浙江代谢组学 尿液
粪便LC-MS代谢组学研究方法,2022年,复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科唐建国教授课题组在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊发表的题为“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果,通过粪便微生物16SrRNA测序和粪便LC-MS代谢组学研究方法,发现了DADS***减轻了DSS诱导下肠道白色念珠菌***,并改变了小鼠肠道微生物群落结构和代谢特征,探究了DADS可以调节肠道微生物群和代谢物并保护肠道屏障的内在机理,为***白色念珠菌***提供了理论依据。代谢组学真正反映业已发生得变化。浙江代谢组学 尿液
GC-MS代谢组学和 LC-MS代谢组学研究:盐度的变化会影响甲壳类动物的生长、***和疾病状态。文章作者通过非靶代谢组学对青蟹适应盐度急性下降过程中的代谢变化进行了研究,利用GC-MS和LC-MS数据联合分析了青蟹应对盐度急性下降情况的主要代谢途径。研究结果表明,在急性低盐胁迫下,青蟹通过甘油磷脂代谢物调节生物膜的结构发生变化,然后通过ABCs转运蛋白运输氨基酸和碳水化合物,实现细胞内外的渗透平衡。此项研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。王春琳课题组深耕青蟹研究,近些年来探索青蟹对环境的适应变化也在各大期刊上发表:项目文章|iTRAQ蛋白组学助力宁波大学越冬期间拟穴青蟹代谢变化研究项目文章|两篇背靠背,王春琳、王欢课题组揭示拟穴青蟹适应盐度骤降的代谢机理浙江代谢组学 尿液读懂代谢组学 代谢组学的研究范畴。
尿液代谢组学研究案例,空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析,其中GC-MS检测102种代谢物,LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性,结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明,Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异,LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物,体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物,使用综合分析获得候选差异代谢物,其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短期PM暴露相关标志物,确定了33种与短期暴露于空气污染相关的差异代谢物,包括8种脂质、6种核酸、7种氨基酸及其衍生物、3种葡萄糖和9种其他代谢物。KEGG通路分析表明,***富集到5种代谢通路,与免疫、炎症、人类的环境压力、缺血和缺氧有关。
**靶向代谢组学研究,中文标题:代谢组学分析揭示了COVID-19新的发展特征研究对象:****患者发表期刊:EuropeanRespiratoryJournal影响因子:16.671发表时间:2021.7.21运用生物技术:LC-MS非靶代谢组学+靶向代谢组学,****已经***了1.6亿多人,并导致全世界数以百万的人死亡;至少部分原因是它的病理生理尚不清楚。所以,识别****的潜在分子机制对于战胜**是至关重要的。此外,代谢物通过在疾病进展过程中获得***的病理生理学意义来反映个体的疾病进展。因此,中国广州多家研究机构的科研人员使用了非靶向和靶向代谢组学分析对****患者所有阶段血清的代谢特征进行了***的观察。与健康对照组比较,在发现队列和验证队列中,轻度、重度和恢复期循环代谢物的变化模式不同,提示糖代谢和尿素循环的代谢重编程是****进展的潜在病理机制。基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学 。
本研究通过LC-MS和GC-MS双平台代谢组学研究方法,对92例样品5个时间点的尿液样品进行分析,分别找到了33种和155种与PM和生物气溶胶相关的差异标志物,结果揭示了年轻健康人在五个不同时间点的尿液代谢谱的动态变化,采用KEGG通路富集分析和时间序列分析确定了与短期共同暴露于空气中PM和生物气溶胶相关的几种潜在代谢物生物标志物,发现短期高浓度暴露于PM可能会导致代谢改变并降低应激***水平,这可能是与下丘脑-垂体-肾上腺和交感-肾上腺-髓质轴的***有关;而生物气溶胶剂则通过***系统对病理性成瘾有重要作用。其中尿液中的16-脱氢孕酮可能是PM暴露的潜在生物标志物;4-羟基苯乙醇可能是生物气溶胶的潜在生物标志物,可用于分别预测或诊断PM或生物气溶胶相关疾病。代谢组学交流—代谢组贴吧—代谢组学咨询。江苏代谢组学与宏基因组分析策略
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GC-MS非靶向代谢组学yan'j2021年11月,上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法,发现了BPF暴露的肠道毒性的特征,探究了可能的发病机理。
中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象:人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:7.963发表时间:2021年11月合作单位:上海交通大学附属新华医院运用生物技术:GC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学、qRT-PCR 浙江代谢组学 尿液
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