嘉兴慢病毒载体整合位点政策

2020年9月发布的《细胞zhiliao产品申请临床试验药学研究和申报资料的考虑要点》“生产工艺开发的技术要求”及“质量研究和质量控制中的安全性研究”部分要求提供目的基因在染色体中的整合情况及提供细胞恶性转化（成瘤性和致瘤性）进行安全性研究和评估内容。2020年2月发布的《免疫细胞zhiliao产品临床试验技术指导原则（试行）》中规定：探索性临床试验的安全性和耐受性要考虑"外源基因随机整合到细胞基因组形成插入突变，导致成瘤性和恶性转化等"。基因整合位点研究的方法主要有5种: 荧光原位杂交、个体基因组文库筛选法、反向PCR、接头PCR、锚定PCR。嘉兴慢病毒载体整合位点政策

慢病毒是逆转录病毒的一类，慢病毒整合到宿主细胞的染色体上可以长期稳定表达，并且与其他逆转录病毒（例如腺病毒）相比，慢病毒不但能ganran分裂期细胞，而且还能ganran非分裂期的细胞。基于以上优点，慢病毒载体（lentiviral vector）作为外源基因转移载体已广用于临床前基因研究及临床基因zhiliao。然而目前尚不能实现利用慢病毒载体将目的基因插入到特定位点，因此存在插入性突变致的风险。腺相关病毒（adeno-associated virus，AAV）是目前发现的一类结构较简单的单链DNA缺陷型病毒。而重组腺相关病毒载体(rAAV) 源于非致病的野生型腺相关病毒，具有安全性好、宿主细胞范围广和在体内表达时间长等特点，目前的科学界共识是AAV不会导致任何人类疾病，因此成为目前较有前景的基因zhiliao载体。然而，近年来不断有研究表明AVV可将外源基因片段插入到染色体上。南京病毒载体整合位点报告慢病毒载体在人角质形成细胞基因组中的整合位点分析。

2018年CTL019的一项临床试验中，一名B-ALL病人在接受CAR-CD19zhiliao28天后即达到CR，却在6个月后复发，PCR检测没有发现任何的RCL，结合持续性慢病毒插入位点的克隆丰度分析，研究者较终发现一个携带CAR插入位点的CAR-B细胞克隆。进而发现这个B细胞是CAR-T生产过程中的一个CAR-B副产物，而CAR在该B细胞上的顺式插入表达导致CAR靶标表位屏蔽，导致该B细胞克隆的耐药。这个案例也提示除去CAR-Tzhiliao方法本身的潜在风险外，CAR-T在生产工艺也会产生二次成瘤的风险。

应用场景：单克隆抗体药物辅助筛选；致xingbing毒整合位点检测与整合偏好性分析等；WGS不适用于转染之后未经过传代培养和表型筛选的细胞系。丰富的项目经验目前，唯可已与国内外多家免疫zhiliao研究前沿企业开展合作，采用该方法对高度异质性的CAR-T细胞进行整合位点检测与细胞安全性评估，具有较为丰富的项目经验。一般HBV插入到基因组中形成下图结构。使用三代测序，靶向插入区域的测序reads可分为Readsgroup1（HBV插入区域测通）和Readsgroup2（reads部分比对染色体，部分比对HBV插入区域）。基于三代数据比对后bam文件的IGV图，判断变异类型，推断断点类型和插入序列。含有完整的外源DNA全部整合结构、插入位点旁侧序列和受体基因组在整合位点附近重排结构的CCS reads。

CAR-T，全称是ChimericAntigenReceptorT-CellImmunotherapy，指的是嵌合抗原受体T细胞免疫疗法。通过基因转导方法转染T淋巴细胞，赋予T细胞liu靶向性、更强的杀伤活性和持久的杀伤力。从而使其能特异性地识别和高效杀伤肿瘤细胞。目前全球共有5款CAR-T疗法获批上市，4款靶向CD19，1款靶向BCMA，分别是Kymriah，Yescarta和Tecartus（2017年10月、2020年7月获批），Breyanzi和Abecma（2021年2月、2021年3月获批）。CAR-T疗法的未来市场前景乐观。慢病毒整合位点如何进行分析,用什么产品进行分析呢?南京病毒载体整合位点报告

非病毒定点整合CAR-T技术的开发和应用。嘉兴慢病毒载体整合位点政策

相较于LM-PCR方法，重组细胞全基因组重测序需要较大数据量，比较适合用于经过表型筛选的单克隆细胞的测序，比如用于抗体药物生产重组CHO细胞的位点检测，但全基因组测序可对宿主基因组自身的变异进行检测。应用场景：CAR-T细胞安全性检测（药物申报）；基因zhiliao研究中使用的病毒性载体的安全性检测等；1.LM-PCR不适合评估每个整合位点插入序列发生的变异，不适用于插入序列的拷贝数检测，拷贝数检测可以采用qPCR方法进行。2.INZR-WGS（WGS法）嘉兴慢病毒载体整合位点政策