北京Protein AG免疫沉淀磁珠现货
时间：2024年07月04日
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ChIP（染色质免疫沉淀）实验是一种强大的技术，用于研究蛋白质与DNA之间的相互作用，尤其是在转录调控、DNA修复、复制以及表观遗传学领域。然而，像所有实验技术一样，ChIP实验也有其优点和缺点。
ChIP实验的优点：
1. 体内反应的反映：ChIP提供了一种在体内研究蛋白质与DNA相互作用的方法，能够真实、完整地反映结合在DNA序列上的靶蛋白的调控信息。
2. 全基因组覆盖：ChIP技术可以覆盖整个基因组，提供关于蛋白质-DNA相互作用的视图。
3. 适用于多种蛋白质：ChIP可以用来研究组蛋白修饰、转录因子以及其他DNA结合蛋白。
ChIP实验的缺点：
1. 实验步骤繁琐。
2. 需要大量起始材料：ChIP实验通常需要大量的细胞或组织作为起始材料。
3. 交联的影响：使用交联剂可能会改变蛋白质的结构，从而影响抗体的识别和蛋白质-DNA的相互作用。
4. 染色质碎裂的分辨率：染色质碎裂的效率和分辨率直接影响ChIP的准确性，需要优化以获得结果。
5. 抗体质量：抗体的质量对实验结果至关重要，但高质量、特异性强的抗体可能难以获得或成本较高。
免疫沉淀技术IP的实验设计。北京Protein AG免疫沉淀磁珠现货
ChIP实验的基本步骤包括：
1. 交联（Crosslinking）：细胞被甲醛等交联剂处理，使得蛋白质和DNA之间的相互作用被固定，形成稳定的蛋白质-DNA复合物。
2. 细胞裂解：裂解细胞，释放染色质，同时保持蛋白质-DNA复合物的完整性。
3. 超声或酶解：通过超声或酶解将染色质切割成较小的片段，以便于后续步骤中的免疫沉淀。
4. 免疫沉淀（Immunoprecipitation）：加入针对特定组蛋白修饰或转录因子的抗体，这些抗体会特异性地结合到目标蛋白质上。
5. 捕获复合物：使用蛋白A或蛋白G结合的珠子捕获抗体-蛋白质-DNA复合物。
6. 洗涤：洗涤珠子以去除未特异性结合的蛋白质和DNA片段。
7. 逆转录交联：将捕获的复合物从珠子上洗脱，并进行逆转录交联，使固定的蛋白质-DNA复合物分离。
8. DNA纯化：纯化从免疫沉淀中得到的DNA片段。
9. 分析：通过qPCR、芯片分析（ChIP-chip）或高通量测序（ChIP-seq）等方法分析沉淀的DNA片段，以确定特定蛋白质在基因组上的结合位点。
杭州ChIP免疫沉淀实验原理免疫沉淀IP技术选琼脂糖珠还是磁珠？
免疫沉淀技术（Immunoprecipitation，简称IP）是一种生物化学方法，它利用特异性抗体对抗原进行亲和纯化。在含有目的抗原的细胞裂解液中加入特定的抗体以及Protein A/G-Beads（预先将Protein A/G固定结合在磁珠上），根据抗原与抗体、Protein A/G与抗体的Fc的特异性，形成“抗原-抗体-Protein A/G-Beads”复合物，清洗离心后去除溶液中未结合的杂蛋白，检测是否存在目的蛋白。
免疫沉淀技术常用于从细胞或组织裂解物中分离用于免疫印迹检测或其他检测技术的蛋白和其他生物分子。它的目标是分离足够用于Western Blot或其他检测方法检测的蛋白质。
免疫沉淀技术RIP（RNA Immunoprecipitation，RNA免疫沉淀）的实验方法基于以下几个关键步骤：
1. 细胞裂解：首先，细胞或组织样本被裂解，以释放细胞内的蛋白质和RNA复合物。
2.抗体特异性结合：裂解后的样本中加入针对特定RNA结合蛋白的抗体。这些抗体能够特异性地识别并结合到目标蛋白。
3. 免疫复合物形成：抗体与目标蛋白结合后，形成抗体-蛋白质-RNA复合物。
4. 亲和介质捕获：使用蛋白A或蛋白G结合的珠子（如琼脂糖或磁性珠子）来捕获这些抗体-蛋白质-RNA复合物。蛋白A或蛋白G能够与抗体的Fc部分结合，从而拉下与之结合的复合物。
5. 洗涤：捕获的复合物被洗涤以去除未特异性结合的蛋白质和RNA。
6. RNA分离和分析：从珠子上洗脱或消化复合物，分离出RNA，并进行进一步的分析，如qPCR、Northern blot或高通量测序（RNA-Seq）。
免疫沉淀RIP抗体的选择？
真核生物的基因组 DNA 以染色质（Chromatin）的形式存在。因此，研究蛋白质与 DNA 在染色质环境中的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径，而染色质免疫共沉淀（Chromatinimmunoprecipitation，ChIP）技术是目前公认的研究此相互作用的选择，是真核生物基因表达机制研究中不可或缺的技术之一。
它的基本原理是在活细胞状态下，固定蛋白质-DNA（染色质）复合物，并将其切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法（抗体亲和）沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的 DNA，通过对目的片段的纯化与后期检测，从而获得蛋白质与 DNA 相互作用的信息。
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Co-IP（免疫共沉淀）技术主要用于研究蛋白质之间的相互作用，其实验设计如下：
1. 样品准备：Co-IP实验通常有两种，一种是内源性蛋白相互作用验证，一种是非内源性蛋白相互作用验证。内源性相互作用通过质粒共转染的方式将两种蛋白转染至同一细胞内表达；非内源性相互作用则是将含有靶蛋白的组织进行预处理及细胞裂解获得细胞裂解液。
2. 沉淀诱饵蛋白：利用磁珠偶联抗体沉淀诱饵蛋白。在样品中加入磁珠偶联抗体，抗体会与诱饵蛋白结合，利用磁铁将磁珠拉下，同时诱饵蛋白会一起被沉淀出来。
3. SDS-PAGE及WB检测：得到沉淀后，需要验证沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE将蛋白复合物分离，随后利用WB检测是否存在靶蛋白。
4. 实验对照设置：为了避免“假阳性”，需要设置正确的对照，包括阴性对照和阳性对照（Input组）。Input组为直接利用抗体对细胞裂解液进行WB检测，验证细胞裂解液中存在蛋白。
5. 结果真实性：确保共沉淀的蛋白是由所加入的抗体沉淀得到的，而并非外源非特异蛋白。使用单克隆抗体有助于避免污染的发生。
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