深圳细胞数字PCR设计公司
Real-time PCR链式反应的特点:灵敏度高:PCR产物的生成量是以指数方式增加的,能将皮克(pg=10-12)量级的起始待测模板扩增到微克(μg=-6)水平。能从100万个细胞中检出一个靶细胞;在病毒的检测中,PCR的灵敏度可达3个RFU(空斑形成单位);在细菌学中很小检出率为3个细菌。简便、快速:PCR反应用耐高温的TaqDNA聚合酶,一次性地将反应液加好后,即在DNA扩增液和水浴锅上进行变性-退火-延伸反应,一般在2~4小时完成扩增反应。扩增产物一般用电泳分析,不一定要用同位素,无放射性污染、易推广。纯度要求低:不需要分离病毒或细菌及培养细胞,DNA粗制品及RNA均可作为扩增模板。可直接用临床标本如血液、体腔液、洗嗽液、毛发、细胞、活组织等DNA扩增检测。武汉微量Real-time PCR供应商聚合酶链反应的试剂应分配到一次性的等分试样中。聚合酶链式反应准备:PCR所用的酶主要有两种来源:Taq和Pfu,分别来自两种不同的噬热菌。深圳细胞数字PCR设计公司
Real-time PCR相对定量中的标准曲线法如何进行:主要是相对定量标准品的制作,一般有三种方法:1、比较复杂的方法:质粒,采用Biotnt提供内参基因的特异性Real-time PCRmRNA引物,对目的基因进行Real-time PCR实验,得到PCR扩增产物;PCR扩增产物转入质粒中,得到相对定量的标准品;2、一般采用的方法1:比较强的CDNA模板,3、一般采用的方法:PCR扩增产物,如果在方法2中找不到比较强的CDNA模板,则选用PCR产物作为相对定量的标准品也是可以的;需要注意的事项是:PCR产物浓度很高,而Real-time PCR的产物片段比较短,容易在稀释的过程中造成PCR污染,要注意操作。深圳细胞数字PCR设计公司像所有酶一样,DNA聚合酶也容易出错,这反过来会导致产生的PCR片段发生突变。
Real-time PCR从用途上分可以分为定性分析和定量分析:定性分析指的是用于分析待检测的样本中是否存在我们想要检测的成分,即待检测成分有无的分析。通常,定性分析可以应用于病毒以及病原菌的检测,物种鉴定以及基因分型等。病毒及病原菌检测,如SARS、H1N1病毒,都可以通过Real-time PCR的方法进行高灵敏度的检测,定性分析样本是否已被病毒传播。物种鉴定如我们国家的一些检验检疫机构,想要检测进口的牛肉制品中是否含有鸡源、猪源或鸭源等成分,或者用于检测羊奶中是否会掺有牛奶等等,可以通过Real-time PCR的方法进行检测。基因分型,如啤酒型,肥胖型基因的检测,就是Real-time PCR在基因分型方面的应用。
Real-timePCR技术服务聚合酶链式反应的试验污染:实验室中克隆质粒的污染:在分子生物学实验室及某些用克隆质粒做阳性对照的检验室,这个问题也比较常见。因为克隆质粒在单位容积内含量相当高,另外在纯化过程中需用较多的用具及试剂,而且在活细胞内的质粒,由于活细胞的生长繁殖的简便性及具有很强的生命力。其污染可能性也很大。污染的监测:一个好的实验室,要时刻注意污染的监测,考虑有无污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染。重复性试验。选择不同区域的引物进行PCR扩增。嵌套聚合酶链反应:通过减少DNA非特异性扩增的背景,提高DNA扩增的特异性。
为了便于对所检测样本进行比较,在real-timeQ-PCR反应的指数期,首先需设定一定荧光信号的域值,一般这个域值(threshold)是以PCR反应的前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号(baseline),荧光域值的缺省设置是3~15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。如果检测到荧光信号超过域值被认为是真正的信号,它可用于定义样本的域值循环数(Ct)。Ct值的含义是:每个反应管内的荧光信号达到设定的域值时所经历的循环数。研究表明,每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,因此只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。流聚合酶链反应将溶液置于热梯度下,而不是反复加热和冷却聚合酶链反应混合物。宁波特殊样本荧光定量PCR服务
Real-time PCR在实验过程中为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照。深圳细胞数字PCR设计公司
PCR的反应条件:dNTP浓度过高会加快反应速度,但同时还可以增加碱基的错误掺入率。引物浓度过高会引起错配和非特异性产物扩增。TaqDNA聚合酶浓度过高会引起错配和非特异性产物扩增,低则合成产物量减少。TaqDNA聚合酶无校正功能,掺入错误率达2*E-4个核苷酸,一个30个循环的扩增反应0.1%-0.25%总错误率。在90~95度下可使整个基因组的DNA变性为单链。一般94~95度30~60s。时间过长使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破坏增多。DNA很快冷却到40~60度使引物和模板结合。引物长度在15~25时退火温度。热启动/冷完成聚合酶链反应是通过新的杂合聚合酶实现的,这些酶在环境温度下不活跃。深圳细胞数字PCR设计公司
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