微球菌核酸酶
EndoS糖苷内切酶S（Endo-S）的特异性主要体现在其对糖蛋白的糖链结构的识别和切割能力上。以下是Endo-S的一些关键特异性特点：1.**糖链识别**：Endo-S能够特异性识别糖链结构中的某些特定序列或结构，尤其是N-连接糖链的壳二糖重要结构。2.**切割位点**：Endo-S在糖链的特定位点进行切割，通常是在N-乙酰葡糖胺（GlcNAc）和天冬酰胺之间的β-N-糖苷键。3.**不影响抗原性**：Endo-S的切割位点选择性高，不会破坏糖蛋白的抗原决定簇，因此在某些应用中可以保持糖蛋白的免疫原性。4.**应用多样性**：Endo-S可以用于多种糖蛋白的去糖基化，包括抗体和其他具有N-连接糖链的蛋白质。5.**研究和药物开发**：在研究糖蛋白的结构和功能时，Endo-S提供了一种工具来研究糖链对蛋白质性质的影响。此外，在药物开发中，Endo-S用于制备糖链定点ADC化合物，通过精确控制药物与抗体的连接点，提高药物的疗效和减少副作用。6.**兼容性**：Endo-S对多样化的LacNAc修饰显示出良好的兼容性，可以接受不同生物正交基团、荧光基团等衍生物作为底物，实现抗体糖基化修饰。7.**高效性**：Endo-S在催化糖链转移或切割反应中表现出高效性，有助于实现高效获得功能修饰的糖工程抗体。多泛素化的靶蛋白被26S蛋白酶体识别。26S蛋白酶体由一个20S颗粒和两个19S调节颗粒组成。微球菌核酸酶
EndoS糖苷内切酶在ADCs制备中的具体应用步骤，根据上海药物研究所的研究，可以概括为以下几个关键环节：1.**筛选糖底物和糖苷内切酶**：研究人员筛选了一系列糖底物和糖苷内切酶，发现Endo-S2酶能够将二糖底物LacNAc转移至去糖抗体N297位糖基化位点，且LacNAc半乳糖6号位唾液酸化修饰不影响Endo-S2的转糖基化活性。2.**抗体糖基化改造**：利用Endo-S2和LacNAc的组合，直接实现野生型抗体的糖基化改造。Endo-S2对多样化LacNAc修饰的兼容性，可以高效获得功能修饰的糖工程抗体。3.**设计合成药物-连接子复合物**：研究人员设计并合成了LacNAc-linker-drug复合物结构，这是实现定点ADC化合物“一步”组装的关键。4.**“一步”定点偶联**：通过Endo-S2的催化作用，将小分子细胞毒药物通过特定的糖链结构直接定点连接到抗体的糖基化位点，简化了ADCs的制备流程。5.**评价和测试**：对获得的糖链定点ADC化合物进行结构均一性、亲水性、体外稳定性及体外活性的测试。测试结果显示，这些化合物具有非常好的结构均一性（DAR=2）、亲水性和体外稳定性，并且在体外具有强大的瘤抑制活性。
在基因编辑中，除了NLS-Cas9-EGFPNuclease，还有多种技术可以提高编辑的特异性，这些技术包括：1.**高保真Cas9变体**：通过工程化改造Cas9蛋白，例如使用SpCas9-HF1或eSpCas9等高保真变体，可以减少脱靶效应，提高特异性。2.**碱基编辑器（BaseEditors）**：这类编辑器可以在不产生DNA双链断裂的情况下直接在特定位置进行单个碱基的转换，从而减少非目标编辑。3.**引导编辑器（PrimeEditors）**：由哈佛大学刘如谦教授团队开发的引导编辑器可以在不依赖DNA双链断裂和同源定向修复的情况下，实现精细的基因组编辑。4.**CRISPRi和CRISPRa**：这两种技术分别用于抑制或激起特定基因的表达，而不切割DNA，从而减少了脱靶风险。5.**新型CRISPR系统**：例如CRISPR/Cas12j和CRISPR/CasΦ，这些系统可能具有不同的PAM序列要求和更高的特异性。6.**AI辅助设计**：利用人工智能预测和优化sgRNA的设计，以减少脱靶效应。7.**优化递送系统**：改进CRISPR组分的递送方法，例如使用核糖核的蛋白（RNP）复合物，可以提高编辑效率和特异性。8.转座子编辑系统：利用转座子进行基因组编辑，可以在不依赖DNA双链断裂的情况下实现大片段DNA序列的插入。
