宁波分子生物学数字PCR设计公司
Real-time PCR:基线(baseline):通常是3-15个循环的荧光信号,同一次反应中针对不同的基因需单独设置基线。阈值(threshold):自动设置是3-15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。手动设置:置于指数扩增期,刚好可以清楚地看到荧光信号明显增强。同一次反应中针对不同的基因可单独设置阈值,但对于同一个基因扩增一定要用同一个阈值。Ct值:与起始浓度的对数成线性关系,分析定量时候一般取Ct:15-35.太大或者太小都会导致定量的不准确。相对定量:通过与内参基因Ct值之间的相差来计算基因之间的表达差异,一般是2-△△Ct。或者是考虑扩增效率的Pfaffl法。Real-time PCR技术已经被普遍用于监测细胞mRNA表达量的变化。宁波分子生物学数字PCR设计公司
Real-time PCR实验注意事项-防止RNA酶污染的措施:1.所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6hr或更长时间。2.塑料器皿可用0.1%DEPC水浸泡或用氯仿冲洗(注意:有机玻璃器具因可被氯仿腐蚀,故不能使用)。3.有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3%H2O2室温10min,然后用0.1%DEPC水冲洗,晾干。4.配制的溶液应尽可能的用0.1%DEPC,在37℃处理12hr以上。然后用高压灭菌除去残留的DEPC。不能高压灭菌的试剂,应当用DEPC处理过的无菌双蒸水配制,然后经0.22μm滤膜过滤除菌。5.操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中手套要勤换。6.设置RNA操作专业使用实验室,所有器械等应为专业使用。南京分子生物学Real-time PCR供应商Real-time PCR提高实验的重复性。
Real-time PCR从用途上分可以分为定性分析和定量分析:定性分析指的是用于分析待检测的样本中是否存在我们想要检测的成分,即待检测成分有无的分析。通常,定性分析可以应用于病毒以及病原菌的检测,物种鉴定以及基因分型等。病毒及病原菌检测,如SARS、H1N1病毒,都可以通过Real-time PCR的方法进行高灵敏度的检测,定性分析样本是否已被病毒传播。物种鉴定如我们国家的一些检验检疫机构,想要检测进口的牛肉制品中是否含有鸡源、猪源或鸭源等成分,或者用于检测羊奶中是否会掺有牛奶等等,可以通过Real-time PCR的方法进行检测。基因分型,如啤酒型,肥胖型基因的检测,就是Real-time PCR在基因分型方面的应用。
Real-time PCR实验常用的RNA酶抑制剂:1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。2.异硫氰酸胍:目前被认为是较有效的RNA酶抑制剂,它在裂解组织的同时也使RNA酶失活。它既可破坏细胞结构使核酸从蛋白中解离出来,又对RNA酶有强烈的变性作用。3.氧钒核糖核苷复合物:由氧化钒离子和核苷形成的复合物,它和RNA酶结合形成过渡态类物质,几乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制剂(RNasin):从大鼠肝或人胎盘中提取得来的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一种非竞争性抑制剂,可以和多种RNA酶结合,使其失活。5.其它:SDS、尿素、硅藻土等对RNA酶也有一定抑制作用。Real-time PCR与普通PCR的实验目的不同,所以对引物的设计要求也不同。
Real-time PCR的染料法和探针法的选择:进行mRNA表达量的测定,采用染料法是比较经济实惠的;染料法可以通过比较熔解曲线的熔解峰位置得到产物特异性的情况;目的基因和内参基因分管检测,染料法可以选用Realtime染料PCRPreMIX,探针法主要应用于病毒RNA的检测;以及单位点突变(SNP);多基因的合并检测,探针法还可用于同一个反应中同时检测目的基因和内参基因的情况;而染料法则必须分管检测。Real-time PCR:实时荧光定量PCR技术(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction简称Real-time PCR)是在定性PCR技术基础上发展起来的核酸定量技术。实时荧光定量在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,使每一个循环变得“可见”,之后通过Ct值和标准曲线对样品中的DNA(orcDNA)的起始浓度进行定量的方法。使用Real-time PCR进行基因检测,被普遍应用于病毒和病原菌检测基因检测等领域。南京分子生物学Real-time PCR供应商
Real-time PCR从用途上分可以分为定性分析和定量分析。宁波分子生物学数字PCR设计公司
聚合酶链式反应生物学研究的历史中占据了重要的地位。以此为基础发展出包括Real-time PCR在内的多项应用技术。自诞生后Real-time PCR技术持续发展,从简单的增扩到整个PCR过程,Real-time PCR表现出比PCR更敏感、更明确的定量分析特性和对识别等位基因的能力。不少人以为real-time就是意味着可以在显示器上看到每个循环增扩曲线的增长。事实并非如此,早期的软件不能在运行期间提供可视化的增扩曲线。主要是因为SDS软件采用整个平台较终的数据执行数据分析工作,而不是分析每个单独的反应循环。对某些设备来说,必须向分析软件提供实时的数据,有些设备则不需要。前一种设备允许软件实时跟踪每个加样口的增扩曲线,同时显示在电脑屏幕上。宁波分子生物学数字PCR设计公司
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