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细胞长满80%瓶底或皿底,换培养液,第二天提取RNA(倒掉培养液,5-10ml冰PBS洗涤细胞2次空干)加1ml冰TRizoL,用力振荡培养瓶使细胞完全脱落,加样器吹打(吸入1.5ml离心管,旋涡振荡10秒,室温静置5分钟)加氯仿200ul,漩涡混匀器振荡10秒,冰盒上静置10分钟(40C,8000rpm,5分钟,)吸取上层水相0.5-0.7ml移至另一1.5ml离心管中,加异丙醇0.5-0.7ml(充分混匀,冰盒上静置10分钟,40C,12000rpm,15分)弃上清,加75%冰乙醇1ml,颠倒混匀数次(40C,12000rpm,15分)弃上清,沉淀快速风干。但不要完全干燥,加DEPC处理去离子水50-100ul取5ul作RNA电泳,5ul作RNA定量,余-800C冰箱保存英瀚斯生物分子生物学平台,配备专业定量pcr仪。广西荧光定量pcr怎么选择
PCR实验技术中的兼并引物PCR(DegeneratePrimer)介绍:兼并引物是指代替编码单个氨基酸所有不同碱基可能性的不同序列的混合物。兼并度越低,产物特异性越强。设计引物时应尽量选择兼并性小的氨基酸,并避免引物3’末端兼并,因为3'端末尾3个碱基的退火足以在错误位点起始PCR;次黄嘌呤可以同所有的碱基配对,降低引物的退火温度。因此,在引物设计时,比较选择兼并性小的氨基酸,并避免引物3'端被兼并,因为3'端末尾3个碱基的退火足以在错误位点起始PCR;次黄嘌呤可以同所有的碱基配对,降低引物的退火温度。实验证明,用脱氧肌苷引物进行PCR,可以代替编码蛋白的多种兼并密码子中的兼并碱基。广西荧光定量pcr怎么选择推荐一些专业做pcr比较好的生物公司。
PCR反应五要素:参加PCR反应的物质主要有五种即:引物(PCR引物为DNA的片段,细胞内DNA复制的引物为一段RNA链)、酶、dNTP、模板和缓冲液(其中需要Mg2+)。引物有多种设计方法,由PCR在实验中的目的决定,但基本原则相同。PCR所用的酶主要有两种来源:Taq和Pfu,分别来自两种不同的噬热菌。其中Taq扩增效率高但易发生错配。Pfu扩增效率弱但有纠错功能。所以实际使用时根据需要必须做不同的选择。模板即扩增用的DNA,可以是任何来源,但有两个原则,1号纯度必须较高,第二浓度不能太高以免抑制。缓冲液的成分较为复杂,除水外一般包括四个有效成分:缓冲体系,一般使用HEPES或MOPS缓冲体系;一价阳离子,一般采用钾离子,但在特殊情况下也可使用铵根离子;二价阳离子,即镁离子,根据反应体系确定,除特殊情况外不需调整;辅助成分,常见的有DMSO、甘油等,主要用来保持酶的活性和帮助DNA解除缠绕结构。
PCR实验技术中的RT-PCR一步法和两步法的优缺点介绍:一步法:利用同一缓冲液,在同一体系中加入逆转录酶、引物、Taq酶、4种dNTP直接进行mRNA反转录与PCR扩增。发现Taq酶不仅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反转录酶活性,可利用其双重作用在同一体系中直接以mRNA为模板进行反转录和其后PCR扩增,从而使mRNA的PCR步骤更为简化。所需样品量减少到比较低限度,临床小样品的检测非常有利。用一步法扩增可检测出总RNA中小于1ng的低丰度mRNA.该法可用于低丰度mRNA的cDNA文库的构建及特异cDNA的克隆,并有可能与Taq酶的测序技术相组合,使得自动反转录、基因扩增与基因转录产物的测序在单管中进行。两步法:由于单管反应时RT和PCR都不能在比较好条件下进行并且容易相互干扰,常只适宜用基因特异引物扩增较短的基因,及定量PCR.两步法则是将RT和PCR分别进行,这样使得两个反应充分发挥各自的特点,更为灵活而且严谨,适合那些GC含量、二级结构严重的模板或者是未知模板,以及多个基因的RT-PCR。哪些公司可以做pcr检测?
PCR设计引物应遵循以下原则:①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC比较好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。⑤引物3'端的碱基,特别是较末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。⑥引物中有或能加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列比较好有适宜的酶切位点,这对酶切分析或分子克隆很有好处。⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。引物量:每条引物的浓度0.1~1umol或10~100pmol,以比较低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。做一次pcr检测要多久?广西荧光定量pcr怎么选择
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PCR实验技术中的5’RACE-PCR介绍:利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准一号链cDNA.利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到一号链的5‘末端时自动加上3一5个(dC)残基,退火后(dC)残基与含有SMART寡核苷酸序列Oliogo(dG)通用接头引物配对后,转换为以SMART序列为模板继续延伸而连上通用接头(figure2)。然后用一个含有部分接头序列的通用引物UPM(universalprimer,UPM)作为上游引物,用一个基因特异引物2(GSP2genespecificprimer,GSP)作为下游引物,以SMART一号链cDNA为模板,进行PCR循环,把目的基因5‘末端的cDNA的片段扩增出来。比较终,从2个有相互重叠序列的3'/5‘-RACE产物中获得全长cDNA,或者通过分析RACE产物的3‘和5‘端序列,合成相应引物扩增出全长cDNA.广西荧光定量pcr怎么选择
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