陕西相互作用蛋白检测CoIP-MS
Co-IP(免疫共沉淀)和ChIP(染色质免疫沉淀)研究对象和应用方面的区别。研究对象:Co-IP主要研究的是蛋白质与蛋白质之间的相互作用,而ChIP则主要用于研究DNA(启动子)与蛋白质(如转录因子等)之间的相互作用。应用方面:Co-IP常用于验证两种蛋白质是否在体内存在相互作用,是确定蛋白质复合物组成的有效手段。而ChIP则更常用于研究转录因子与DNA的结合情况,揭示转录调控的机制,也是确定与特定蛋白结合的基因组区域或确定与特定基因组区域结合的蛋白质的一种很好的方法。总的来说,Co-IP和ChIP各有其独特的优点和应用价值,选择哪种方法取决于研究的具体问题和目标。Co-IP技术是研究蛋白质互作的重要工具,结果可靠,但需注意实验条件和操作细节!陕西相互作用蛋白检测CoIP-MS
CoIP-Mass和CoIP-WB检测要点:
抗体关键质控:抗体特异性和亲和效价要求高,尽量采用标签抗体或经过CoIP效果验证的抗体。抗体质量参差不齐(WB能检测到预期条带不到1/2,能检测到良好结果的不到1/4)和存在非特异性结合(几乎所有的抗体都存在非特异结合,部分非特异结合条带远大于目的条带),CoIP-MS需做WB和CoIP-WB质控。初次和检测CoIP都需要做WB质控。正式CoIP可同时增加考染/银染质控。抗体可参考数据库(ValidatedAntibodyDB,)。 陕西相互作用蛋白检测CoIP-MSCo-IP外源检测需注意蛋白互作真实性、表达系统与标签选择、规范操作及结果验证,确保准确性!
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是一种基于抗原与抗体特异性结合用于研究蛋白质与蛋白质相互作用的方法。常用于候选目标蛋白质之间是否有相互作用,也用于确定与已知蛋白质互作的其它未知蛋白质相互作用。基本原理:当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留了下来。免疫共沉淀实验流程:蛋白质样本收集-A抗体沉淀目的蛋白A-SDS-PAGE分离-WB检测B蛋白或者质谱鉴定互作蛋白。Co-IP的优点主要包括高特异性、灵敏度高、与质谱技术兼容、操作相对简便。
Co-IP(免疫共沉淀)技术的基本原理是利用抗原与抗体之间的专一性作用,将特定蛋白质及其与之相互作用的蛋白质一同沉淀下来。这种技术常用于研究蛋白质之间的相互作用和复合物形成。在Co-IP实验中,研究人员首先会制备针对目标蛋白的特异性抗体,并将其与固相载体偶联。然后,将含有目标蛋白及其相互作用伙伴的细胞或组织裂解液与抗体-载体复合物混合。由于抗体与目标蛋白之间的特异性结合,目标蛋白及其相互作用伙伴会被固定在抗体-载体复合物上。接下来,通过洗涤步骤去除非特异性结合的杂质,以确保沉淀下来的蛋白质复合物是特异性的。然后,使用适当的洗脱缓冲液将目标蛋白及其相互作用伙伴从抗体-载体复合物上洗脱下来,以便进行后续的分析和检测。CoIP实验内源检测与外源检测的优缺点。
Co-IP实验的外源检测是一种通过引入外源表达的蛋白来验证蛋白质间相互作用的方法。与外源检测相对的是内源检测,即检测细胞内自然状态下蛋白质间的相互作用。在外源检测中,研究者通常会在细胞中转染含有特定基因的质粒,使该基因在细胞内过量表达,从而产生大量的外源蛋白。然后,利用特异性抗体对这些外源蛋白进行免疫共沉淀(Co-IP),并通过Western Blot等技术检测与其相互作用的蛋白是否也被沉淀下来。这种方法有助于验证蛋白质间的相互作用,并确定相互作用的具体条件或影响因素。同时,由于外源蛋白的表达量较高,因此外源检测通常比内源检测更为敏感,更容易检测到较弱的相互作用。然而,需要注意的是,外源检测的结果可能受到多种因素的影响,如外源蛋白的表达水平、转染效率、细胞状态等。因此,在进行外源检测时,需要严格控制实验条件,确保实验结果的准确性和可靠性。同时,为了更好地了解蛋白质间的相互作用,通常需要结合内源检测和外源检测的结果进行综合分析。IP-Mass实验流程:样品制备、免疫沉淀、洗脱、蛋白酶消化、质谱分析、数据分析,鉴定互作蛋白!陕西相互作用蛋白检测CoIP-MS
Co-IP技术虽广泛应用,但受抗体特异性、低丰度蛋白、样品制备和瞬时互作等限制,需结合其他方法验证!陕西相互作用蛋白检测CoIP-MS
免疫共沉淀CoIP实验,细胞的收集及裂解方法如下:
收集2E7个细胞样品,加入PBS洗涤细胞,离心后弃上清收集细胞沉淀。
准备500μl预冷的CellLysisBuffer,分别加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF,混匀后加进细胞沉淀中吹打均匀,冰上孵育30min,期间涡旋混匀几次。
4℃,12000rpm离心10min,取上清,进行蛋白浓度测定及后续实验。广州基云生物,在IP互作组检测和关键机制分子筛选验证领域,具有丰富的经验,助力您的互作机制研究,欢迎垂询合作。 陕西相互作用蛋白检测CoIP-MS
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