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当机体收到年龄、环境、饮食、用药等因素影响时,就会引起肠道微生态失衡,又称为肠道菌群失调,主要是指由于肠道菌群组成改变、细菌代谢活性变化或菌群在局部分布变化而引起的失衡状态;表现为肠道菌群在种类、数量、比例、定位转移(移位)和生物学特性上的变化。新一代测序技术下的16SrRNA测序由于具有能够提供全的菌群分类及丰度数据,价格合理,检测周期短等明显优势,已经成为科研人员及临床研究者研究疾病与肠道菌群关系的重要工具。上海沃本——您身边的肠道菌群检测选择;广东亚健康人群菌群检测私人定制
来自北京协和医院的张烜团队与华大基因的揭著业团队在JournalofAutoimmunity上发表的一项研究,①对比分析85名强直性脊柱炎(AS)患者及62名健康人的肠道菌群,发现惰性真杆菌等5种菌种在AS患者中富集;②在AS患者的肠道菌群中,氧化磷酸化、脂多糖生物合成和粘多糖降解作用增强;③AS患者中存在脆弱拟杆菌和III型分泌系统等与自身免疫相关的特征;④AS患者肠道菌群中部分富集的细菌多肽可模拟II型胶原,并促进特定HLA分类(HLA-B27)AS患者的PBMC产生IFN-γ。广东消化道疾病菌群检测常用方法肠道菌群--您所不知的“人体第二基因组”。
多中心临床试验支持菌群移植预防抵抗细菌菌药物的耐药细菌:①RBX2660是一款用于改善复发性艰难梭菌infection的菌群悬剂,其中排除了临床危害性大的antibiotic耐药细菌以及特定病毒、寄生虫;②包含29名参与者的多中心临床研究发现,服用RBX2660后,患者菌群结构与RBX2660的菌群结构越接近,预防CDI的效果越好;③使用RBX2660两个月后,患者肠道中耐药肠杆菌科细菌明显减少,耐药基因载量随着RBX2660菌群定植程度上升而下降;④菌群移植减少肠道菌群耐药基因组的方法,有助于防控耐药细菌infection和抵抗细菌药物耐药性传播。
16SrRNA基因测序以细菌16SrRNA基因测序为主,主要是研究样品中的物种分类、物种丰度系统进化、功能预测以及微生物与环境互作关系等。16SrRNA基因是编码原核生物核糖体小亚基的基因,长度约为1542bp,其分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中常用和有用的标志。16SrRNA基因序列包括9个可变区和10个保守区,保守区序列反映了物种间的亲缘关系,而可变区序列则能体现物种间的差异。16SrDNA是细菌染色体上编码16SrRNA相对应的DNA序列,16srRNA是由16srDNA转录来的,一般扩增检测和分析的对象都是16srDNA。肠道菌群检测的方法;
安徽医科大学的李宝珠团队Rheumatology上发表的一篇系统性综述,纳入26项研究的结果,总结了类风湿关节炎(RA)患者的口腔菌群与肠道菌群的组成及多样性的变化。①总结26项研究的结果,分析RA患者的口腔菌群与肠道菌群变化;②3项以上的研究报道,与对照相比,早发性RA/RA患者的肠道菌群中的粪杆菌属减少,而口腔菌群中的普氏菌属增加,链球菌属及嗜血杆菌属减少;③另外,部分普氏菌属中的物种(包括P.histicola及P.oulorum)在RA患者的口腔菌群中有增加趋势;④RA患者的口腔菌群α-多样性增加或不变,而肠道菌群α-多样性降低或不变。如何检测肠道菌群的差异性?陕西亚健康人群菌群检测准确性高
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强直性脊柱炎患者的肠道菌群组成及细菌表位变化:①纳入127名强直性脊柱炎(AS)患者与123名健康人,对粪便菌群进行宏基因组测序;②鉴定出7个菌种在AS患者与健康人中有明显差异,在菌株水平未发现AS患者与健康人的明显差异;③抗TNF改善与AS患者的菌群变化(患者失调的菌群更趋近于健康人,包括一些与AS相关的菌种)相关;④AS患者粪便中可检测到特定细菌表位(与HLA-B27呈递的表位相似)的富集,抗TNF改善与这些潜在交叉反应性细菌表位的减少相关。广东亚健康人群菌群检测私人定制
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