吉林蛋白组学概念
本研究采用串联质量标签(TMT)标记的蛋白质组学和平行反应监测(PRM)技术,对莲子脱水过程中的生理调控网络进行了深入研究表明,碳水化合物代谢(包括糖酵解/糖异成、半乳糖代谢、淀粉和蔗糖代谢、磷酸戊糖途径和细胞壁组织)、ER中的蛋白质加工、DNA修复和抗氧化事件对莲种胎脱水有积极的反应。在莲种胚脱水过程中,非酶促抗氧化剂和戊糖磷酸和维生素E作为主要的抗氧化剂,在脱水过程中维持荷花胚胎的REDOX平衡。这些结果为揭示荷花胚胎脱水保护机制的生理学调控网络提供了酶途径在抗氧化保护中起着主要作用。应激生理学检测表明,H2O2是诱发氧化应激损伤的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的见解。蛋白组+代谢组+脂质组-数据分析系统。吉林蛋白组学概念
蛋白质组学研究方法研究案例:2021年10月,中国科学院上海营养与健康研究所武爱波研究员课题组在Ecotoxicology and Environmental Safety发表了题为“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通过转录组学和蛋白质组学研究方法,探究了脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)对成肌细胞分化的影响,发现了DON处理使得细胞骨架蛋白和细胞外基质蛋白表达下调,并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路的机理,为食品和饲料污染的防治提供了理论依据。江西蛋白组学代谢组学关联分析蛋白验证新技术-PRM,平行反应监视蛋白组学。
并通过蛋白质组学和时间序列分析在血管生成中发挥着关键作用(图3E)。时间序列分析表明,外出刺激后ICAM1表达增加(图3F)。此外,当ICAM1在HBMECs中时,血管形成容量***降低(图3I/j)。这些结果表明M-Exos通过增加HBMECs中的ICAM1的表达来调节血管生成。蛋白质组学分析发现的差异表达蛋白与多种神经退行性疾病相关,包括帕金森病、阿尔茨海默病和亨廷顿病(图6B)。本研究运用蛋白质组学,蛋白质印迹,免疫荧光、免疫组化等分析了源自MSCs的外泌体可以使人脑微血管内皮细胞(HBMECs)保持活跃状态,有利于血管生成。应用PD小鼠模型发现MSCs的外泌体可以促进PD的恢复。结果可以为MSCs衍生的外泌体在PD***方面提供可能性。
使用TMT标记定量蛋白质组学分析,与GFP-群体相比,在GFP+细胞中TM处理后,线粒体复合物IV的多个亚基被特异性下调,对下调的蛋白质进行基因本体 (GO)分析,显示参与线粒体电子传递链 (ETC) 的通路富集。同时作者还分析了从人 LM2 细胞系中分选的 LM2 GFP+和 GFP- 细胞,在 TM 处理 48 小时后蛋白组学分析,揭示了GFP+细胞优先富集,同时揭示了线粒体 ETC 相关的通路。因此,TM 处理特别影响具有更高细胞内铜水平的 SOX2/OCT4+ 细胞中的线粒体 ETC 通路。蛋白质组学分析确定了富含线粒体功能的途径。细胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一种线粒体金属酶,是线粒体ETC的终末酶。欧易鹿明生物蛋白质研究技术。
TMTpro-16plex等标记试剂已经发布一年,广受科研工作者喜爱。但是,对于6组3重复、3组6重复的实验设计,16plex却难以满足。TMTpro™ 18-plex标记蛋白组会是更好的选择方式。其中基于质谱仪平台的蛋白组学近年来备受青睐,稳定同位素标记策略也被广泛应用于多重定量蛋白质组学中。鹿明生物推出Thermo Scientific™ TMTpro™ 18-plex标记蛋白组,18个样本以内,可实现一次标记和分级,避免了多批次标记引入的批次效应,能***提升样本的数据质量。同时对更多蛋白质鉴定和定量,提供了样本的多通路处理水平。这个技术可谓是2021年的又一创新技术。蛋白质组学,修饰蛋白质组,蛋白·修饰·代谢。江苏蛋白组学go分析
蛋白质组学-鹿明生物丨欧易生物。吉林蛋白组学概念
随着质谱技术的飞速发展,特别是离子淌度的引入,增加了一个新的分离维度,将蛋白质组研究推进到全新的“4D蛋白质组”层面,打破了基于质谱的蛋白质组学研究的瓶颈,大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的***提升,可以更好的解决大队列、复杂体系以及微量样本的检测。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配备了***一代双TIMS分析器,离子容量可提高三倍。经过简化的离子透镜比较大限度地提高了离子传输效率和灵敏度,为4D-多组学建立了新的标准。CCS 值的加入让组学结果更精细,也使timsTOF Pro 2成为转化组学应用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能够实现少量细胞群或生物穿刺样本等低样本量的蛋白组定量分析以及磷酸化蛋白质组学分析,在短梯度下实现蛋白深度覆盖。吉林蛋白组学概念
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