山西IdeS蛋白酶蛋白组学

时间:2024年05月02日 来源:

在Genovis,我们的策略是帮助客户进行中级(或亚基)分析,这是我们的工作,特别是我们的蛋白质酶切产品。完整质量和肽图谱是蛋白质表征的常用方法,我们发现,与简单但信息有限的完整质量和高度复杂但信息丰富的肽图谱相比,中级方法具有优势。通过执行中级描述,您可以生成从完整的质量实验中获得的所有信息,具有额外的优势。在对抗体进行完整质量分析时,很难明确地识别某些修饰。质谱仪器正在改进,可以更有效地分析更大的分子,但通过使用我们的SmartEnzymes,如IdeS,可以将抗体分解成更小的片段,这提高了这些实验可以执行的分辨率,因此,增加了鉴定修饰的信心。此外,你不仅能够更好地识别修改,而且你能够将它们定位到蛋白质上的单个结构域,这是你在完整水平上无法做到的。小鼠 IgG1 在铰链下方具有不同的序列,不被 FabRICATOR Z 消化。山西IdeS蛋白酶蛋白组学

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与IdeS不同,Genovis的GingisREX(RgpB)是一种精氨酸特异性蛋白酶,可消化精氨酸残基的C末端蛋白质,包括难以与其他酶消化的Arg-Pro键。该酶可用于肽图分析、从头肽测序和翻译后修饰分析。精氨酸残基的特异性C-末端消化;在其他困难的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化;产生更长的肽-提高序列覆盖率。GingisREX是一种半胱氨酸蛋白酶,可特异性地消化肽键C末端到精氨酸残基,包括与脯氨酸相连的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。与胰蛋白酶消化相比,可生成更长的肽,胰蛋白酶消化可以通过高分辨率质谱进行分离和鉴定。这为自下而上方法的样品制备提供了更多选择,以实现替代的酶解曲线和更高的序列覆盖率。GingisREX在赖氨酸上没有活性,通常使用Arg-C观察到。该酶在5.0-9.0的宽pH值范围内具有活性,它需要半胱氨酸并被盐酸胍抑制。该酶是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。陕西IdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶Genovis的FabRICATOR (IdeS) 酶已成为一种接受的快速表征单克隆抗体 (mAb) 的分析工具。

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与IdeS不同,Genovis的IgMBRAZOR是一种独特的IgM特异性蛋白酶,可在重链中CH2结构域下方的一个特定位点消化人IgM,产生均质的F(ab')2和Fc片段。该酶能够对复杂和高分子量的人IgM进行中级分析,从而促进疫苗、zhiliao和诊断等过程中的IgM表征。独特-可实现IgM的中级表征和质量控制;快速–在30分钟内生成均匀的F(ab')2和Fc片段;高度特异性–人IgM重链中的一个消化位点。IgMBRAZOR是一种独特的IgM特异性酶,可在重链中CH2结构域下方的一个特定位点消化人IgM,产生F(ab')2和Fc片段。消化在30分钟内完成,并且由于酶的特异性,如果孵育时间延长,则不存在过度消化的风险。该酶在pH值为5.5至9.0时具有活性,不需要还原条件或辅助因子即可发挥活性。良好的活性是在37°C下,但也可以在室温下使用增加孵育时间进行消化。IgMBRAZOR在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为38kDa。

Genovis的FabRICATOR MagIC自动样品制备可用于分析和监测不同的CQA。mAb在生产或储存过程中的氧化就是这样一种CQA,可能会影响zhiliao产品的质量。为了展示FabRICATOR MagIC如何解决这个问题,对6种mAb的混合物进行强制降解(室温下3个月),并通过反相LC-MS进行分析。当在完整水平上分析mAb时,可以检测到mAb5丰度的显着差异,同时出现许多新的峰。然而,无法获得可靠的质量数据。使用FabRICATOR MagIC,mAb5变化的来源在Fab区域内。随后还原为 Fc/2、LC 和 Fd' 片段,可以识别差异是由于 mAb5 Fd' 片段上的色氨酸氧化,通过形成氧代内酯 (+14 Da) 和二氧代内酯 (+30 Da) 以及 mAb5 LC (-18 Da) 的琥珀酰亚胺化来揭示。此外,还可检测到mAb3轻链的异构化。该示例说明了FabRICATOR MagIC在mAb中级分析中的强大功能,它创建的片段足够小,可以精确定位特定的修饰,而无需耗时耗费资源的肽图分析,所有这些都以相对较少的手动操作时间快速完成。Genovis的FabRICATOR MagIC适用于自动化平台。

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与IdeS不同,Genovis的GingisKHAN(Kgp)是一种半胱氨酸蛋白酶,可在铰链上方的单个位点(KSCDK/THTCPPC)消化人IgG1,产生完整且均质的Fab和Fc片段。GingisKHAN是一种赖氨酸特异性蛋白酶。单一的消化位点是人IgG1三维结构的结果,使这种赖氨酸暴露于酶中。如果去除N-聚糖,则Fc上暴露的赖氨酸处可能会出现额外的消化位点。GingisKHAN需要温和的还原条件才能具有活性,并且在37°C和pH8下获得活性。还原剂(2mM半胱氨酸)与酶一起提供。GingisKHAN是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。该酶用于使用LC-MS表征基于抗体的生物zhiliao药物,研究Fc聚糖分析、双特异性抗体、亲和力和亲和力效应,并鉴定翻译后修饰。用 Genovis的GlySERIAS Immobilized消化Romiplostim,产生均质的 Fc/2。江苏GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白组学

FabRICATOR Magic磁珠化IdeS酶切的自动抗体亚基分析可减少操作人员的时间和样品处理错误的风险。山西IdeS蛋白酶蛋白组学

Genovis的FabRICATOR是一种半胱氨酸蛋白酶,它对许多不同的物种和IgG亚类都有活性,包括人IgG亚类1-4以及猴子、兔子、大鼠和绵羊IgG的一些亚类。FabRICATOR在铰链下方的单个位点进行消化,生成F(ab’)2和Fc/2子基,可以进一步还原生成Fd’,轻链和F/2子基是必需的。FabRICATOR(IdeS)通过蛋白-蛋白相互作用与目标抗体工作,这说明了它的高特异性。事实上,它在单个位点消化意味着使用FabRICATOR时没有过度消化的风险,其高特异性也意味着相同的消化方案可以作为平台方法应用于许多不同的抗体。FabRICATOR(IdeS)不需要还原条件来获得良好活性,也不需要任何额外的辅助因子,它将在不同生理缓冲中发挥作用。这意味着按照下面的铰链消解,您将生成F(ab’)2和Fc/2片段用于分析或其他应用。山西IdeS蛋白酶蛋白组学

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