重组的化脓性链球菌Cas9蛋白（SpCas9）是一种用于基因组编辑的核酸酶。它是CRISPR-Cas系统的一部分，该系统是一种细菌和古菌的适应性免疫防御机制，能够识别并切割入侵的外源核酸。Cas9蛋白在CRISPR系统中起到关键作用，它能够识别特定的原间隔子相邻基序（PAM），在引导RNA（gRNA）的引导下与目标DNA结合并进行切割。SpCas9蛋白由1053个氨基酸组成，相对较小的体积使其便于在体内递送，因此它在多种生物中都能进行有效的基因组编辑。为了提高SpCas9的表达量和溶解度，研究人员采用了多种策略，例如使用GB1促溶标签和多重启动子策略，这些策略可以显著提高蛋白的产量和活性，同时保持其功能活性不受影响。在基因编辑过程中，SpCas9与gRNA形成稳定的核糖核的蛋白（RNP）复合物，通过gRNA与基因组DNA的序列匹配来识别目标位点，并在距离NGGPAM序列3个碱基以内的位置切割DNA。为了增强SpCas9的基因组编辑效率，研究人员还开发了嵌合融合蛋白，例如与5’至3’核酸外切酶重组J(RecJ)或GFP融合的SpyCas9蛋白，这些嵌合蛋白可以显著提高靶向基因编辑效率，同时保持较低的脱靶效应。
PNGaseF（肽-N-糖苷酶F）是一种普遍使用的酶，它可以从N-连接糖蛋白中去除几乎所有类型的N-连接糖链。其活性和稳定性可能会在不同的pH条件下发生变化。根据NEB（NewEnglandBiolabs）提供的PNGaseF产品信息，PNGaseF的好的活性和稳定性pH为7.5。在pH7.5时，PNGaseF的活性可以达到100%。然而，酶在不同温度下的活性表现也有所不同：在37°C时活性为100%，在30°C时也保持100%，而在23°C时活性下降到65%，17°C时为40%，在3°C时几乎无活性。这表明PNGaseF的活性随温度降低而下降，尽管pH值对酶活性有重要影响，但温度也同样是一个重要因素。此外，PNGaseF的活性会受到SDS的抑制，因此在变性条件下进行酶切时，反应混合物中必须包含NP-40，以1:1的比例存在，以抵消SDS的抑制作用。对于非变性条件下的酶切，可能需要更多的酶和更长的孵育时间。在实验操作中，为了确保PNGaseF的好的活性，建议按照制造商提供的推荐缓冲液和条件进行实验。如果需要在不同的pH条件下使用PNGaseF，可能需要通过实验优化来确定好的条件。
Cas9 NLS在Cas9蛋白的N端和C端都含有SV40 T抗原的核定位序列，这使得Cas9与gRNA形成的复合物。微球菌核酸酶
酵母重组表达的PNGaseF（N-糖苷酶F）是一种用于蛋白质去糖基化实验的酰胺水解酶，具有以下特点以确保实验中的活性和稳定性：1.**高效性**：具有高比活性，例如750000U/mL，这有助于快速高效地进行去糖基化反应。2.**稳定性**：在含有50%甘油的储存缓冲液中，比较好的活性和稳定性可维持长达24个月。3.**使用条件**：可以在原生或变性条件下使用，对于变性条件下的去糖基化，建议添加NP-40以解除SDS的抑制作用。4.**储存条件**：建议在-15~-25℃保存，有效期1年。5.**酶活定义**：1个酶活力单位指在10μL的反应体系中，37℃条件下1小时从10μg变性RNaseB中除去超过95%的碳水化合物所需要的酶量。6.**操作简便**：提供了使用说明，包括变性和非变性条件下的蛋白质去糖基化步骤。7.**His标签**：产品带有His标签，便于在实验中进行纯化和检测。8.**纯度**：纯度达到95%以上，通过SDS-PAGE和完整ESI-MS进行确定。9.**快速反应**：有些产品如FastPNGaseF，可以在数分钟内完成彻底且无偏好性地去糖基化。10.**注意事项**：产品供科研使用，操作时应穿戴适当的实验室防护装备。遵循这些指导原则和产品说明，可以确保PNGaseF在实验中的活性和稳定性，从而获得可靠的去糖基化结果。微球菌核酸酶