上海FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学

Blinatumomab（一种对 CD19 和 T 细胞标志物 CD3 具有特异性的 BiTE 分子）的研究级生物仿制药在室温下用固定化过夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通过LC-MS对消解样品的直接分析表明，所有三个连接子区域均被消解，α-CD3 VL和VH链洗脱为一个色谱峰，α-CD19 VH和VL链作为单独的峰洗脱。来自连接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 结构域的小峰显示该短连接子未完全消化，表明 GlySERIAS 对短连接子的活性较低。与完整的蛋白质分析相比，四个结构域的分离提供了具有单同位素分辨率的高质量光谱。可以观察到每个结构域的几个不同变体，剩余的连接子残基数量不同。在色谱分离过程中，α-CD3 VH结构域无法从α-CD19 VH结构域完全基线分离，导致在相关质谱中观察到一些共洗脱。四个结构域的分离产生了有关在完整蛋白质水平上鉴定的蛋白质修饰位置的信息。例如，在完整水平上鉴定的 37 Da 的蛋白质修饰被分配给 α-CD3 VH 链。此外，240Da 和 320da 的两个修饰分别被分配给 α-CD3 VL 结构域。后者还含有一个带有五六个组氨酸残基的 His 标签。这些数据证明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 对包含多个柔性连接子蛋白进行质量控制的中级工作流程的强大功能。Genovis还提供了在琼脂糖树脂上固定化的酶，在随时可用的离心柱中，这可以大限度地减少在样品中残留的酶。上海FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学

与IdeS不同，Genovis的GlySERIAS是一种独特的酶，可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白连接子，例如Gly4Ser和GlyxSery（GS）以及聚甘氨酸（G）接头。该酶能够分离多功能融合蛋白的各个结构域，以促进表征并增加对这些分子的理解。融合蛋白的中级分析既可以降低整体样品的复杂性，又可以对翻译后修饰进行结构域特异性鉴定和监测。为了改善连接子的去除，Genovis建议使用GlySERIASImmobilized。对于连接子表征，我们推荐GlySERIAS冻干。具有柔性接头的独特酶消化融合蛋白；中级方法可降低融合蛋白表征的复杂性；复杂融合蛋白的可靠且可重复的消化。Genovis的GlySERIAS酶切由甘氨酸或甘氨酸和丝氨酸残基的重复序列组成的柔性连接子。该酶在天然反应条件下具有活性，能够对复杂的融合蛋白进行中级表征。连接子区域同时在多个位点被消化，导致先前连接的组分分离。活性发生在pH7.6下，孵育时间可以根据所需的产物而变化。GlySERIAS是从噬菌体K克隆而来的，在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签，分子量为18kDa。河南GingisREXIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶IgASAP酶是降低zhiliao性IgA候选物样品复杂性并明显简化IgA分析表征的宝贵工具。

大多数商业zhiliao性抗体属于IgG类，在Fc结构域中含有N-聚糖。一个重要的关键质量属性是糖基化曲线，因为它会影响稳定性、溶解度、药效学和药代动力学特性。这种翻译后修饰可能发生在生物工艺开发和制造过程中，因此需要密切监测。Genovis的FabRICATOR（IdeS）酶已成为一种被接受的快速表征单克隆抗体（mAb）的分析工具。FabRICATOR在铰链下方消化IgG，产生F（ab'）2和Fc/2片段。单个FabRICATOR消解位点和质量谱的后续精度使Fc糖基化谱能够检测，从而可以监测批次间的一致性和其他关键质量属性。

与IdeS不同，在蛋白质zhiliao药物的质量控制过程中，详细分析和识别质量属性非常重要。对于具有柔性连接子的融合蛋白疗法，这包括确认连接蛋白的质量以及蛋白质接头的质量。使用 Genovis的GlySERIAS 的连接子酶切可以通过分离连接的蛋白质结构域来帮助这种质量控制。然而，连接子中的大量甘氨酸残基提供了酶的许多潜在消化位点，导致连接子内多个位点同时水解。消化的产物通常由连接蛋白的几种变体组成，并保留不同程度的连接子。虽然观察到的异质性通常不会对蛋白质亚基的详细表征产生负面影响，但有助于直接表征连接子，但有时需要更均匀的消化产物来详细分析单个蛋白质结构域。这正是您使用FabRICATOR（IdeS蛋白酶）可以得到的。

在Genovis，我们的策略是帮助客户进行中级（或亚基）分析，这是我们的工作，特别是我们的蛋白质酶切产品。完整质量和肽图谱是蛋白质表征的常用方法，我们发现，与简单但信息有限的完整质量和高度复杂但信息丰富的肽图谱相比，中级方法具有优势。通过执行中级描述，您可以生成从完整的质量实验中获得的所有信息，具有额外的优势。在对抗体进行完整质量分析时，很难明确地识别某些修饰。质谱仪器正在改进，可以更有效地分析更大的分子，但通过使用我们的SmartEnzymes，如IdeS，可以将抗体分解成更小的片段，这提高了这些实验可以执行的分辨率，因此，增加了鉴定修饰的信心。此外，你不仅能够更好地识别修改，而且你能够将它们定位到蛋白质上的单个结构域，这是你在完整水平上无法做到的。剩下一个连接子残基（甘氨酸残基），这有助于识别位于Fc区域的修饰。海南FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学

zhiliao性抗体和基于IgG的生物制药的结构表征和监测关键质量属性。上海FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学

Genovis的FabRICATOR MagIC自动样品制备可用于分析和监测不同的CQA。mAb在生产或储存过程中的氧化就是这样一种CQA，可能会影响zhiliao产品的质量。为了展示FabRICATOR MagIC如何解决这个问题，对6种mAb的混合物进行强制降解（室温下3个月），并通过反相LC-MS进行分析。当在完整水平上分析mAb时，可以检测到mAb5丰度的显着差异，同时出现许多新的峰。然而，无法获得可靠的质量数据。使用FabRICATOR MagIC，mAb5变化的来源在Fab区域内。随后还原为 Fc/2、LC 和 Fd' 片段，可以识别差异是由于 mAb5 Fd' 片段上的色氨酸氧化，通过形成氧代内酯 （+14 Da） 和二氧代内酯 （+30 Da） 以及 mAb5 LC （-18 Da） 的琥珀酰亚胺化来揭示。此外，还可检测到mAb3轻链的异构化。该示例说明了FabRICATOR MagIC在mAb中级分析中的强大功能，它创建的片段足够小，可以精确定位特定的修饰，而无需耗时耗费资源的肽图分析，所有这些都以相对较少的手动操作时间快速完成。上海FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白组学