厦门骨头PCR检测技术原理

时间:2023年07月29日 来源:

Real-time PCR:基线(baseline):通常是3-15个循环的荧光信号,同一次反应中针对不同的基因需单独设置基线。阈值(threshold):自动设置是3-15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。手动设置:置于指数扩增期,刚好可以清楚地看到荧光信号明显增强。同一次反应中针对不同的基因可单独设置阈值,但对于同一个基因扩增一定要用同一个阈值。Ct值:与起始浓度的对数成线性关系,分析定量时候一般取Ct:15-35.太大或者太小都会导致定量的不准确。相对定量:通过与内参基因Ct值之间的相差来计算基因之间的表达差异,一般是2-△△Ct。或者是考虑扩增效率的Pfaffl法。实时荧光定量PCR技术有效地解决了传统定量只能终点检测的局限。厦门骨头PCR检测技术原理

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引物的设计注意事项:1,引物设计要跨内含子,不能在一个外显子上(我们的实验是以cDNA为模板来扩增的,如果有DNA污染的话,因为DNA上含有分子量很大的内含子,不可能完成扩增。这对我们消除整个实验的误差起很大的作用)。2,引物设计的时候要尽可能设计在同一退火温度,方便于以后同时扩增很多不同的基因片段。但是如果相差比较大,就得分开做,浪费模板,浪费管家基因,所以每个实验室设计引物的时候要尽可能一致,这样就不用每次查退火温度,且对整个实验有利。连云港血液PCR检测技术研究方案在不同的PCR反应管中加入已定量的内标和引物,内标用基因工程方法合成。

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聚合酶链式反应又称多聚酶链式反应,是一项利用DNA双链复制的原理,在生物体外复制特定DN段的核酸合成技术。透过这项技术,可在短时间内大量扩增目的基因,而不必依赖大肠杆菌或酵母菌等生物体。聚合酶链反应是是一种简单,廉价和可靠的方法复制DN段,这个概念适用于现物学和相关科学的许多领域。PCR可能是分子生物学中使用很较广的技术。这种技术被用于生物医学研究,犯罪取证和分子考古学。通常,PCR由一系列20-40次重复的温度变化组成,称为热循环,每个循环通常由两个或三个离散的温度步骤组成。聚合酶链式反应准备:引物内部不应出现互补序列。

Real-time PCR式反应准备:10×扩增缓冲液、4种dNTP混合物(终浓度)、引物(终浓度)、模板DNA、TaqDNA聚合酶、Mg2+(终浓度)、补加双蒸水等。其中dNTP、引物、模板DNA、TaqDNA聚合酶以及Mg2+的加量(或浓度)可根据实验调整,以上表格只提供大致参考值。PCR反应五要素:参加PCR反应的物质主要有五种即:引物(PCR引物为DN段,细胞内DNA复制的引物为一段RNA链)、酶、dNTP、模板和缓冲液(其中需要Mg2+)。引物有多种设计方法,由PCR在实验中的目的决定,但基本原则相同。Real-time PCR在实验过程中注意避免mRNA的断裂。

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聚合酶链反应注意事项:在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂;为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照;内参的设定主要为了用于靶RNA的定量。常用的内参有G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin(β-肌动蛋白)等。其目的在于避免RNA定量误差、加样误差以及各PCR反应体系中扩增效率不均一各孔间的温度差等所造成的误差;PCR不能进入平台期,出现平台效应与所扩增的目的基因的长度、序列、二级结构以及目标DNA起始的数量有关。故对于每一个目标序列出现平台效应的循环数,均应通过单独实验来确定;防止DNA的污染:采用DNA酶处理RNA;在可能的情况下,将PCR引物置于基因的不同外显子,以消除基因和mRNA的共线性。聚合酶链反应可以选择这些突变来理解蛋白质是如何完成其功能的,并改变或改善蛋白质功能。实时设备的软件能使收集到的数据进行正常化处理来弥补背景荧光的差异。连云港血液PCR检测技术研究方案

实时荧光定量PCR无需内标是建立在两个基础之上的。厦门骨头PCR检测技术原理

Real-time PCR:Ct值与起始模板的线性关系由于Ct值与起始模板的对数存在线性关系,可利用标准曲线对未知样品进行定量测定,因此,实时荧光定量PCR是一种采用外标准曲线定量的方法。外标准曲线的定量方法相比内标法是一种准确的、值得信赖的科学方法。利用外标准曲线的实时荧光定量PCR是迄今为止定量较准确,重现性较好的定量方法,已得到全世界的公认,普遍用于基因表达研究、转基因研究,药物疗效考核、病原体检测等诸多领域。实时荧光定量PCR的定量方法,在Real-time PCR中,模板定量有两种策略,相对定量和定量。厦门骨头PCR检测技术原理

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