浙江单细胞 代谢组学

时间:2022年09月01日 来源:

尿液代谢组学研究案例,空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析,其中GC-MS检测102种代谢物,LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性,结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明,Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异,LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物,体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物,使用综合分析获得候选差异代谢物,其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短期PM暴露相关标志物,确定了33种与短期暴露于空气污染相关的差异代谢物,包括8种脂质、6种核酸、7种氨基酸及其衍生物、3种葡萄糖和9种其他代谢物。KEGG通路分析表明,***富集到5种代谢通路,与免疫、炎症、人类的环境压力、缺血和缺氧有关。以代谢组学为研究对象,探究细胞、组织或其变化规律的科学。浙江单细胞 代谢组学

代谢组学研究:浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展,作者:杨桂玲,王彦华,李健,王豆,鲍志伟,王强(通讯作者),靳远详(共同通讯作者),在Journal of Hazardous Materials期刊发表了题为“Health risks of chlorothalonil, carbendazim, prochloraz, their binary and ternary mixtures on embryonic and larval zebrafish based on metabolomics analysis”的研究成果,通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发育阶段的复杂病理生理和毒性通路。上海代谢组学图怎么解释非靶向代谢组学,靶向代谢组学研究经验。

GC-MS代谢组学和 LC-MS代谢组学研究:盐度的变化会影响甲壳类动物的生长、***和疾病状态。文章作者通过非靶代谢组学对青蟹适应盐度急性下降过程中的代谢变化进行了研究,利用GC-MS和LC-MS数据联合分析了青蟹应对盐度急性下降情况的主要代谢途径。研究结果表明,在急性低盐胁迫下,青蟹通过甘油磷脂代谢物调节生物膜的结构发生变化,然后通过ABCs转运蛋白运输氨基酸和碳水化合物,实现细胞内外的渗透平衡。此项研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。王春琳课题组深耕青蟹研究,近些年来探索青蟹对环境的适应变化也在各大期刊上发表:项目文章|iTRAQ蛋白组学助力宁波大学越冬期间拟穴青蟹代谢变化研究项目文章|两篇背靠背,王春琳、王欢课题组揭示拟穴青蟹适应盐度骤降的代谢机理

非靶向代谢组学研究:2022年5月,欧易/鹿明生物合作客户甘肃省农业科学院程鸿团队和中国农业大学林涛团队在Frontiers in Plant Science期刊发表的题为 “Identification of Key Gene Networks Controlling Soluble Sugar and Organic Acid Metabolism During Oriental Melon Fruit Development by Integrated Analysis of Metabolic and Transcriptomic Analyses”的研究成果,采用非靶代谢组学和转录组研究方法,发现了蔗糖、D-葡萄糖、棉子糖的高积累以及相对较低的柠檬酸和苹果酸可能有助于东方甜瓜“甜宝”的甜味。代谢组学交流—代谢组贴吧—代谢组学咨询。

有机酸靶向代谢组学研究:中文标题:通过代谢和转录组分析的综合分析鉴定控制东方甜瓜果实发育过程中可溶性糖和有机酸代谢的关键基因网络研究对象:甜瓜发表期刊:Front.PlantSci.影响因子:5.753发表时间:2022年5月12日合作单位:甘肃省农业科学院蔬菜研究所,中国农业大学园艺学院运用生物技术:非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学(由欧易生物提供技术支持)在本研究中,通过***的转录组分析和代谢物分析,作者发现东方甜瓜品种'甜宝'(A)的果实含糖量高,'小翠瓜'(B)的果实含糖量低,并同时在不同的发展阶段进行了比较。研究有助于阐明与甜瓜中糖和有机酸代谢相关的基因的动态和差异表达。助力靶向/非靶向代谢组学研究,适用于植物,动物,血清,尿液等多种生物样本。浙江植物代谢组学检测

基于 LC-MS/GC-MS代谢组学 从样本采集到数据分析。浙江单细胞 代谢组学

非靶代谢组学研究:2022年03月,欧易/鹿明生物合作客户重庆医科大学附属第二医院消化内科周智航团队在International Journal of Biological Sciences期刊发表的题为 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果,通过采用非靶代谢组学和基因表达芯片,发现了适应酸性微环境的胰腺导管腺* (PDAC)细胞具有更强的转移和增殖能力。


代谢组学显示适应酸性微环境的 PDAC 细胞中葡萄糖增加、糖酵解减少,而转录组学发现适应酸性微环境细胞中的差异表达基因主要为细胞外基质修饰和 Hippo 信号传导相关基因。MMP1 在在适应酸性微环境细胞中上调**为明显,实验验证了其由 YAP/TAZ 通路介导,而被 AMPK抑制。该研究确认了代谢重编程通过AMPK/ YAP /MMP1轴促进适应酸性微环境的 PDAC 细胞的增殖和转移。 浙江单细胞 代谢组学

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