ATAC测序公司

时间:2022年06月02日 来源:

其实,空间转录组的概念早就已经存在了,目前已经发表的空间转录组技术有 Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。但是这些方法存在操作复杂、检测精度不准确、基因和细胞检测量的限制等问题。10x Genomics公司升级spatial Transcriptomic后推出的Visium空间基因表达解决方案是一款商业化的高精度、高通量空间转录组测序方案。烈冰科技自2020年起,国内率先搭建空间转录组测序服务平台,联合上线单细胞核转录组测序、AbSeq、单细胞TCR-Seq、单细胞ATAC-Seq(ARCHR测序)、空间转录组测序产品结合scRNA-Seq服务,多组学联合助力科研人员探索时空等多维度、多角度的动态变化的生物学信息。烈冰生物为您提供贴心的单细胞研究完整解决方案!国产化PanoCell单细胞测序平台,提供高性价比服务方案。ATAC测序公司

不同类型的细胞或者在不同的条件下,活细胞中染色质的结构是在不断变化的,比如说各种应激反应(stimulus response)和抗逆反应(stress response)等,也就是说染色质的可及性是会随细胞类型和外界刺激的改变而发生变化,而染色质开放区域的定向测序可以帮助我们了解细胞的转录调控过程,确定开放染色质的位置、转录因子的调控差异、核小体的调控区域和染色质状态等信息,确定哪些基因在细胞中具有转录活性。单细胞多组学测序是一种比较强大的表观遗传学研究工具,在开放染色质图谱绘制,细胞分化发育,疾病的致病机制,样本微环境等方面具有极大的应用前景。杭州单细胞免疫组库测序烈冰生物为您提供一站式全流程单细胞测序服务。

相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题,BD和10X这两个平台普遍提供的细胞数量都在1-6K不等的测序细胞量,这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的Single Cell群体类型。因此,这两种技术对于基于基因表达进行准确细胞分型上,无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说,都会更实用。同时依托Random Cell Label技术,使得其对于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等设备存在的Index hooping现象,相对于Smart-Seq数据来说,影响几乎可以忽略不计(10X Genomics官方网站曾给出hooping测试结果,显示无影响。

基于10X Next GEM技术,单细胞免疫组库测序一次实验可以同时检测近万个细胞,可在一个样本中同时获5'端mRNA表达谱、TCR和BCR的信息,结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复杂组织样本的是影响免疫应答分析,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制。 烈冰平台 1/ 1000+ TCR/BCR项目经验,一次实验可同时获取1000-10000个细胞的文库构建,获得转录组和免疫组数据。 2/ 具备完善的免疫组库测序和实验质控流程,获取V(D)J全长序列的配对信息 3/ 丰富的免疫组库测序和数据分析经验,实现专属个性化数据分析服务,搭配单细胞分析云平台,一键导出交互性的动态结果报告。单细胞测序技术遍地开花,烈冰服务让您的生物医学研究如虎添翼。

二代测序技术在测序方法上取得了重大突破,基于“边合成边测序”(sequencing by synthesis)和大规模平行测序技术(massive parallel analysis,MPS),使测序通量和读取速度得到极大提升,烈冰生物斥巨资购置的Novaseq6000测序仪的测序原理可以简化为四步:样品文库构建、簇生成、测序和数据分析。由于读长限制,样品DNA或由RNA逆转录得到的cDNA需要被打断成300-500bp的片段,并在3'和5'端接上3种序列:1)Index,用于区分样品来源;2)Adapter,用于结合测序通道上的位点;3)Primer binding site,用于结合PCR引物启动扩增反应。烈冰实验室包含从样本处理到测序下机的全套实验平台。成都RNA测序公司

测序可准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学重要问题。ATAC测序公司

细胞中基因的表达是严格按照时间和空间顺序发生,因此细胞类型和基因表达具有时间特异性和空间特异性。时间特异性可以通过收集不同时间点的样本进行单细胞转录组测序来分析。但是单细胞转录组测序(scRNA-Seq)在单细胞悬液制备的过程中破坏了细胞的空间结构,无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息。而空间转录组可以解决这个问题,其以点阵形式记录组织切片细胞的空间信息,在保留组织形态结构的基础上,获得细胞/基因的空间表达特异性。ATAC测序公司

上海烈冰生物医药科技有限公司拥有生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】等多项业务,主营业务涵盖单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序。公司目前拥有专业的技术员工,为员工提供广阔的发展平台与成长空间,为客户提供高质的产品服务,深受员工与客户好评。上海烈冰生物医药科技有限公司主营业务涵盖单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序,坚持“质量保证、良好服务、顾客满意”的质量方针,赢得广大客户的支持和信赖。公司深耕单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序,正积蓄着更大的能量,向更广阔的空间、更宽泛的领域拓展。

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