成分中富集到“细胞骨架”、“细胞外基质”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和庆大霉素生物合成”、“系统性红斑狼疮”、“ECM-受体相互作用”和“蛋白质消化和吸收”。前两条通路与上调的DEG相关,而后两条通路与下调的DEG相关,这与转录组学结果一致。

iTRAQ标记定量蛋白组学技术鉴定AHSG和RPL29分别是上调和下调*****的蛋白。301份肝*标本的统计分析表明AHSG与NMT1呈正相关,而RPL29与NMT1呈负相关(图8A)。此外,NMT1和AHSG均与**分期正相关,而RPL29与肝*的**分期呈负相关(图8B)。值得注意的是,NMT1和AHSG水平较高的肝*患者的生存率低于水平较低的肝*患者(图8C)。而较高水平的RPL29表明存活率较高(图8C)。这些数据表明NMT1、NUP和NDP与肝*的临床结果密切相关。iTRAQ蛋白质组学技术鉴定NMT1敲除时发生变化的蛋白质;蛋白组学方案为组学研究涉及的样本获取,前处理,数据采集到分析的各个环节提供自动化。

蛋白组学研究案例:2022年1月,欧易/鹿明生物合作客户北京中医药大学教育部中医养生学重点实验室刘铜华教授课题组在Frontiers in Nutrition期刊发表了题为 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果,通过转录组学和蛋白质组学研究方法,发现了肉桂酸(AC)和肉桂醛(AL)在改善葡萄糖脂代谢中的特征,探究了其代谢作用机理。为预防和***代谢紊乱等疾病提供了理论依据。修饰蛋白质组试剂及服务,蛋白质组学解决方案。辽宁蛋白组学 价格

蛋白组+代谢组+脂质组-数据分析系统。辽宁蛋白组学日

随着美国临床蛋白质组**分析项目(CPTAC)和中国人类蛋白质组计划(CNHPP)等大型蛋白质组学研究计划的推进,发表了一系列**的大规模人群多组学分析文章[2,3]。这些高分文章通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、代谢组学、微生物组学等技术,在上百例的病例样本中***表征了某种**的分子特征。对比这些文章,可以发现蛋白质组学数据在多组学数据分析中逐渐成为**结果,且蛋白质组学数据分析有些共同特点,即:1)基于蛋白质组进行**分子分型2)分析不同亚型患者的临床特征3)免疫、代谢、突变、微生物等**领域研究热点在不同亚型中的差别分析4)筛选亚型特征分子作为预后标志物或潜在的药靶进行验证或机制研究该文是樊嘉院士/周虎研究员/高大明研究员/**教授团队继2019年Cell发表的肝细胞*多组学研究后,同样基于蛋白质组为**的多组学联合分析策略,进一步阐释了蛋白质组学驱动精细医学的优势,为**的发***展机制、分子分型、预后监测和个性化***策略提供新思路。辽宁蛋白组学日

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