杭州ChIP免疫沉淀磁珠价格

时间:2024年06月20日 来源:
RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)的实验设计需要考虑多个方面,以确保实验的准确性和可重复性。
1. 目标蛋白的选择:确定你想要研究的目标RNA结合蛋白(RBP)。
2. 阳性和阴性对照:设计实验时,需要包括阳性对照和阴性对照。
3. 细胞培养与裂解:选择合适的细胞类型进行培养。
4. 抗体孵育:将特异性抗体与细胞裂解液孵育,以形成抗体-蛋白质-RNA复合物。
5. 免疫沉淀:使用蛋白A或蛋白G结合的珠子进行免疫沉淀,捕获抗体-蛋白质-RNA复合物。
6. 洗涤和分离:洗涤珠子以去除未特异性结合的蛋白质和RNA。从珠子上分离RNA,可能需要使用低pH缓冲液或蛋白酶K处理。
7. RNA分析:使用qPCR、Northern blot或RNA-Seq等方法分析沉淀下来的RNA。
8. 数据分析:对实验结果进行定量分析,比较不同样品之间的RNA水平。

9. 实验重复:为了确保结果的可靠性,实验应该进行至少三次重复。 免疫沉淀选琼脂糖珠还是磁珠?杭州ChIP免疫沉淀磁珠价格

10. 技术验证:使用其他技术(如RNA-pull down或FISH)验证RIP实验结果。
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RIP实验步骤通常包括:
1. 细胞收集与交联:培养细胞至适当密度。使用交联剂(如甲醛)进行交联,以固定蛋白质-RNA复合物。
2. 细胞裂解:收集细胞并进行裂解,释放RNA-蛋白质复合物。在裂解过程中添加蛋白酶抑制剂以防止蛋白质降解。
3. 超声处理:使用超声波破坏细胞,获得更小的染色质片段,这有助于后续步骤中抗体的接触。
4. 除去细胞碎片:通过离心去除细胞碎片和未裂解的细胞,收集含RNA-蛋白质复合物的上清液。
5. 免疫沉淀:将针对特定RNA结合蛋白(RBP)的抗体加入到上清液中。孵育一段时间,使抗体与目标蛋白充分结合。
6. 捕获免疫复合物:添加蛋白A或蛋白G结合的磁珠或琼脂糖珠。孵育使抗体-蛋白质-RNA复合物与珠子结合。
7. 洗涤:多次洗涤珠子以去除未特异性结合的蛋白质和RNA。
8. 洗脱与逆转交联:使用适当的缓冲液洗脱免疫复合物。使用蛋白酶K处理样品以逆转交联,释放RNA。
9. RNA提取与纯化:从免疫沉淀样品中提取RNA,并进行纯化。
10. RNA分析:使用qPCR、Northern blot、RNA-Seq等方法分析沉淀的RNA,以确定与目标蛋白相互作用的RNA种类。
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ChIP(染色质免疫沉淀)实验是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。以下是ChIP实验的实验方法概述:
1. 交联:将细胞与交联剂(如1%甲醛)孵育,通常在室温下进行10-15分钟。
2. 终止交联:添加甘氨酸以终止交联反应,孵育5分钟。
3. 收集细胞:通过离心收集细胞,并用PBS洗涤以去除交联剂。
4. 细胞裂解:使用裂解缓冲液裂解细胞,释放染色质。
5. 染色质剪切:使用超声波或酶消化将染色质剪切成适当大小的片段。
6. 免疫沉淀:将剪切后的染色质与特异性抗体孵育,然后添加蛋白A/G磁珠。
7. 洗涤:用低盐、高盐和LiCl洗涤液洗涤磁珠,去除非特异性结合物。
8. 洗脱:用洗脱缓冲液洗脱DNA。
9. 逆转交联:用蛋白酶K处理,然后在65°C下加热过夜以逆转交联。
10. DNA纯化:使用商业试剂盒或标准酚/氯仿方法纯化DNA。
11. 分析:使用qPCR分析富集的DNA,或进行测序以确定蛋白质结合位点。

免疫沉淀IP实验中磁珠还是琼脂糖珠的选择取决于客户实验情况。
琼脂糖珠海绵状的结构  (直径 50-150 μm)  可以结合抗体  (继而结合靶蛋白) ,它能够直接高效、快速结合抗体,而不需借助特殊的专业设备。琼脂糖珠呈多孔结构,这使得它们拥有更大的表面积可与蛋白质相互接触,具有更高的结合载量。
与琼脂糖珠不同,磁珠是固体,抗体的结合限于磁珠的表面。磁珠 (直径 1-4 μm) 明显小于琼脂糖珠 ,尽管磁珠没有多孔中心增加结合能力,但每体积的磁珠数量比琼脂糖珠多,使磁珠拥有足够的抗体结合表面积满足高容量的抗体结合。
简而言之,琼脂糖珠的结合能力较强,而磁珠在得率,可重复性以及自动化方面有明显的优势。
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免疫沉淀技术(Immunoprecipitation, IP)的实验方法通常包括以下步骤:
1. 样本准备
2. 蛋白质浓度测定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法测定裂解液中蛋白质的浓度。
3. 抗体预处理:如果使用预固定的抗体,需先将抗体固定在固相支持物上,如琼脂糖珠或磁性微珠。
4. 免疫沉淀反应:将裂解液与特异性抗体(固定或未固定)混合,并在4°C下缓慢摇晃孵育过夜,以允许抗体与目标蛋白质充分结合。
5. 固相支持物的回收:对于未固定的抗体,加入与抗体特异性结合的蛋白A或蛋白G结合的固相支持物。
6. 洗涤:去除未结合的蛋白质和杂质,通常需要多次洗涤固相支持物。
7. 洗脱:使用适当的洗脱缓冲液(如加热的SDS加载缓冲液或酸性缓冲液)从固相支持物上洗脱免疫复合物。
8. 后续分析:对洗脱的蛋白质进行SDS-PAGE电泳、Western Blot、质谱分析等,以进一步分析目标蛋白质。
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免疫沉淀技术RIP的实验设计。杭州ChIP免疫沉淀磁珠价格

免疫沉淀技术(Immunoprecipitation, IP)是一种用于研究蛋白质相互作用和纯化特定蛋白质的实验方法。
优点:
1. 特异性强:利用特异性抗体捕获目标蛋白,可以有效地从复杂的生物样本中分离出感兴趣的蛋白质。
2. 灵敏度高:可以检测到低丰度的蛋白质,包括瞬态或弱相互作用的蛋白质复合物。
3. 应用范围广:适用于多种生物样本,如细胞裂解物、组织提取物和生物流体。
4. 生物学洞察深入:能够揭示蛋白质之间的相互作用网络,有助于理解细胞内的信号传递和调控机制。
5. 可与其他技术联用:如与质谱(IP-MS)联用,可以准确鉴定蛋白质及其相互作用伙伴。
缺点:
1. 对抗体依赖性高:需要高亲和力和高特异性的抗体,抗体的质量直接影响实验结果。
2. 可能存在非特异性结合:样本中的其他蛋白质可能与抗体或固相支持物发生非特异性结合,导致背景噪音。
3. 可能影响蛋白质的天然状态:裂解和沉淀过程可能会改变蛋白质的构象和功能。
4. 实验重复性:需要多次实验来确保结果的可重复性和可靠性。
5. 样品处理:需要避免样品降解和非特异性结合,这可能需要使用蛋白酶抑制剂和适当的缓冲液条件。
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