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PCR引物设计的原则PCR反应中有两条引物，即5′端引物和3′引物。设计引物时以一条DNA单链为基准（常以信息链为基准），5′端引物与位于待扩增片段5′端上的一小段DNA序列相同；3′端引物与位于待扩增片段3′端的一小段DNA序列互补。（1）引物设计的基本原则引物长度：15-30bp，常用为20bp左右。引物碱基：G+C含量以40-60%为宜，G+C太少扩增效果不佳，G+C过多易出现非特异条带。ATGC比较好随机分布，避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列参照。引物内部不应出现互补序列。两个引物之间不应存在互补序列，尤其是避免3′端的互补重叠。引物与非特异扩增区的序列的同源性不要超过70%，引物3′末端连续8个碱基在待扩增区以外不能有完全互补序列，否则易导致非特异性扩增。引物3‘端的碱基，特别是较末及倒数第二个碱基，应严格要求配对，比较好选择是G和C。引物的5′端可以修饰。如附加限制酶位点，引入突变位点，用生物素、荧光物质、地高辛标记，加入其它短序列，包括起始密码子、终止密码子等。pcr检测就找英瀚斯生物！湖南常见pcr检测

PCR反应的特异性强，其决定因素为：①引物与模板DNA特异正确的结合；②碱基配对原则；③TaqDNA聚合酶合成反应的忠实性；④靶基因的特异性与保守性。其中引物与模板的正确结合是关键。引物与模板的结合及引物链的延伸是遵循碱基配对原则的。聚合酶合成反应的忠实性及TaqDNA聚合酶耐高温性，使反应中模板与引物的结合（复性）可以在较高的温度下进行，结合的特异性明显增加，被扩增的靶基因片段也就能保持很高的正确度。再通过选择特异性和保守性高的靶基因区，其特异性程度就更高。湖南常见pcr检测荧光定量pcr的ct值怎么分析？

PCR实验技术中cDNA第二链的合成方法有以下几种:1、自身引导法合成的单链cDNA3'端能够形成一短的发夹结构，这就为第二链的合成提供了现成的引物，当***链合成反应产物的DNA:RNA杂交链变性后利用大肠杆菌DNA聚合酶ⅠKlenow片段或反转录酶合成cDNA第二链，***用对单链特异性的S1核酸酶消化该环，即可进一步克隆。但自身引导合成法较难控制反应，而且用S1核酸酶切割发夹结构时无一例外地将导致对应于mRNA5'端序列出现缺失和重排，因而该方法目前很少使用。2、置换合成法该方法利用链在反转录酶作用下产生的cDNA:mRNA杂交链不用碱变性，而是在dNTP存在下，利用RNA酶H在杂交链的mRNA链上造成切口和缺口。从而产生一系列RNA引物，使之成为合成第二链的引物，在大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ的作用下合成第二链。该反应有3个主要优点:(1)非常有效；(2)直接利用链反应产物，无须进一步处理和纯化；(3)不必使用S1核酸酶来切割双链cDNA中的单链发夹环。

PCR实验技术中的锚定PCR（AnchoredPCR）介绍：锚定PCR主要用于分析具有可变末端的DNA序列，Loh等用A-PCR对人外周血淋巴细胞T细胞受体α-链的mRNA的多变性进行了分析。先合成cDNA，并用末端脱氧核苷酸转移酶在其3’-可变区末端加上一个PolyG尾巴。Loh等恒定区与可变区连接部位设一个引物，另一个引物是一个具5’-polyG尾巴的引物。带有PolyG尾巴的引物是一个固定点，它可以并与PolyG尾巴结合，无论其余部分序列如何，只识别片段末端，利用此法可从前述mRNA中检出至少20种不同序列，每一种都是独特的，表明A-PCR不对任何特殊序列有倾向性结果，可用于T细胞及其它部位抗体基因的研究。英瀚斯分子生物学检测平台，信得过的pcr检测。

PCR实验技术中的RT-PCR一步法和两步法的优缺点介绍：一步法：利用同一缓冲液，在同一体系中加入逆转录酶、引物、Taq酶、4种dNTP直接进行mRNA反转录与PCR扩增。发现Taq酶不仅具有DNA多聚酶的作用，而且具有反转录酶活性，可利用其双重作用在同一体系中直接以mRNA为模板进行反转录和其后PCR扩增，从而使mRNA的PCR步骤更为简化。所需样品量减少到比较低限度，临床小样品的检测非常有利。用一步法扩增可检测出总RNA中小于1ng的低丰度mRNA.该法可用于低丰度mRNA的cDNA文库的构建及特异cDNA的克隆，并有可能与Taq酶的测序技术相组合，使得自动反转录、基因扩增与基因转录产物的测序在单管中进行。两步法：由于单管反应时RT和PCR都不能在比较好条件下进行并且容易相互干扰，常只适宜用基因特异引物扩增较短的基因，及定量PCR.两步法则是将RT和PCR分别进行，这样使得两个反应充分发挥各自的特点，更为灵活而且严谨，适合那些GC含量、二级结构严重的模板或者是未知模板，以及多个基因的RT-PCR。英瀚斯生物，专业仪器，丰富经验，高质量pcr。湖南常见pcr检测

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细胞长满80%瓶底或皿底，换培养液，第二天提取RNA(倒掉培养液，5-10ml冰PBS洗涤细胞2次空干)加1ml冰TRizoL,用力振荡培养瓶使细胞完全脱落，加样器吹打(吸入1.5ml离心管，旋涡振荡10秒，室温静置5分钟)加氯仿200ul,漩涡混匀器振荡10秒，冰盒上静置10分钟(40C,8000rpm,5分钟，)吸取上层水相0.5-0.7ml移至另一1.5ml离心管中，加异丙醇0.5-0.7ml(充分混匀，冰盒上静置10分钟，40C,12000rpm,15分)弃上清,加75%冰乙醇1ml,颠倒混匀数次(40C,12000rpm,15分)弃上清,沉淀快速风干。但不要完全干燥,加DEPC处理去离子水50-100ul取5ul作RNA电泳，5ul作RNA定量，余-800C冰箱保存湖南常见pcr检测

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