Recombinant Cynomolgus Adiponectin/Acrp30 Protein
SpCas9蛋白(来自化脓性链球菌的Cas9蛋白)在基因编辑中的主要作用是作为核酸酶,能够精确地切割目标DNA序列。以下是SpCas9在基因编辑中的几个关键步骤和作用:1.**识别和结合**:SpCas9蛋白与一个单导向RNA(sgRNA)结合,形成RNP复合物。这个复合物能够识别并结合到基因组中与sgRNA互补的特定DNA序列。2.**PAM序列识别**:SpCas9需要一个称为原间隔子相邻基序(PAM)的特定序列作为识别目标DNA的先决条件。对于SpCas9,这个PAM序列通常是5'-NGG-3'。3.**DNA切割**:一旦RNP复合物与目标DNA结合,SpCas9就会在PAM序列的3个碱基对的上游位置切割DNA双链,产生一个双链断裂(DSB)。4.**引发DNA修复**:DNA双链断裂触发细胞的DNA修复机制,包括同源定向修复(HDR)和非同源末端连接(NHEJ)。研究人员可以利用这些修复机制来插入、删除或替换特定的DNA序列。5.**基因修改**:通过HDR,可以在断裂的DNA两端引入特定的DNA模板,从而实现精确的基因编辑。而NHEJ通常会导致小的插入或缺失(indel),这可以用来产生基因的敲除或敲入。6.**提高编辑效率**:为了提高SpCas9的编辑效率,研究人员可能会使用优化的sgRNA设计、蛋白质工程或嵌合融合蛋白等策略。
在蛋白质糖基化分析中,除了N-糖苷酶F(PNGaseF),还有其他几种酶也发挥着重要作用,具有各自的优势:1.**EndoH糖苷内切酶H**:这种酶可以水解高甘露糖型N-连接糖链,通常用于区分高甘露糖型和复杂型糖链。2.**EndoS糖苷内切酶S**:EndoS能够从IgG重链的壳二糖结构之间切除N-连接糖,有助于分析抗体的糖基化模式。3.**FastPNGaseF**:这是一种经过优化的PNGaseF,能在数分钟内对抗体、免疫球蛋白、融合蛋白以及其他糖蛋白进行彻底和快速的去糖基化,简化了实验流程,同时保持了灵敏度和重复性。4.**O-糖苷酶O-glycosidase**:用于去除O-连接的糖链,这对于O-糖基化蛋白质的分析至关重要。5.**三氟甲基磺酸(TFMS)法**:这是一种化学去糖基化方法,可以用于释放糖链,尤其在某些难以使用酶法去除糖链的情况下。6.**质谱法**:虽然不是酶,但质谱法是分析糖链结构的强大工具,可以结合酶法或化学法释放的糖链进行详细分析。7.**核磁共振法(NMR)**:NMR技术可以确定糖链的构型、连接位置、分支和微观多样性,是糖链立体化学结构分析的重要方法。这些酶和方法各有优势,可以根据实验的具体需求和糖基化类型的不同进行选择,以获得比较好的分析结果。
酵母重组表达的N-糖苷酶F(PNGaseF)是一种酰胺水解酶,具有以下特点:1.**高效性**:PNGaseF是去除几乎所有N-连接寡糖从糖蛋白中有效的酶法方法。它能够在几分钟内快速且无偏倚地释放所有的N-糖链,适合后续的色谱或质谱分析。2.**重组酶**:该酶是重组的酰胺酶,能够从高甘露糖、杂合和复杂寡糖中切割内GlcNAc和天冬氨酸残基之间的连接。3.**纯度**:纯度达到95%以上,通过SDS-PAGE和完整ESI-MS进行确定。4.**储存稳定性**:在含有50%甘油的储存缓冲液中,好的活性和稳定性可维持长达24个月。5.**使用条件**:可以在原生或变性条件下使用,对于变性条件下的去糖基化,建议添加NP-40以解除SDS的抑制作用。6.**比活性**:具有高达100000U/mL的比活性。7.**His标签**:产品带有His标签,常用于抗体及其相关蛋白的完全去糖基化。8.储存条件:-25~-15℃保存,有效期1年。9.**无甘油版本**:还提供了无甘油版本的PNGaseF,这有助于在HPLC和质谱分析中获得结果。10.**酶活定义**:1个酶活力单位指在10μL的反应体系中,37℃条件下1小时从10μg变性RNaseB中除去超过95%的碳水化合物所需要的酶量。这些特点使得酵母重组表达的PNGaseF成为研究和分析糖蛋白糖链结构的重要工具。
