宁波细胞荧光定量PCR方案
Real-time PCR与普通PCR的实验目的不同,所以对引物的设计要求也不同。普通PCR的实验目的只是为了获得目的基因产物,允许有非特异扩增,只要目标条带清晰明亮,就可以通过切胶回收的方法回收目标条带,之后进行后续的克隆、测序。但Real-time PCR的目的是为了让目的基因按照理论值或是按照接近理论值进行扩增,只有这样的扩增后续由Ct值推算出的起始量模板量才准确,基于此,Real-time PCR对非特异性扩增和引物二聚体的存在有较严格的要求。实时荧光定量PCR以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。宁波细胞荧光定量PCR方案
Real-time PCR实验注意事项-防止RNA酶污染的措施:1.所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6hr或更长时间。2.塑料器皿可用0.1%DEPC水浸泡或用氯仿冲洗(注意:有机玻璃器具因可被氯仿腐蚀,故不能使用)。3.有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3%H2O2室温10min,然后用0.1%DEPC水冲洗,晾干。4.配制的溶液应尽可能的用0.1%DEPC,在37℃处理12hr以上。然后用高压灭菌除去残留的DEPC。不能高压灭菌的试剂,应当用DEPC处理过的无菌双蒸水配制,然后经0.22μm滤膜过滤除菌。5.操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中手套要勤换。6.设置RNA操作专业使用实验室,所有器械等应为专业使用。深圳骨头数字PCR服务像所有酶一样,DNA聚合酶也容易出错,这反过来会导致产生的PCR片段发生突变。
内标在传统定量中的作用,由于传统定量方法都是终点检测,即PCR到达平台期后进行检测,而PCR经过对数期扩增到达平台期时,检测重现性极差。同一个模板在96孔PCR仪上做96次重复实验,所得结果有很大差异,因此无法直接从终点产物量推算出起始模板量。加入内标后,可部分消除终产物定量所造成的不准确性。但即使如此,传统的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。内标对定量PCR的影响,若在待测样品中加入已知起始拷贝数的内标,则PCR反应变为双重PCR,双重PCR反应中存在两种模板之间的干扰和竞争,尤其当两种模板的起始拷贝数相差比较大时,这种竞争会表现得更为明显。但由于待测样品的起始拷贝数是未知的,所以无法加入合适数量的已知模板作为内标。也正是这个原因,传统定量方法虽然加入内标,但仍然只是一种半定量的方法。
Real-time PCR:实时荧光定量PCR是目前确定样品中DNA(或cDNA)拷贝数较敏感、较准确的方法。如果用于RNA检测,这被称为逆转录实时PCR即(Real-timeRT-PCR)是实时PCR法,它是指对DNA或经过反转入(RT-PCR)的RNA通过聚合酶链式反应并实时监测DNA的放大过程,在扩增的指数增长期就测量扩增产物,因为扩增指数增长期测量值与特异DNA(RNA)起始量存在相关性,从而实现定量检测。Real-time PCR的基本目标是精确测量和鉴别非常微量的特异性核酸,从而可通过监测CT值而实现对原始目标基因的含量定量。实时荧光定量PCR法较大的优点是克服了终点PCR法进入平台期或叫饱和期后定量的较大误差,实现DNA/RNA的精确定量。该技术不单单实现了对DNA/RNA模板的定量,而且具有灵敏度和特异性高、能实现多重反应、自动化程度高、无污染、实时和准确等特点,该技术在医学临床检验及临床医学研究方面有着重要的意义。Real-time PCR探针法普遍用于人类传染病的诊断和病原定量。
Real-time PCR链式反应的特点:灵敏度高:PCR产物的生成量是以指数方式增加的,能将皮克(pg=10-12)量级的起始待测模板扩增到微克(μg=-6)水平。能从100万个细胞中检出一个靶细胞;在病毒的检测中,PCR的灵敏度可达3个RFU(空斑形成单位);在细菌学中很小检出率为3个细菌。简便、快速:PCR反应用耐高温的TaqDNA聚合酶,一次性地将反应液加好后,即在DNA扩增液和水浴锅上进行变性-退火-延伸反应,一般在2~4小时完成扩增反应。扩增产物一般用电泳分析,不一定要用同位素,无放射性污染、易推广。纯度要求低:不需要分离病毒或细菌及培养细胞,DNA粗制品及RNA均可作为扩增模板。可直接用临床标本如血液、体腔液、洗嗽液、毛发、细胞、活组织等DNA扩增检测。武汉微量Real-time PCR供应商聚合酶链反应的试剂应分配到一次性的等分试样中。实时荧光定量PCR法较大的优点是克服了终点PCR法进入平台期或叫饱和期后定量的较大误差。广州细胞PCR检测技术原理及步骤
Real-time PCR技术即实时萤光定量PCR避免了传统PCR以终产物监测定量产生的偏差。宁波细胞荧光定量PCR方案
Real-time PCR的染料法和探针法的选择:进行mRNA表达量的测定,采用染料法是比较经济实惠的;染料法可以通过比较熔解曲线的熔解峰位置得到产物特异性的情况;目的基因和内参基因分管检测,染料法可以选用Realtime染料PCRPreMIX,探针法主要应用于病毒RNA的检测;以及单位点突变(SNP);多基因的合并检测,探针法还可用于同一个反应中同时检测目的基因和内参基因的情况;而染料法则必须分管检测。Real-time PCR:实时荧光定量PCR技术(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction简称Real-time PCR)是在定性PCR技术基础上发展起来的核酸定量技术。实时荧光定量在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,使每一个循环变得“可见”,之后通过Ct值和标准曲线对样品中的DNA(orcDNA)的起始浓度进行定量的方法。宁波细胞荧光定量PCR方案
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