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调节样本的含水量等因素来优化裂解条件·裂解不充分:增加物理破碎的时间和次数。·检查洗涤液中是否加入乙醇。·洗脱不充分:建议二次洗脱增加产量或提高洗脱体积。问题3:提取的DNA无法扩增怎么办?解决思路:· 检测DNA的浓度:过量的DNA模板也会抑制PCR反应。·样本DNA稀释之后可以扩增:样本中的腐殖酸等抑制物含量高。·确定PCR反应条件是否已优化:退火温度,时间,引物等等。·非特异条带:洗脱液中目的DNA的丰度可能比较低土壤DNA提取哪家靠谱?松江区土壤DNA土壤DNA提取批发
8000rpm离心1分钟,上清DNA溶液转移至新的离心管中。 2)PCR扩增及电泳 PCR扩增使用Identifiler Plus试剂盒,10 μl扩增体系中含4 μl master mix、2 μl primer set、4 μl模板,扩增程序为,95℃,11分钟;94℃,20 秒,59℃,3分钟,30个循环;60℃,10分钟;4℃保存;电泳在ABI 3500XL仪器中进行;电泳上样体系为,1 μl PCR产物,9 μl甲酰胺,其中已加Liz。 实施例2 以硅胶膜提取土壤尿液DNA 1)DNA提取 刮取含有尿液的表层土壤,烘干,取100-200 mg土壤样品,加入样品管中,然后加入400 ul土壤裂解液和20 ul 蛋白酶k,震荡混匀后,75℃加热裂解15分钟;最大转速离心5分钟,将上清液转移至新的样品管中,加入800 ul结合液,混匀;混合液转移至装有硅胶膜的离心柱中,12000rpm离心1分钟;倒弃收集管中废液,加入500 ul漂洗液,12000rpm离心1分钟;倒弃收集管中废液,加入500 ul漂洗液,12000rpm离心1分钟;倒弃收集管中废液,12000rpm离心3分钟,将离心柱转移至新的离心管中,70℃加热3分钟;加入20 ul洗脱液,70℃加热3分钟;12000rpm离心1分钟,丢弃离心柱,离心管中液体即为DNA溶液。 2)浙江土壤基因组土壤DNA提取哪家好上海益启生物的土壤DNA提取询价公司电话。
与现有技术相比,本发明技术克服了样品土壤来源的二氧化硅对DNA的吸附,从而减少了不必要的DNA损失,可达到获取高质量、高产量土壤尿液DNA目的。 附图说明 图1是本发明实施例1中提取的DNA的复合STR扩增图谱。 图2是本发明实施例2中提取的DNA的复合STR扩增图谱。 图3是本发明实施例3中提取的DNA的复合STR扩增图谱。 图4是本发明实施例4中提取的DNA的复合STR扩增图谱。 具体实施方式 下面将结合本发明的附图,对本发明的技术方案进行清楚、完整地描述。
物,微生物残体腐解产生的有机质、土壤生物(固相物质)以及水分(液相物质)、空气(气相物质)及氧化的腐殖质等组成。2011-2018:地球微生物组计。200,000 samples, 500,000 MAGs,amplicon sequencing, metagenomics,and metabolomics. Pis: Jack A. Gilbert,Rob Knight andJanet K. Jansson。目前从土壤样品中提取微生物DNA的方法主要有溶液抽提法、玻璃奶法、柱膜法和磁珠法。随着高通量测序技术的突破和生物信息学的发展,自2012年以来土壤微质量有保障的土壤DNA提取在哪里买您知道吗?
PCR扩增及电泳 PCR扩增使用Identifiler Plus试剂盒,10 μl扩增体系中含4 μl master mix、2 μl primer set、4 μl模板,扩增程序为,95℃,11分钟;94℃,20 秒,59℃,3分钟,30个循环;60℃,10分钟;4℃保存;电泳在ABI 3500XL仪器中进行;电泳上样体系为,1 μl PCR产物,9 μl甲酰胺,其中已加Liz。 实施例3 以玻璃纤维膜提取土壤尿液DNA 1)DNA提取 刮取含有尿液的表层土壤,烘干,取100-200 mg土壤样品,加入样品管中,然后加入400 ul土壤裂解液和20 ul 蛋白酶k,震荡混匀后,75℃加热裂解15分钟;最大转速离心5分钟,将上清液转移至新的样品管中,加入800 ul结合液,混匀;混合液转移至装有玻璃纤维的离心柱中,益启生物是土壤DNA提取的代理商。上海FastDNA Spin Kit土壤DNA提取代理商
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所述pH缓冲剂为Tris-HCl、Tris-醋酸、NaH2PO4-Na2HPO4、KH2PO4-K2HPO4、醋酸-醋酸钠、柠檬酸-柠檬酸钠,所述pH缓冲剂的pH值为7.0-11,推荐的pH缓冲剂为Tris-HCl,推荐的pH缓冲剂的pH值为7.5-8.5; (b)结合液,其组成成分包括表面活性剂、离液盐、pH缓冲剂; 所述表面活性剂为:聚乙二醇辛基苯基醚、TWEEN 20、TWEEN 40、TWEEN 60、TWEEN 80、NP 40中的一种或两种及以上的混合,所述表面活性剂的质量浓度为1-100g/L; 所述离液盐为异硫氰酸胍、盐酸胍、硫氰酸钾、高氯酸钠、碘化钾、碘化钠中的一种或两种及以上的混合,所述离液盐的浓度为3-5 mol/L; 所述pH缓冲剂为Tris-HCl、Tris-醋酸、NaH2PO4-Na2HPO4、KH2PO4-K2HPO4、醋酸-醋酸钠、柠檬酸-柠檬酸钠,所述pH缓冲剂的pH值为4.5-7.0;松江区土壤DNA土壤DNA提取批发
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