EndoS酶在抗体药物偶联物(ADCs)研究中的具体应用主要体现在糖链定点偶联技术方面。根据上海药物研究所的研究进展,EndoS酶被用于实现定点ADC化合物的“一步”制备,这是一种新颖的糖链定点ADC制备策略。该策略利用了新颖截短型糖结构的药物-连接子和野生型糖苷内切酶EndoS2,将小分子细胞毒药物直接定点连接到抗体糖基化位点,从而克服了传统糖链定点ADC制备策略的限制。具体来说,研究人员通过筛选发现,EndoS2酶可以将二糖底物LacNAc转移至去糖抗体N297位糖基化位点,并且LacNAc半乳糖6号位唾液酸化修饰不影响EndoS2的转糖基化活性。这一发现使得EndoS2和LacNAc的组合可以直接实现野生型抗体的糖基化改造,且EndoS2对多样化LacNAc修饰的兼容性,可以高效获得多样性功能修饰的岩藻糖化或去岩藻糖化的糖工程抗体。此外,研究人员还利用叠氮化修饰的LacNAc底物实现了抗体糖基化位点的“一步”叠氮化修饰,并通过点击化学反应偶联药物-连接子,实现了“两步”制备得到定点ADC化合物。
提高SpCas9蛋白在基因编辑中的特异性和效率是CRISPR-Cas9技术发展的关键。根据新的研究进展,以下是一些提高SpCas9特异性和效率的策略:1.**工程化改造**:通过定向进化和蛋白工程的方法,研究人员可以对SpCas9进行改造,以提高其在细胞中的基因编辑活性。例如,JenniferDoudna团队开发的工程化iGeoCas9,通过在WED结构域引入突变,显著提高了基因编辑效率,比野生型GeoCas9高出100倍以上。2.**优化gRNA设计**:合理设计的gRNA可以提高Cas9的特异性,减少脱靶效应。研究人员通过生物信息学工具和实验验证,筛选出与目标DNA序列互补性更强且特异性更高的gRNA。3.**使用高保真Cas9变体**:研究人员开发了高保真Cas9变体,这些变体在保持编辑活性的同时,降低了脱靶风险。例如,通过突变Cas9蛋白的关键氨基酸残基,可以减少其在非目标位点的切割活性。4.**PAM序列的优化**:通过改变Cas9蛋白的PAM序列识别能力,可以扩大其靶向范围,从而提高编辑效率。例如,开发能够识别非典型PAM序列的Cas9变体。5.**递送系统的优化**:使用核糖核的蛋白(RNP)复合物的形式递送Cas9和gRNA,可以提高Cas9蛋白的稳定性和编辑效率。这种方法避免了mRNA或质粒递送可能引起的免疫反应。Multiplex Probe qPCR Mix 是一种浓缩预混液,含有抗体技术修饰的热启动酶Hotstart Taq DNA聚合酶。Recombinant Mouse CD98 Protein,His Tag
将Cas9/sgRNA复合物转染到目标细胞中。可以使用脂质体介导转染、电穿孔或其他转染技术 。Recombinant Cynomolgus Adiponectin/Acrp30 Protein,His Tag
PNGaseF,Recombinant,ExpressedinYeast(酵母重组表达N-糖苷酶F)的高效性体现在以下几个方面:1.**高比活性**:该酶具有高比活性,例如可达到750,000U/mL,这意味着单位体积的酶可以进行更多的反应循环,从而提高去糖基化的效率。2.**快速反应**:与传统PNGaseF相比,某些优化版本的PNGaseF,如FastPNGaseF,能在更短的时间内完成去糖基化,要10分钟。3.**彻底去糖基化**:该酶能迅速且无偏好性地去除几乎所有N-连接的寡糖,包括高甘露糖型、杂合型和复杂型糖链,确保了去糖基化的彻底性。4.**直接分析**:去糖基化后的产物可以直接用于下游的色谱或质谱分析,无需额外的纯化步骤,从而节省时间并提高分析的效率。5.**适用性**:适用于多种糖蛋白的去糖基化,包括抗体、免疫球蛋白、融合蛋白以及其他糖蛋白,增加了该酶的实用性。6.**优化的反应条件**:可以在变性或非变性条件下使用,增加了实验设计的灵活性,并允许在不同条件下优化去糖基化效率。7.**简化的实验流程**:由于酶的高效性,实验流程得以简化,减少了反应体积和酶的使用量,同时保持了反应的灵敏度和重复性。