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PCR设计引物应遵循以下原则:①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC比较好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。⑤引物3'端的碱基,特别是较末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。⑥引物中有或能加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列比较好有适宜的酶切位点,这对酶切分析或分子克隆很有好处。⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。引物量:每条引物的浓度0.1~1umol或10~100pmol,以比较低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。pcr检测实验数据如何分析?海南常见pcr实验室
PCR实验技术中的RT-PCR一步法和两步法的优缺点介绍:一步法:利用同一缓冲液,在同一体系中加入逆转录酶、引物、Taq酶、4种dNTP直接进行mRNA反转录与PCR扩增。发现Taq酶不仅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反转录酶活性,可利用其双重作用在同一体系中直接以mRNA为模板进行反转录和其后PCR扩增,从而使mRNA的PCR步骤更为简化。所需样品量减少到比较低限度,临床小样品的检测非常有利。用一步法扩增可检测出总RNA中小于1ng的低丰度mRNA.该法可用于低丰度mRNA的cDNA文库的构建及特异cDNA的克隆,并有可能与Taq酶的测序技术相组合,使得自动反转录、基因扩增与基因转录产物的测序在单管中进行。两步法:由于单管反应时RT和PCR都不能在比较好条件下进行并且容易相互干扰,常只适宜用基因特异引物扩增较短的基因,及定量PCR.两步法则是将RT和PCR分别进行,这样使得两个反应充分发挥各自的特点,更为灵活而且严谨,适合那些GC含量、二级结构严重的模板或者是未知模板,以及多个基因的RT-PCR。海南常见pcr实验室做pcr检测,每个样本多少钱?
PCR是一种具有选择性的体外扩增DNA的片段的方法。其特异性由两个人工合成的引物DNA序列决定。所谓引物是指与待扩增核酸片段两端互补的寡核苷酸,其本质是ssDNA(单链DNA)的片段。指在引物指导下由酶催化的对特定模板(克隆或基因组DNA)的扩增反应,是模拟体内DNA复制过程,在体外特异性扩增基因片段的一种技术,在分子生物学中有普遍的应用,包括用于DNA作图、DNA测序、分子系统遗传学等。CR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子拷贝。在实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,加入设计引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。
PCR实验技术中的反向PCR(InversePCR)介绍:反向PCR起初设计用于确定临近未知区域的序列。反向PCR有助于研究一个基因的启动子序列;致*染色体重排如基因融合、异位或转移;及病毒基因的整合。之所以称为反向PCR,是因为引物设计用于向两边延伸而不像常规PCR中朝着彼此延伸。如今,反向PCR常用于定点突变,复制一个具有预期突变的目的质粒。在研究基因组DNA未知序列的传统实验流程中,限制性内切酶消化和连接先于反向PCR,接着对PCR扩增子进行测序。对于gDNA消化,需选择一种限制性内切酶进行酶切以获得合适长度可自连的片段。同时,所选择的内切酶不应该切割已知序列,所以连接发生于侧翼的未知序列之间。使用低浓度的酶切DNA的片段以助于片段自连而非多个片段连接。片段自连完成后,通过反向PCR扩增DNA的位置区域。获得的扩增子两端包含一部分已知序列。之后通过测序以鉴定临近已知序列的未知区域。英瀚斯生物,专业仪器,丰富经验,高质量pcr。
原位PCR就是在组织细胞里进行PCR反应,它结合了具有细胞定位能力的原位杂交和高度特异敏感的PCR技术的优点,是细胞学科研与临床诊断领域里的一项有较大潜力的新技术。原位PCR是Hasse等于1990年建立的,实验用的标本是新鲜组织、石蜡包埋组织、脱落细胞、血细胞等。其基本方法为:1、固定组织或细胞:将组织细胞固定于预先用四氟乙烯包被的玻片上,并用多聚甲醛处理,再灭活除去细胞内源性过氧化物酶。2、蛋白酶K消化处理:用60ug/ml的蛋白酶K将固定好的组织细胞片55℃消化处理2h后,96℃2min以灭活蛋白酶K。3、PCR扩增:在组织细胞片上,加PCR反应液,覆盖并加液体石蜡后,直接放在扩增仪的金属板上,进行PCR循环扩增。有的基因扩增仪带有专门用于原位PCR的装置。4、杂交:PCR扩增结束后,用标记的寡核苷酸探针进行原位杂交。5、显微镜观察结果。pcr检测做不好都有哪些原因?海南常见pcr实验室
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长片段PCR通常指扩增大于5kb的DNA的片段。长片段PCR传统上使用TaqDNA聚合酶(为了快速延伸)和高保真酶(为了准确度)的混合物。随着高合成能力、高保真DNA聚合酶的发明,长片段PCR现在可在短时间内高准确性的完成。通过与一个强DNA结合蛋白的结合,聚合酶可获得高扩增能力,可在短时间内扩增长片段(如>20kbgDNA的片段)。初次之外,极高保真度(如>100xTaq)可确保长片段扩增的低错误率。当扩增>10kb的片段时,PCR实验方案可能需要在以下5个关键位置进行适当优化:确保使用高质量、高纯度的DNA样本。如果DNA聚合酶的热稳定较低,使用更多量的DNA聚合酶以弥补多次循环中的聚合酶活性损失。降低退火和延伸步骤的温度,以助于引物结合。适当增加PCR步骤的时间,以促进模板DNA的完全分离及引物的结合。适当增加PCR延伸时间确保目的片段的全长扩增。海南常见pcr实验室
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