FabRICATOR ZIdeS蛋白酶蛋白组学

时间:2024年09月06日 来源:

Genovis的FabDELLO在铰链上方的单个位点消化人IgG1,并在两小时内生成均质的Fab和Fc片段(Genovis的IdeS在铰链区下方的单个位点进行消化)。生成的片段可用于结晶和高阶结构(HOS)的NMR研究、结合研究等。突变的铰链区域是zhiliao性候选抗体的常见修饰,以降低效应器功能。这些突变可能会影响具有高底物特异性的酶的抗体消化效率。例如,高度特异性的FabRICATOR(IdeS)消化效率对含有常见LALA突变的抗体产生负面影响。FabDELLO作用于人IgG1铰链上方的单个暴露赖氨酸残基,能够对具有突变铰链区域的抗体进行流行的中级LC-MS分析。例如,用FabDELLO消化市售的IgG1risankizumab,在下铰链区域具有LALA突变,并通过反相LC-MS进行分析。消化产生均匀的Fab和Fc片段。用20mMDTT还原片段,用于中级LC-MS分析,发现产生了均相的Fc/2、轻链(LC)和Fd片段。用FabDELLO消化后观察到的定义峰显示出均匀的片段生成和酶的稳健性能。IdeS蛋白酶普遍适用于常见类型抗体,由于分析的简单性,中级方法非常适合自动化和高通量的工作流程。FabRICATOR ZIdeS蛋白酶蛋白组学

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当你应用像肽图这样的方法时,你可以从Genovis中级方法中获得的信息量就没有那么多了。一个主要的区别是你不能像在肽水平上那样将修改定位到单个氨基酸。然而,中级分析比肽图谱具有快速和简单的巨大优势,因为需要分析的色谱峰要少得多,数据处理任务要简单得多。此外,在中级实验中,手工实验步骤要少得多,FabALACTICA(IdeS)酶切消化方法不需要针对不同的人体IgG1进行优化。一旦在氨基酸水平上进行了PTM表征,我们非常认为中级表征肽图的一种补充方法,可以在更常规的基础上应用。中级分析更适用于高通量或监测类型的方法,并可用于支持肽图分析。广东GlySERIASIdeS蛋白酶蛋白组学LC-MS中级分析用于快速表征mAb和其他基于IgG的生物制药。

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与IdeS不同,Genovis的IgMBRAZOR是一种独特的IgM特异性蛋白酶,可在重链中CH2结构域下方的一个特定位点消化人IgM,产生均质的F(ab')2和Fc片段。该酶能够对复杂和高分子量的人IgM进行中级分析,从而促进疫苗、zhiliao和诊断等过程中的IgM表征。独特-可实现IgM的中级表征和质量控制;快速–在30分钟内生成均匀的F(ab')2和Fc片段;高度特异性–人IgM重链中的一个消化位点。IgMBRAZOR是一种独特的IgM特异性酶,可在重链中CH2结构域下方的一个特定位点消化人IgM,产生F(ab')2和Fc片段。消化在30分钟内完成,并且由于酶的特异性,如果孵育时间延长,则不存在过度消化的风险。该酶在pH值为5.5至9.0时具有活性,不需要还原条件或辅助因子即可发挥活性。良好的活性是在37°C下,但也可以在室温下使用增加孵育时间进行消化。IgMBRAZOR在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为38kDa。

Genovis除了提供IdeS酶以外,还提供很多种特异性蛋白酶,如半胱氨酸蛋白酶 FabALACTICA (IgdE)。IgdE 在铰链正上方的一个特定位点消化人 IgG1,产生完整的 Fab 和 Fc 片段的均质池。它在pH值和盐浓度范围内具有活性,不需要任何还原剂或辅助因子。因此,与许多其他常用的蛋白酶相比,FabALACTICA不需要任何优化来避免过度消化。这使得FabALACTICA成为一种有吸引力的酶,例如在还原和非还原条件下的LC-MS分析、抗体高阶结构(HOS)的结晶和NMR研究、双特异性或多特异性抗体的表征、单价结合研究和完整的Fc聚糖分析。获得完整Fab和Fc抗体片段,用于结晶和高阶结构 (HOS) 的 NMR 研究、结合研究等。

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蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。Genovis的FabDELLO作用于人 IgG1 铰链上方的单个暴露赖氨酸残基。FabRICATOR ZIdeS蛋白酶蛋白组学

Genovis的FabULOUS (SpeB) 是一种半胱氨酸蛋白酶。FabRICATOR ZIdeS蛋白酶蛋白组学

与IdeS不同,Genovis的GlySERIAS是一种独特的酶,可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白连接子,例如Gly4Ser和GlyxSery(GS)以及聚甘氨酸(G)接头。该酶能够分离多功能融合蛋白的各个结构域,以促进表征并增加对这些分子的理解。融合蛋白的中级分析既可以降低整体样品的复杂性,又可以对翻译后修饰进行结构域特异性鉴定和监测。为了改善连接子的去除,Genovis建议使用GlySERIASImmobilized。对于连接子表征,我们推荐GlySERIAS冻干。具有柔性接头的独特酶消化融合蛋白;中级方法可降低融合蛋白表征的复杂性;复杂融合蛋白的可靠且可重复的消化。Genovis的GlySERIAS酶切由甘氨酸或甘氨酸和丝氨酸残基的重复序列组成的柔性连接子。该酶在天然反应条件下具有活性,能够对复杂的融合蛋白进行中级表征。连接子区域同时在多个位点被消化,导致先前连接的组分分离。活性发生在pH7.6下,孵育时间可以根据所需的产物而变化。GlySERIAS是从噬菌体K克隆而来的,在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为18kDa。FabRICATOR ZIdeS蛋白酶蛋白组学

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