上海市单细胞测序高通量测序技术

时间:2022年08月18日 来源:

转录组测序,项目介绍:RNA-Seq,是基于新一代测序技术的转录组学研究方法:首先提取生物样品的全部转录的 RNA 并进行 mRNA 富集,然后反转录为 cDNA 后进行新一代高通量测序,在此基础上进行短片段拼接组装,从而获得一个个单独转录本,进而可以对该生物样品当前状态的基因表达状况有全局了解。对不同阶段或部位生物样品的转录组进行 比较分析,则可以在转录层面得到基因表达水平的变化,针对关键基因则可以进行代谢通路(Pathway)的构建。如果是水体样品,建议采用滤膜过滤后,将滤膜寄送来生工。上海市单细胞测序高通量测序技术

单细胞转录组测序中,制备高质量的单细胞悬液至关重要。而悬液制备好后质检结果的判断也是大家需要掌握的必备技能。单细胞悬液质检关卡究竟是怎样运作的呢?单细胞悬液质控要求:•细胞浓度:700-1200cells/µl;•细胞活率>80%(当细胞悬液活率低于70%时建议进行去除死细胞处理);细胞团及碎片杂质<5%(无细胞粘连,无明显的细胞碎片和细胞团,并保证细胞的完整性);•细胞状态:细胞直径在7-40um之间(细胞直径过大则建议进行抽核处理);•不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子。羟甲基化测序高通量测序原理如果你的样品是质粒或者是菌液,那为什么不试试我们的KBSeq呢?

IlluminaHiSeq2500/4000可以运行PE150/PE250模式,可以承担转录组测序、人基因组重测序、外显子捕获测序、宏基因组测序、微生物分类测序等服务;IlluminaMiSeq运行PE300模式,可以承担细菌基因组重测序/Denovo测序、微生物分类测序、扩增子测序、核酸适配体测序等服务;LifeIontorrentPGM运行314、316、318芯片,可以承接扩增子测序、靶区域测序、基因组重测序服务;PacBioSequel/RSII该测序平台读长超长,平均可达10kb以上,主要承接细菌基因组完成图测序、***基因组精细图测序、全长转录本测序等服务;

生工优势:1.生工高通量测序部拥有丰富的样品处理经验,日均处理样品200余例,涵盖污泥、粪便、海底沉泥、水体滤膜、植物组织、动物组织/细胞等样品,省去您处理样品的繁琐过程。2.生物信息分析经验丰富,可以满足客户标准分析到定制分析作图的需求。且生工一直秉持只要生工已经标准化的分析内容(以生工分析报告模板为准),全部无费用。3.生工生物拥有生命科学领域较全的产品及服务体系,可以承接从分子到蛋白各个层级的实验项目。一站式解决问题。ChIP项目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0检测为准。其余具体咨询生工高通量测序部。

KBSeq全质粒测序跟一代测序相比有什么优点呢?一代测序:1.数据质量,套峰,双峰等情况,需要人工分析校对。2.测序长度,1 kb。3.成本,低。4.样本用量,100 ng。5.精确度,70-90%。6.测序能力,需要测序引物,只能测测序引物间的片段序列。7.通量低,(与读长有关)。8.实验周期,如果片段长度超过5K,测通可能需要15天左右。对于测序长度较长,如果我们用Sanger测序往往需要花费大量的时间,而我们KBSeq全质粒测序则只需要5-7天,就可以测通片段长度小于30kb以下的片段。KBSeq全质粒测序对于样本的量,要求的也比较少,比如质粒我们的样本要求DNA的浓度需≥ 1 ng/μl, 体积需≥5 μl,如果比较珍贵的样本或者是样本比较难提取的,KBSeq就更为适合了。目前,生工生物已开展10x单细胞转录组测序(scRNA-seq)服务,如果正好您有需要,那就快快来call我们吧!上海宏全基因组高通量测序原理

高通量测序技术是可以平行对数百万甚至数十亿条序列测序的技术。上海市单细胞测序高通量测序技术

怎样通过血球计数板进行质检操作呢?将血球计数板擦拭干净,取干净的盖玻片盖在计数板上;将细胞悬液混匀(或10µl台盼蓝+10µl细胞悬液),吸出10µl悬液至计数板上盖玻片的一侧使细胞核悬液铺满盖玻片和计数板之间;在显微镜下分别对V1/V2/V3/V4四个计数区域进行计数;按细胞计数公式进行计算,计算公式:细胞总数={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*悬液体积*稀释倍数,V1/V2/V3/V4为各个计数区的细胞数目,细胞活率=活细胞数目/总细胞数目*100%。上海市单细胞测序高通量测序技术

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