杭州ChIP免疫沉淀磁珠应用
时间：2024年06月12日
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免疫沉淀技术（Immunoprecipitation, IP）在生物医学研究中有着广泛的应用，以下是一些主要的应用领域：
1. 蛋白质相互作用研究：IP技术可以用来研究蛋白质之间的相互作用，揭示蛋白质复合物的组成和蛋白质之间的相互作用网络。
2. 信号转导研究：通过IP技术，可以富集信号转导通路中的关键蛋白质，研究信号转导的机制和调控[。
3. 蛋白质修饰研究：IP技术可以用于富集经过特定修饰的蛋白质，例如磷酸化、乙酰化等，进而研究蛋白质修饰的功能和调控。
4. 药物靶点筛选：IP技术可以用于富集药物靶点蛋白质，帮助筛选潜在的药物靶点。
5. 疾病机制研究：通过分析疾病相关蛋白质的相互作用，IP技术有助于揭示疾病的分子机制，为理解疾病的发展过程和寻找靶点提供重要信息。
6. 药物相互作用分析：IP技术可以用于分析药物与蛋白质的相互作用，为药物作用机制研究提供重要信息。
7. 生物标志物发现：IP技术可以用于鉴定与疾病状态相关的蛋白质相互作用，筛选出潜在的生物标志物，用于疾病的诊断和预后评估。
免疫沉淀技术Co-IP实验步骤。杭州ChIP免疫沉淀磁珠应用
Co-IP（免疫共沉淀）技术主要用于研究蛋白质之间的相互作用，其实验设计如下：
1. 样品准备：Co-IP实验通常有两种，一种是内源性蛋白相互作用验证，一种是非内源性蛋白相互作用验证。内源性相互作用通过质粒共转染的方式将两种蛋白转染至同一细胞内表达；非内源性相互作用则是将含有靶蛋白的组织进行预处理及细胞裂解获得细胞裂解液。
2. 沉淀诱饵蛋白：利用磁珠偶联抗体沉淀诱饵蛋白。在样品中加入磁珠偶联抗体，抗体会与诱饵蛋白结合，利用磁铁将磁珠拉下，同时诱饵蛋白会一起被沉淀出来。
3. SDS-PAGE及WB检测：得到沉淀后，需要验证沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE将蛋白复合物分离，随后利用WB检测是否存在靶蛋白。
4. 实验对照设置：为了避免“假阳性”，需要设置正确的对照，包括阴性对照和阳性对照（Input组）。Input组为直接利用抗体对细胞裂解液进行WB检测，验证细胞裂解液中存在蛋白。
5. 结果真实性：确保共沉淀的蛋白是由所加入的抗体沉淀得到的，而并非外源非特异蛋白。使用单克隆抗体有助于避免污染的发生。
北京免疫沉淀外包公司免疫沉淀技术ChIP的优缺点是什么？
ChIP（染色质免疫沉淀）实验是一种强大的技术，用于研究蛋白质与DNA之间的相互作用，尤其是在转录调控、DNA修复、复制以及表观遗传学领域。然而，像所有实验技术一样，ChIP实验也有其优点和缺点。
ChIP实验的优点：
1. 体内反应的反映：ChIP提供了一种在体内研究蛋白质与DNA相互作用的方法，能够真实、完整地反映结合在DNA序列上的靶蛋白的调控信息。
2. 全基因组覆盖：ChIP技术可以覆盖整个基因组，提供关于蛋白质-DNA相互作用的视图。
3. 适用于多种蛋白质：ChIP可以用来研究组蛋白修饰、转录因子以及其他DNA结合蛋白。
ChIP实验的缺点：
1. 实验步骤繁琐。
2. 需要大量起始材料：ChIP实验通常需要大量的细胞或组织作为起始材料。
3. 交联的影响：使用交联剂可能会改变蛋白质的结构，从而影响抗体的识别和蛋白质-DNA的相互作用。
4. 染色质碎裂的分辨率：染色质碎裂的效率和分辨率直接影响ChIP的准确性，需要优化以获得结果。
