云南霉菌高通量筛选

时间:2022年12月14日 来源:

开发一种新药的过程可能是漫长、复杂和不确定的,但从社会、科学和经济的角度来看,它也可能是高回报的。高通量筛选(HTS)已经成为药物发现的主要工具。,向大家介绍目前用于靶标确认的几种HTS方法,主要分为两大类:生化水平和细胞水平。生化水平分析包括比率荧光法(FA/FP)、荧光共振能量转移(FRET)、时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)等;细胞水平的分析包括细胞活力、报告基因、第二信使和高内涵成像等。生化筛选利用纯化的目标蛋白,在体外测定配体的结合或酶活性的抑制。这些检测通常在384孔板中以竞争的形式进行,其中所研究的化合物必须取代已知的配体或底物。荧光法由于其使用简便、灵敏度高和灵活性强等特点,广受科研人员的欢迎,主要有比率荧光法(FA/FP)、荧光共振能量转移(FRET)、时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)。高通量筛选催化剂技术。云南霉菌高通量筛选

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我国进行药物高通量筛选的优势首先是化合物来源,且多为天然;其次是对化合物生物活性的筛选目的较明确,无目的合成的化合物较少;第三,我国传统药物为筛选研究提供了一个巨大的资源库,可从中药中提取分离筛选新的化合物。这些优势为药物的高通量筛选打下了坚实基础。我国药物高通量筛选初现规模:药物高通量筛选工作在我国起步较晚,且不规范。近几年,我国进行了外引内联的整体化、规模化基础建设,已初见成效。1996年中国医学科学院引进国内台Biomek2000型实验自动化工作站;1998年又引进台Topcount微量闪烁计数器,使放射配基实验、放射免疫实验等技术微量化、自动化。江西小分子高通量筛选高通量筛选技术的优点。

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在报告基因检测(也称为信号通路检测)中,报告蛋白的序列编码是在相关通路的转录控制下引入的。通过荧光或光学读数监测报告基因的表达,通过这些指标来间接反应启动子的或抑制程度。观察到的信号是整个通路的产物,筛选的化合物可以在该通路上的任何点相互作用。常见的报告基因是CAT(氯霉素乙酰转移酶)、GAL(β-半乳糖苷酶)、LAC(β-内酰胺酶)、LUC(荧光素酶)和GFP。我们通常使用的为LUC(荧光素酶),但也可以使用其他报告基因。

然而传统的针对单一靶点的研究方法已经难以适应一些多基因疾病和病毒等相关药物的研究。而基于细胞水平的高内涵筛选(high content screening, HCS)技术实现了对化合物多靶点多参数的同时检测,从疾病相关基因调控通路和网络水平上研究药物的作用机制、代谢途径和潜在毒性等,也使在细胞水平评价活性化合物的成成为可能。从筛选载体上看,HCS和HTS并没有的区别,它的检测体积并未因检测指标增加而增高,操作步骤同样简单可行、可自动化。故HCS在新药研发中发挥越来越重要的作用。高通量筛选技术的应用。

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正如之前提到,在高通量筛选中Assay的检出方法有很多,用于衡量酶活性多的当属于荧光检出法和吸光度检出法。这两种方法都能非常便捷的与高通量进行匹配。但是这两种检出方法也有不适用的场景,比如吸光度检出法,在终点法测定(endpointassay)时,如果化合物库的吸收低于~410nm,实验的背景吸收会引入假阳性(false-positive)和假阴性(false-negative)结果。虽然假阳性结果可以通过动力学Assay或者验证Assay来解决,但是由于微量定量板有位于340~410nm的强吸收,所以仍旧会导致Z因子降低,直接结果就是较弱活性的苗头化合物将很难被筛选出来。而对于荧光检出法而言,自发荧光化合物库或者具有光敏特性的化合物库同样会遇到假阳性和假阴性结果。在某种程度上,选择合适的检出方法可以减少甚至避免上述问题,比如使用更长波段的光源,对于荧光检出来说,>500nm会是比较好的选择。什么叫高通量筛选生化。云南霉菌高通量筛选

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根据计算原理,虚拟药物筛选分为基于小分子结构的筛选和基于药物作用机理的筛选两类,前者通过对已知具有相同作用机理的化合物进行定量构效关系研究,绘制出药物的药效团模型,依照模型对化合物数据库进行搜索,这种筛选技术本质上是一种数据库搜索技术;后者主要应用分子对接技术,实施这种筛选需要获知药物作用靶标的分子结构,通过分子模拟手段计算化合物库中的小分子与靶标结合的能力,预测候选化合物的生理活性。 建立合理的药效团模型、准确测定或预测靶标蛋白质的分子结构、精确和快速地计算候选化合物与靶标相互作用的自由能变化是进行虚拟药物筛选的关键,也是限制虚拟筛选准确性的瓶颈。虽然虚拟筛选的准确性有待提高,但是其快速廉价的特点使之成为发展为迅速的药物筛选技术之一。云南霉菌高通量筛选

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