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rRNA是细胞内的一种基本RNA,与r蛋白一起构成蛋白质合成的场所—核糖体。随着rRNA基因序列越来越了解,其在生物研究中也的得到了更普遍的应用,主要表现在生物进化研究和分子流行病研究。(1)rRNA在生物进化上的研究。rRNA具有高度保守性,且普遍存在于各种生物中,rRNA提供了足够的序列信息。现在还可用于在细菌分类、细菌鉴定等方面。(2)rRNA在分子流行病上的研究。目前,人们已经把rRNA在进化上的普遍差异应用到了流行病学研究方面,通过对不同细菌进行鉴定分类,从而明确病因,追踪传染源,进一步控制及预防疾病。所提取的RNA完整性好、纯度高,可用于分子生物学后实验。厦门正规RNA提取试剂报价
尽管现有的RNA提取试剂都用压制RNase的成分,但提取的材料仍需谨慎处理。提取的材料的新鲜度是获取完整RNA的关键,但是由于种种原因无法立即从新鲜材料中提取RNA时,使用Takara公司的样品保护剂SampleProtectorforRNA/DNA可以免去使用液氮或超低温冰箱的不便,同时也可以有效解决组织、细胞样品的短时间保存及运输问题。此外,如果将不同时期收集的样品都预先存放于本试剂中,可以做到立即终止并固定RNA表达的时序变化,减少实验组间的误差,RNA提取试剂的选择:首先,要确定材料的可用性。郑州正规RNA提取试剂进货价这种情况下,可以在裂解缓冲液中立即进行溶解。
RNA组成结构:RNA和DNA一样,也是由各种核苷酸通过3′,5′-磷酸二酯键连接构成的多核苷酸链,但与DNA有一系列差异。1.在化学组成方面,RNA含核糖而不含脱氧核糖。含尿嘧啶而不含胸腺密啶。例外的是,每个tNA分子含有一个胸腺嘧啶,这是在RNA链合成后由尿嘧啶甲基化生的,此外,前面已提到,少数DNA含有少量核糖,但这些个别的例外并不能以此否定两类核酸组成上的差异。2.RNA一级结构的概念虽与DNA相同.但其基本结构单位是核糖核苷酸而不是脱氧核糖核苷酸。此外,部分RNA5′端或3′端有特殊的核苷酸序列,而且RNA一级结构中没有DNA那样复杂的顺序组织。3.绝大多数RNA为单链分子,单链可自身折迭形成发夹(hairpin)样结构而有局部双螺旋结构的特征,这是各种RAN空间结构的共同特征。RNA局部双螺旋结构中碱基互补配对规律是A对U和G对C。由于RNA分子内部不能较全形成碱基配对,故其碱基克分子比A不等于U,G不等于C,不存在DNA碱基比例的Chargaff规律。
RNA提取浓度不高或质量不佳原因及解决办法:1、得率过低:提取样本过低总量不足或者提取样本过多裂解不彻底;应当使用适当质量的组织或细胞进行提取,样本前处理一定要做好,裂解应充分。2、基因组残留:Trizol法提取时,分层后吸取上清时吸到中间层会带来严重的基因组污染;分层吸取时应当格外小心,不要吸取到中间层。如果是采用柱式法提取,可选择含有DNaseI的试剂盒进行提取,吸附在膜上的核酸直接用DNaseI进行消化,可极大限度的降低DNA残留。在裂解液上游加入酶裂解步骤(如蛋白酶 K、溶菌酶等)。
与DNA不同,RNA一般为单链长分子,不形成双螺旋结构,但是很多RNA也需要通过碱基配对原则形成一定的二级结构乃至三级结构来行使生物学功能。RNA的碱基配对规则基本和DNA相同,不过除了A-U、G-C配对外,G-U也可以配对。在细胞中,根据结构功能的不同,RNA主要分三类,即tRNA(转运RNA),rRNA(核糖体RNA),mRNA(信使RNA)。mRNA是合成蛋白质的模板,内容按照细胞核中的DNA所转录;tRNA是mRNA上碱基序列(即遗传密码子)的识别者和氨基酸的转运者;rRNA是组成核糖体的组分,是蛋白质合成的工作场所。RNA提取试剂TRIpure是基于世界上使用较普遍的异硫氰酸胍/酚法研制而成的总RNA抽提试剂。珠海正规RNA提取试剂供应商
在实际RNA提取中,有几个提取原则:保证RNA一级结构的完整性。厦门正规RNA提取试剂报价
昆虫RNA柱式提取试剂盒使用方法:将50~300mg昆虫组织放入10~15mL塑料离心管中,加入1mL溶液A,然后用匀浆器匀浆5~20秒。匀浆时会产生泡沫,但不影响提取效果。也可以使用液氮砚磨法破碎昆虫组织,砚磨完后加入1mL溶液A。注意:溶解溶液A沉淀。溶液A在4℃放置后可能会产生沉淀,使用前必须放在65℃水浴使沉淀彻底溶解并充分摇匀后再取用。将匀浆物或砚磨物转移至干净的1.5mL塑料离心管中(可以不必转移非液体的细胞碎片)。在离心管中加入0.3mL的溶液B和0.2mL自备氯仿,在振荡器上振荡30秒混匀,此时溶液呈均匀的乳浊状。振荡器振荡时必须使管底溶液震荡起来。室温12000rmp离心3~5分钟,两相间将有约5-10毫米厚的细胞破碎物。将上清液(约0.6mL)转移到另一干净的1.5mL塑料离心管中,下层有机相和中间层含有DNA、蛋白质和其他杂质,避免触及或吸取。较好留下100μL上清液不取。加入等体积的溶液C,充分颠倒混匀。厦门正规RNA提取试剂报价
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