合肥BD空间转录组多组学测序

时间:2022年08月26日 来源:

烈冰生物真正实现空间转录组测序的全程把控,做到从实验设计、空间信息标记、建库测序、定制化分析的全流程一站式服务,助力高分文章发表;专业实验团队保证样本的高度一致性;专业的生物学团队提供个性化的产品应用场景解读、保持对生物学意义的关注;强大的生信分析团队一对一地进行详实科学的实验方案设计并提供多次售后分析;可接受样品类别为冰冻组织:新鲜样本经液氮预冷的异戊烷速冻,-80℃保存OCT包埋组织:新鲜组织异戊烷速冻后进行OCT包埋,或新鲜组织直接OCT包埋后-80℃速冻,注意标明样本方向,样本于-80℃保存样本处理和运输过程需要在低温环境空间转录组测序可识别重要的转录因子,进行谱系和发育追踪。合肥BD空间转录组多组学测序

10x Genomics空间转录组测序技术通过将组织切片的高通量mRNA分析和形态学背景整合,使基因表达谱可以被定位回它们的原始空间位置。传统的空间转录组测序技术局限于冰冻组织切片。10x Genomics推出全新的针对FFPE样本的Visium空间基因表达解决方案,该技术打破从FFPE组织样本中获取空间全部转录组基因表达信息的壁垒,能够从FFPE样本中获取高灵敏度、高特异性的相关基因的表达信息,在形态学背景下实现真正的探索发现,进一步扩展空间生物学的可能性。北京BD空间转录组测序服务公司从样本处理到终端数据分析,只要您需要,烈冰提供全流程的无忧服务。

细胞中基因的表达是严格按照时间和空间顺序发生,因此细胞类型和基因表达具有时间特异性和空间特异性。时间特异性可以通过收集不同时间点的样本进行单细胞转录组测序来分析。但是单细胞测序结果动辄上百G数据量,庞大的数据对于分析平台和分析能力有着很高的要求,单细胞转录组测序(scRNA-Seq)在单细胞悬液制备的过程中破坏了细胞的空间结构,无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息。而空间转录组可以解决这个问题,其以点阵形式记录组织切片细胞的空间信息。

基因测序是基因检测的方法之一,其又叫基因谱测序,是国际上公认的一种基因检测标准。高通量测序技术是对传统测序一次颠覆性的改变,一次对几十万到几百万条核酸序列进行测定,被称为下一代测序技术(nextgenerationsequencing),足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(deepsequencing)。基因测序相关产品和技术已由实验室研究逐渐演变到临床应用,可以说,基因测序技术将是下一个改变世界的技术。测序可准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学重要问题。

烈冰科技作为国内同时拥有10XGenomics和BDRhapsody双分选平台的测序服务商及云计算服务供应商,经过多年实战,拥有丰富的单细胞悬液制备和分选经验,实测BDRhapsody对能够高效捕获粒细胞。针对不同的分选平台、建库方法,实战总结搭建出不同的数据预处理工作流程;烈冰科技NovelBrain®生物大数据平台能有效支撑生命科学研究、医疗健康等领域对大数据分析的需求。完备的高通量测序实验平台,包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC数字切片扫描仪等,配合一支来自海内外名校、多学科交叉型的高素质综合团队,为您的科学研究保驾护航。丰富的测序和数据分析经验,烈冰配套全程个性化、定制化地数据分析服务。西安烈冰科技空间转录组测序

烈冰测序服务已助力300余篇国际主流期刊研究文章发表。合肥BD空间转录组多组学测序

烈冰生物生信分析团队紧追国际前沿、整合添加多项国际期刊认可的空转分析工具,构建一套完整的数据分析流程;精心研发空转结果浏览器,可同步展示空间转录组与单细胞测序分析结果,详细深入地解析空间转录组数据。完成从Rawdata(原始数据)到Spot-Gene的具有定位信息的表达矩阵的过程后,就进入了空转的第二步,去进行Spot的Cluster的过程,熟悉单细胞测序的研究者知道,Cluster在单细胞测序中往往表示为细胞的类型,也就是说能聚在一起采用算法分为一个群体细胞是一个Celltype(当然分情况也会有不同)。而在空转中,也正是由于前面提到了细胞的非单一性,导致了这里的分群并不是单纯的同一细胞类型,而应该认为是具有相同细胞组成的点阵区域,或者说是近似的组织结构区域。合肥BD空间转录组多组学测序

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