5. 抗体质量：抗体的质量对实验结果至关重要，但高质量、特异性强的抗体可能难以获得或成本较高。
免疫沉淀技术的实验方法通常包括以下步骤：
1. 样本准备
2. 细胞裂解：使用裂解缓冲液（含有蛋白酶抑制剂以防止蛋白质降解）裂解细胞，释放蛋白质。
3. 蛋白质浓度测定：使用BCA、Bradford或Lowry等方法测定裂解液中蛋白质的浓度。
4. 抗体预处理：如果使用预固定的抗体，需先将抗体固定在固相支持物上，如琼脂糖珠或磁性微珠。
5. 免疫沉淀反应：将裂解液与特异性抗体（固定或未固定）混合，并在4°C下缓慢摇晃孵育过夜，以允许抗体与目标蛋白质充分结合。
6. 固相支持物的回收：对于未固定的抗体，加入与抗体特异性结合的蛋白A或蛋白G结合的固相支持物。
7. 洗涤：去除未结合的蛋白质和杂质，通常需要多次洗涤固相支持物。
8. 洗脱：使用适当的洗脱缓冲液（如加热的SDS加载缓冲液或酸性缓冲液）从固相支持物上洗脱免疫复合物。
9. 后续分析：对洗脱的蛋白质进行SDS-PAGE电泳、Western Blot、质谱分析等，以进一步分析目标蛋白质。
10. 对照实验：包括正对照（已知能沉淀目标蛋白的抗体）和负对照（非特异性抗体或无抗体）以验证实验的特异性。
免疫沉淀ChIP技术选琼脂糖珠还是磁珠？
免疫沉淀RIP实验中磁珠还是琼脂糖珠的选择取决于客户实验情况。
琼脂糖珠海绵状的结构 (直径 50-150 μm) 可以结合抗体 (继而结合靶蛋白) ，它能够直接高效、快速结合抗体，而不需借助特殊的专业设备。琼脂糖珠呈多孔结构，这使得它们拥有更大的表面积可与蛋白质相互接触，具有更高的结合载量。
与琼脂糖珠不同，磁珠是固体，抗体的结合限于磁珠的表面。磁珠 (直径 1-4 μm) 明显小于琼脂糖珠 ，尽管磁珠没有多孔中心增加结合能力，但每体积的磁珠数量比琼脂糖珠多，使磁珠拥有足够的抗体结合表面积满足高容量的抗体结合。
简而言之，琼脂糖珠的结合能力较强，而磁珠在得率，可重复性以及自动化方面有明显的优势。
免疫沉淀技术RIP的应用有哪些？苏州anti Flag免疫沉淀外包公司免疫沉淀技术RIP的实验设计。杭州ChIP免疫沉淀磁珠应用
免疫沉淀实验步骤：
1. 样品制备
a. 悬浮细胞样品处理：离心收集细胞（4℃, 1000g, 5 min），用手指把细胞用力弹散。按照6孔板每孔细胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制剂的裂解液（裂解液应在使用前数分钟内加入蛋白酶抑制剂Cocktail，使蛋白酶抑制剂Cocktail的终浓度为1×）。混匀后置于冰上处理10 min；离心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上备用（或置于-20℃长期保存）。
b. 贴壁细胞样品处理：移去培养基，用PBS清洗细胞两遍；用细胞刮棒刮脱细胞，收集至1.5mL EP管内，按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制剂的裂解液（裂解液应在使用前数分钟内加入蛋白酶抑制剂Cocktail，使蛋白酶抑制剂Cocktail的终浓度为1×）。吹打数下，使裂解液和细胞充分接触。混匀后置于冰上处理10 min；离心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上备用（或置于-20℃长期保存）。
4. 后续：磁珠预处理——抗体吸附——抗原结合反应——抗体洗脱
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