烈冰生物空间转录组平台

时间:2022年08月20日 来源:

当前的技术主要有四种策略:1、基于组学实验结合空间重建的计算策略这种计算方法可以充分利用内在基因表达模式或共表达的趋势,从单个细胞的大量转录组数据中重构细胞间的环境。然而,这些推论方法在某些情况下只呈现空间趋势或特定组织的总体布局。2激光切割与NGS测序结合的策略基于LCM的转录组学或基因组学成功地获得了单个细胞的空间转录组,尽管其通量很低,但是在可以标记成千上万个单个细胞位買的多路复用条形码策路可行之前,将少量细胞的数据粗略地整合到构成组织的巨大背景中,可能具有一定价值。3、基于荧光物质原位的转录组学基于图像的原位转录组学在很大程度上增加了可检测区域,但也存在一些问题,例如几种smFISH方法很难从包括信号干扰、转录本积累等复杂背景中提取单个细胞。4、基于身核苷酸的空间条码加上NGS测序。烈冰测序数据分析平台,不依赖已有物种信息,可研究非模式物种,针对不同平台的数据,制定多套流程;烈冰生物空间转录组平台

RNA测序(RNA-seq)是转录组学研究的重要工具,也是生命科学领域常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量的局限性,转录组学有以下优势:1)能够动态考察细胞基因组的表达,多维度地反映差异变化;2)可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA,研究其结构以及在细胞生命活动中的重要调控作用;3)与蛋白组学研究相互补充,多角度呈现细胞水平的变化信息。作为转录组学研究的技术基础,RNA测序技术也在不断地更新迭代,现如今更大通量、更深精度的测序为众多科研和医学工作者提供了丰富的工具和探索真理的手段。青岛高通量测序空间转录组商业化服务烈冰全线实验平台满足超深度、大规模发现和复杂疾病研究的测序。

单细胞测序是指针对单个细胞进行全转录组测序分析,可精确地描述每一个细胞的状态,在异质性发育过程中具有不可忽视的应用价值。然而,单细胞测序无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息,对于揭示发育过程、病理微环境都存在很大的局限性。空间转录组测序以点阵形式记录病理切片细胞的空间信息并进行测序,可以精确指示点阵内的全部基因表达情况。空间转录组测序的加入,无疑让单细胞测序如虎添翼,更精确地勾勒了组织水平的异质性。

烈冰配置了LEICA CM1950冷冻切片机,搭配切片经验丰富的实验团队,可以提供一致性更高、实验操作更精细的冷冻切片准备方案,保持密切高效的沟通,设计更适合的实验方案,确保每一个实验细节有效进行;烈冰升级配置尼康相差显微镜和CCD成像系统,更高清分辨率解析组织切片原始图像信息,10X,20X,40X,60X更多物镜选择,为不同大小的样本提供更清晰的图像,更精细的图像信息采集、拼接策略,为样本内微小区域的组织学提供更清晰的影像;空间转录组测序可识别重要的转录因子,进行谱系和发育追踪。

解决空间转录组测序数据分析中由于超大数据量、超高的质控要求以及繁多分析需求而引起的分析困难,做到快速可定制化完成空间转录组分析;拥有行业先进的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的数字切片扫描仪,可以同时实现明场与荧光场下冷冻切片的快速扫描成像;Z-Stack多层聚焦扫描及Extended Focus 景深扩展多层融合扫描模式,进一步提升分辨率和清晰度,保证切片高分辨的数字图像信息精细采集;能够满足针对分析结果中感兴趣基因的RNA-FISH验证以及组织切片的免疫组化的高清成像,获取表达与定位信息。高通量测序技术是对传统测序一次翻天覆地的改变,一次对几十万到几百万条核酸序列进行测定。无锡烈冰科技空间转录组测序价格

烈冰空间转录组测序助您深入探究细胞类型特异性和基因调控网络特征。烈冰生物空间转录组平台

转录组分析指对细胞内所有转录产物的分析。转录组测序一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高通量测序。相对于传统的芯片杂交平台,转录组测序无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测,提供更精确的数字化信号,是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。FFPE空间转录组技术原理 为同时获得空间表达和组织学背景信息,该方案首先将FFPE组织切片置于Visium基因芯片上进行组织学染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探针进行表达定量。烈冰生物空间转录组平台

上海烈冰生物医药科技有限公司位于江月路999号奇亚特中心22幢。公司业务分为单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序等,目前不断进行创新和服务改进,为客户提供良好的产品和服务。公司将不断增强企业重点竞争力,努力学习行业知识,遵守行业规范,植根于医药健康行业的发展。烈冰生物秉承“客户为尊、服务为荣、创意为先、技术为实”的经营理念,全力打造公司的重点竞争力。

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