莆田血液PCR检测技术方案
PCR的反应条件:dNTP浓度过高会加快反应速度,但同时还可以增加碱基的错误掺入率。引物浓度过高会引起错配和非特异性产物扩增。TaqDNA聚合酶浓度过高会引起错配和非特异性产物扩增,低则合成产物量减少。TaqDNA聚合酶无校正功能,掺入错误率达2*E-4个核苷酸,一个30个循环的扩增反应0.1%-0.25%总错误率。在90~95度下可使整个基因组的DNA变性为单链。一般94~95度30~60s。时间过长使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破坏增多。DNA很快冷却到40~60度使引物和模板结合。引物长度在15~25时退火温度。热启动/冷完成聚合酶链反应是通过新的杂合聚合酶实现的,这些酶在环境温度下不活跃。聚合酶链式反应中要确保反应缓冲液融化完全并彻底混匀。莆田血液PCR检测技术方案
实时定量PCR的系统构成及工作原理:荧光定量检测系统由实时荧光定量PCR仪,实时荧光定量试剂,通用电脑,自动分析软件等构成。设备由荧光定量系统和计算机组成,用来监测循环过程的荧光。与实时设备相连的计算机收集荧光数据。数据通过开发的实时分析软件以图表的形式显示。原始数据被绘制成荧光强度相对于循环数的图表。原始数据收集后可以开始分析。实时设备的软件能使收集到的数据进行正常化处理来弥补背景荧光的差异。正常化后可以设定域值水平,这就是分析荧光数据的水平。杭州分子生物学RT-PCR检测技术供应商Real-time PCR可看作是生物体外的特殊DNA复制。
Real-time PCR:1.DNA或RNA的定量分析:Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的检测,转基因动植物转基因拷贝数的检测,RNAi基因失活率的检测等;2.基因表达差异分析:例如比较经过不同处理样本之间特定基因的表达差异(如药物处理、物理处理、化学处理等),特定基因在不同时相的表达差异以及cDNA晶片或差显结果的确证;3.基因分型:例如SNP检测,甲基化检测等。Real-time PCR常用的两种方法分别为Sybrgreen(萤光染料掺入法)和Taqmanprobe(探针法)。
聚合酶链反应注意事项:在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂;为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照;内参的设定主要为了用于靶RNA的定量。常用的内参有G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin(β-肌动蛋白)等。其目的在于避免RNA定量误差、加样误差以及各PCR反应体系中扩增效率不均一各孔间的温度差等所造成的误差;PCR不能进入平台期,出现平台效应与所扩增的目的基因的长度、序列、二级结构以及目标DNA起始的数量有关。故对于每一个目标序列出现平台效应的循环数,均应通过单独实验来确定;防止DNA的污染:采用DNA酶处理RNA;在可能的情况下,将PCR引物置于基因的不同外显子,以消除基因和mRNA的共线性。聚合酶链反应可以选择这些突变来理解蛋白质是如何完成其功能的,并改变或改善蛋白质功能。在不同的PCR反应管中加入已定量的内标和引物,内标用基因工程方法合成。
Real-time PCR实验常用的RNA酶抑制剂:1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。2.异硫氰酸胍:目前被认为是较有效的RNA酶抑制剂,它在裂解组织的同时也使RNA酶失活。它既可破坏细胞结构使核酸从蛋白中解离出来,又对RNA酶有强烈的变性作用。3.氧钒核糖核苷复合物:由氧化钒离子和核苷形成的复合物,它和RNA酶结合形成过渡态类物质,几乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制剂(RNasin):从大鼠肝或人胎盘中提取得来的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一种非竞争性抑制剂,可以和多种RNA酶结合,使其失活。5.其它:SDS、尿素、硅藻土等对RNA酶也有一定抑制作用。所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团。无锡实时Real-time PCR设计公司
实时荧光定量PCR无需内标是建立在两个基础之上的。莆田血液PCR检测技术方案
Real-time PCR双荧光标记探针设计原则:具体的其他要求可以具体联系设计公司,拿到合成好的引物,需要先确认引物的性能。可以用这对引物先扩增梯度稀释后的标准品(标准品介绍见后续内容)。由不同梯度标准品的加量和其对应的Ct值,描绘出一条标准曲线。这里要注意根据标准曲线得到的参数是非常重要的。引物性能确认:1.决定系数R2大于0.98,越接近于1,结果越可靠。2.扩增效率一般要求在0.8-1.2,越接近于1,越好。3.检测的灵敏度,必须确认,通常要求35个循环以内,一般可以得到比较好的定量结果,30个循环以内,没有非特异性扩增产生。4.NTC是必须要确认的,通常要求30个循环内没有引物二聚体产生。莆田血液PCR检测技术方案
上海司鼎生物科技有限公司成立于2016-06-07,位于放鹤路1088号,公司自成立以来通过规范化运营和高质量服务,赢得了客户及社会的一致认可和好评。公司主要产品有免疫印迹(WB)技术服务,荧光定量PCR技术服务,膜片钳电生理技术服务,在体光纤成像记录技术服务等,公司工程技术人员、行政管理人员、产品制造及售后服务人员均有多年行业经验。并与上下游企业保持密切的合作关系。司鼎;OriCell集中了一批经验丰富的技术及管理专业人才,能为客户提供良好的售前、售中及售后服务,并能根据用户需求,定制产品和配套整体解决方案。上海司鼎生物科技有限公司通过多年的深耕细作,企业已通过医药健康质量体系认证,确保公司各类产品以高技术、高性能、高精密度服务于广大客户。欢迎各界朋友莅临参观、 指导和业务洽谈。
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